Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 YMR090WYMR090W 684 nt11.68□□□□□ -0.54
HSP42Q12329 PHO4YFR034C 939 nt11.65□□□□□ -0.54
HSP42Q12329 INM2YDR287W 879 nt11.64□□□□□ -0.55
HSP42Q12329 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.64□□□□□ -0.55
HSP42Q12329 WHI5YOR083W 888 nt11.62□□□□□ -0.55
HSP42Q12329 YBL100CYBL100C 315 nt11.59□□□□□ -0.55
HSP42Q12329 SDH1YKL148C 1923 nt11.55□□□□□ -0.56
HSP42Q12329 TRM9YML014W 840 nt11.55□□□□□ -0.56
HSP42Q12329 PCH2YBR186W 1695 nt11.54□□□□□ -0.56
HSP42Q12329 YDL221WYDL221W 552 nt11.53□□□□□ -0.56
HSP42Q12329 UME6YDR207C 2511 nt11.52□□□□□ -0.56
HSP42Q12329 YDR095CYDR095C 411 nt11.52□□□□□ -0.57
HSP42Q12329 GUT2YIL155C 1950 nt11.51□□□□□ -0.57
HSP42Q12329 SEC11YIR022W 504 nt11.46□□□□□ -0.57
HSP42Q12329 FMP45YDL222C 930 nt11.45□□□□□ -0.58
HSP42Q12329 FUN26YAL022C 1554 nt11.45□□□□□ -0.58
HSP42Q12329 DSK2YMR276W 1122 nt11.41□□□□□ -0.58
HSP42Q12329 CAC2YML102W 1407 nt11.39□□□□□ -0.59
HSP42Q12329 IMP2'YIL154C 1041 nt11.37□□□□□ -0.59
HSP42Q12329 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.36□□□□□ -0.59
HSP42Q12329 SCC4YER147C 1875 nt11.36□□□□□ -0.59
HSP42Q12329 YPR011CYPR011C 981 nt11.35□□□□□ -0.59
HSP42Q12329 PTP1YDL230W 1008 nt11.33□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 YCH1YGR203W 447 nt11.33□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 CCT6YDR188W 1641 nt11.32□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 YLR236CYLR236C 324 nt11.31□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 PIB2YGL023C 1908 nt11.31□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 RPP2AYOL039W 321 nt11.29□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 ALF1YNL148C 765 nt11.28□□□□□ -0.6
HSP42Q12329 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.27□□□□□ -0.61
HSP42Q12329 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.27□□□□□ -0.61
HSP42Q12329 YJL152WYJL152W 360 nt11.27□□□□□ -0.61
HSP42Q12329 IRC15YPL017C 1500 nt11.23□□□□□ -0.61
HSP42Q12329 MRPL8YJL063C 717 nt11.22□□□□□ -0.61
HSP42Q12329 YSC84YHR016C 1407 nt11.18□□□□□ -0.62
HSP42Q12329 RTF1YGL244W 1677 nt11.18□□□□□ -0.62
HSP42Q12329 GIS3YLR094C 1509 nt11.18□□□□□ -0.62
HSP42Q12329 FRE6YLL051C 2139 nt11.15□□□□□ -0.62
HSP42Q12329 IDH1YNL037C 1083 nt11.14□□□□□ -0.63
HSP42Q12329 LPX1YOR084W 1164 nt11.14□□□□□ -0.63
HSP42Q12329 ADO1YJR105W 1023 nt11.12□□□□□ -0.63
HSP42Q12329 YHL050CYHL050C 2094 nt11.1□□□□□ -0.63
HSP42Q12329 YDR433WYDR433W 441 nt11.1□□□□□ -0.63
HSP42Q12329 ERV46YAL042W 1248 nt11.07□□□□□ -0.64
HSP42Q12329 SPP1YPL138C 1062 nt11.07□□□□□ -0.64
HSP42Q12329 BOP3YNL042W 1191 nt11.04□□□□□ -0.64
HSP42Q12329 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.03□□□□□ -0.64
HSP42Q12329 YEL076CYEL076C 651 nt11.03□□□□□ -0.64
HSP42Q12329 YLR464WYLR464W 651 nt11.03□□□□□ -0.64
HSP42Q12329 SIS1YNL007C 1059 nt11.01□□□□□ -0.65
HSP42Q12329 PTK1YKL198C 1989 nt11.01□□□□□ -0.65
HSP42Q12329 YKR040CYKR040C 504 nt10.99□□□□□ -0.65
HSP42Q12329 GBP2YCL011C 1284 nt10.99□□□□□ -0.65
HSP42Q12329 UBX6YJL048C 1191 nt10.97□□□□□ -0.65
HSP42Q12329 BOR1YNL275W 1731 nt10.97□□□□□ -0.65
HSP42Q12329 YJL225CYJL225C 5277 nt10.96□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 GFD2YCL036W 1701 nt10.95□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 RRT12YCR045C 1476 nt10.95□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 RTG1YOL067C 534 nt10.94□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 SSN3YPL042C 1668 nt10.94□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 TIR4YOR009W 1464 nt10.93□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 RTS2YOR077W 699 nt10.93□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 MXR2YCL033C 507 nt10.92□□□□□ -0.66
HSP42Q12329 ART5YGR068C 1761 nt10.9□□□□□ -0.67
HSP42Q12329 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.87□□□□□ -0.67
HSP42Q12329 YNL195CYNL195C 786 nt10.85□□□□□ -0.67
HSP42Q12329 HUA1YGR268C 597 nt10.84□□□□□ -0.67
HSP42Q12329 YMR057CYMR057C 372 nt10.83□□□□□ -0.68
HSP42Q12329 CUE1YMR264W 612 nt10.83□□□□□ -0.68
HSP42Q12329 TCD2YKL027W 1344 nt10.81□□□□□ -0.68
HSP42Q12329 PET9YBL030C 957 nt10.79□□□□□ -0.68
HSP42Q12329 YFL054CYFL054C 1941 nt10.76□□□□□ -0.69
HSP42Q12329 NCP1YHR042W 2076 nt10.75□□□□□ -0.69
HSP42Q12329 SPT8YLR055C 1809 nt10.73□□□□□ -0.69
HSP42Q12329 YIL100WYIL100W 354 nt10.71□□□□□ -0.69
HSP42Q12329 YDR094WYDR094W 336 nt10.7□□□□□ -0.7
HSP42Q12329 BSP1YPR171W 1731 nt10.7□□□□□ -0.7
HSP42Q12329 MCH5YOR306C 1566 nt10.69□□□□□ -0.7
HSP42Q12329 PTH1YHR189W 573 nt10.64□□□□□ -0.71
HSP42Q12329 YCL042WYCL042W 360 nt10.64□□□□□ -0.71
HSP42Q12329 FRD1YEL047C 1413 nt10.64□□□□□ -0.71
HSP42Q12329 DED1YOR204W 1815 nt10.6□□□□□ -0.71
HSP42Q12329 YKL030WYKL030W 606 nt10.59□□□□□ -0.71
HSP42Q12329 HSP60YLR259C 1719 nt10.58□□□□□ -0.72
HSP42Q12329 RRD1YIL153W 1182 nt10.58□□□□□ -0.72
HSP42Q12329 YLR235CYLR235C 399 nt10.58□□□□□ -0.72
HSP42Q12329 GID7YCL039W 2238 nt10.57□□□□□ -0.72
HSP42Q12329 ALG12YNR030W 1656 nt10.56□□□□□ -0.72
HSP42Q12329 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.54□□□□□ -0.72
HSP42Q12329 LCB1YMR296C 1677 nt10.49□□□□□ -0.73
HSP42Q12329 SWE1YJL187C 2460 nt10.48□□□□□ -0.73
HSP42Q12329 FMT1YBL013W 1206 nt10.48□□□□□ -0.73
HSP42Q12329 SOR2YDL246C 1074 nt10.46□□□□□ -0.73
HSP42Q12329 SOR1YJR159W 1074 nt10.46□□□□□ -0.73
HSP42Q12329 CWP1YKL096W 720 nt10.43□□□□□ -0.74
HSP42Q12329 GLK1YCL040W 1503 nt10.41□□□□□ -0.74
HSP42Q12329 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.4□□□□□ -0.74
HSP42Q12329 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.4□□□□□ -0.74
HSP42Q12329 FMP52YER004W 696 nt10.38□□□□□ -0.75
HSP42Q12329 ESBP6YNL125C 2022 nt10.37□□□□□ -0.75
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