Protein–RNA interactions for Protein: Q12262

MCM16, Inner kinetochore subunit MCM16, yeastyeast

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCM16Q12262 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.29□□□□□ -0.28
MCM16Q12262 GFD2YCL036W 1701 nt13.28□□□□□ -0.28
MCM16Q12262 ART5YGR068C 1761 nt13.27□□□□□ -0.28
MCM16Q12262 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.27□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 SHU1YHL006C 453 nt13.25□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.24□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 YGR021WYGR021W 873 nt13.22□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 HOM6YJR139C 1080 nt13.22□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 RTS2YOR077W 699 nt13.22□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 PCH2YBR186W 1695 nt13.21□□□□□ -0.29
MCM16Q12262 GUT2YIL155C 1950 nt13.18□□□□□ -0.3
MCM16Q12262 MNP1YGL068W 585 nt13.14□□□□□ -0.31
MCM16Q12262 SEC11YIR022W 504 nt13.14□□□□□ -0.31
MCM16Q12262 YSC84YHR016C 1407 nt13.12□□□□□ -0.31
MCM16Q12262 PET9YBL030C 957 nt13.1□□□□□ -0.31
MCM16Q12262 PAC11YDR488C 1602 nt13.09□□□□□ -0.31
MCM16Q12262 TIR4YOR009W 1464 nt13.09□□□□□ -0.31
MCM16Q12262 YHL050CYHL050C 2094 nt13.06□□□□□ -0.32
MCM16Q12262 PIB2YGL023C 1908 nt13.03□□□□□ -0.32
MCM16Q12262 RKM5YLR137W 1104 nt13.02□□□□□ -0.33
MCM16Q12262 CUE1YMR264W 612 nt13.02□□□□□ -0.33
MCM16Q12262 RRT12YCR045C 1476 nt13□□□□□ -0.33
MCM16Q12262 YMR057CYMR057C 372 nt12.98□□□□□ -0.33
MCM16Q12262 YCH1YGR203W 447 nt12.96□□□□□ -0.33
MCM16Q12262 FPS1YLL043W 2010 nt12.91□□□□□ -0.34
MCM16Q12262 NPL3YDR432W 1245 nt12.86□□□□□ -0.35
MCM16Q12262 RTF1YGL244W 1677 nt12.86□□□□□ -0.35
MCM16Q12262 YIL100WYIL100W 354 nt12.83□□□□□ -0.36
MCM16Q12262 YKL097CYKL097C 411 nt12.8□□□□□ -0.36
MCM16Q12262 YNL195CYNL195C 786 nt12.8□□□□□ -0.36
MCM16Q12262 YJL152WYJL152W 360 nt12.74□□□□□ -0.37
MCM16Q12262 YLR236CYLR236C 324 nt12.74□□□□□ -0.37
MCM16Q12262 BOP3YNL042W 1191 nt12.74□□□□□ -0.37
MCM16Q12262 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.73□□□□□ -0.37
MCM16Q12262 PTK1YKL198C 1989 nt12.72□□□□□ -0.37
MCM16Q12262 CSM2YIL132C 642 nt12.69□□□□□ -0.38
MCM16Q12262 NCP1YHR042W 2076 nt12.66□□□□□ -0.38
MCM16Q12262 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.64□□□□□ -0.39
MCM16Q12262 YOL037CYOL037C 354 nt12.6□□□□□ -0.39
MCM16Q12262 NVJ2YPR091C 2313 nt12.56□□□□□ -0.4
MCM16Q12262 LCB1YMR296C 1677 nt12.51□□□□□ -0.41
MCM16Q12262 YOR139CYOR139C 393 nt12.47□□□□□ -0.41
MCM16Q12262 RRD1YIL153W 1182 nt12.46□□□□□ -0.41
MCM16Q12262 WHI5YOR083W 888 nt12.45□□□□□ -0.42
MCM16Q12262 YFL054CYFL054C 1941 nt12.43□□□□□ -0.42
MCM16Q12262 YLR281CYLR281C 468 nt12.39□□□□□ -0.43
MCM16Q12262 DED1YOR204W 1815 nt12.37□□□□□ -0.43
MCM16Q12262 SPT8YLR055C 1809 nt12.35□□□□□ -0.43
MCM16Q12262 PAU21YOR394W 495 nt12.35□□□□□ -0.43
MCM16Q12262 PAU22YPL282C 495 nt12.35□□□□□ -0.43
MCM16Q12262 GBP2YCL011C 1284 nt12.33□□□□□ -0.44
MCM16Q12262 IDH1YNL037C 1083 nt12.32□□□□□ -0.44
MCM16Q12262 FMT1YBL013W 1206 nt12.31□□□□□ -0.44
MCM16Q12262 PCM1YEL058W 1674 nt12.29□□□□□ -0.44
MCM16Q12262 FMP52YER004W 696 nt12.28□□□□□ -0.44
MCM16Q12262 SIM1YIL123W 1431 nt12.28□□□□□ -0.44
MCM16Q12262 LYS4YDR234W 2082 nt12.25□□□□□ -0.45
MCM16Q12262 TCD2YKL027W 1344 nt12.24□□□□□ -0.45
MCM16Q12262 ADH2YMR303C 1047 nt12.22□□□□□ -0.45
MCM16Q12262 ARO7YPR060C 771 nt12.2□□□□□ -0.46
MCM16Q12262 CWP1YKL096W 720 nt12.18□□□□□ -0.46
MCM16Q12262 BIO4YNR057C 714 nt12.18□□□□□ -0.46
MCM16Q12262 SWE1YJL187C 2460 nt12.16□□□□□ -0.46
MCM16Q12262 MXR2YCL033C 507 nt12.15□□□□□ -0.46
MCM16Q12262 YPR011CYPR011C 981 nt12.14□□□□□ -0.47
MCM16Q12262 SNF6YHL025W 999 nt12.12□□□□□ -0.47
MCM16Q12262 PUS2YGL063W 1113 nt12.11□□□□□ -0.47
MCM16Q12262 DSK2YMR276W 1122 nt12.11□□□□□ -0.47
MCM16Q12262 YDR433WYDR433W 441 nt12.1□□□□□ -0.47
MCM16Q12262 BOR1YNL275W 1731 nt12.09□□□□□ -0.47
MCM16Q12262 FMP45YDL222C 930 nt12.08□□□□□ -0.48
MCM16Q12262 SOR2YDL246C 1074 nt12.06□□□□□ -0.48
MCM16Q12262 IMP2'YIL154C 1041 nt12.06□□□□□ -0.48
MCM16Q12262 SOR1YJR159W 1074 nt12.06□□□□□ -0.48
MCM16Q12262 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 IMT4tM(CAU)E 72 nt12□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 IMT2tM(CAU)P 72 nt12□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 CRR1YLR213C 1269 nt12□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 YIH1YCR059C 777 nt11.98□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 LPX1YOR084W 1164 nt11.98□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 ERF2YLR246W 1080 nt11.97□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 YCL042WYCL042W 360 nt11.97□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 MET8YBR213W 825 nt11.96□□□□□ -0.49
MCM16Q12262 FRD1YEL047C 1413 nt11.95□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 HSP60YLR259C 1719 nt11.95□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 ERV46YAL042W 1248 nt11.95□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 YLL053CYLL053C 459 nt11.95□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 MIC10YCL057C-A 294 nt11.93□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.92□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 ATF2YGR177C 1608 nt11.91□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 CLB6YGR109C 1143 nt11.91□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 RNQ1YCL028W 1218 nt11.91□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 YKR040CYKR040C 504 nt11.9□□□□□ -0.5
MCM16Q12262 HEM12YDR047W 1089 nt11.85□□□□□ -0.51
MCM16Q12262 SNG1YGR197C 1644 nt11.84□□□□□ -0.51
MCM16Q12262 FTR1YER145C 1215 nt11.82□□□□□ -0.52
MCM16Q12262 CCA1YER168C 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
MCM16Q12262 GLK1YCL040W 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.3 ms