Protein–RNA interactions for Protein: Q12259

YLR108C, BTB/POZ domain-containing protein YLR108C, yeastyeast

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR108CQ12259 Q0182Q0182 405 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR108CQ12259 RKM5YLR137W 1104 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR108CQ12259 RPP2AYOL039W 321 nt10.75□□□□□ -0.69
YLR108CQ12259 FUN26YAL022C 1554 nt10.73□□□□□ -0.69
YLR108CQ12259 PIB2YGL023C 1908 nt10.72□□□□□ -0.69
YLR108CQ12259 NPL3YDR432W 1245 nt10.71□□□□□ -0.69
YLR108CQ12259 TRM9YML014W 840 nt10.7□□□□□ -0.7
YLR108CQ12259 YOL037CYOL037C 354 nt10.7□□□□□ -0.7
YLR108CQ12259 IRC15YPL017C 1500 nt10.68□□□□□ -0.7
YLR108CQ12259 ALF1YNL148C 765 nt10.64□□□□□ -0.71
YLR108CQ12259 CCT6YDR188W 1641 nt10.64□□□□□ -0.71
YLR108CQ12259 YSC84YHR016C 1407 nt10.64□□□□□ -0.71
YLR108CQ12259 FPS1YLL043W 2010 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR108CQ12259 GIS3YLR094C 1509 nt10.63□□□□□ -0.71
YLR108CQ12259 RTF1YGL244W 1677 nt10.6□□□□□ -0.71
YLR108CQ12259 YHL050CYHL050C 2094 nt10.55□□□□□ -0.72
YLR108CQ12259 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YLR108CQ12259 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.5□□□□□ -0.73
YLR108CQ12259 SIS1YNL007C 1059 nt10.49□□□□□ -0.73
YLR108CQ12259 YLR281CYLR281C 468 nt10.47□□□□□ -0.73
YLR108CQ12259 BOP3YNL042W 1191 nt10.47□□□□□ -0.73
YLR108CQ12259 PTK1YKL198C 1989 nt10.45□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 GFD2YCL036W 1701 nt10.44□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 RRT12YCR045C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 RTS2YOR077W 699 nt10.42□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 WHI5YOR083W 888 nt10.41□□□□□ -0.74
YLR108CQ12259 ART5YGR068C 1761 nt10.39□□□□□ -0.75
YLR108CQ12259 BOR1YNL275W 1731 nt10.37□□□□□ -0.75
YLR108CQ12259 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.36□□□□□ -0.75
YLR108CQ12259 UME6YDR207C 2511 nt10.33□□□□□ -0.76
YLR108CQ12259 YNL195CYNL195C 786 nt10.33□□□□□ -0.76
YLR108CQ12259 PUS2YGL063W 1113 nt10.32□□□□□ -0.76
YLR108CQ12259 CUE1YMR264W 612 nt10.31□□□□□ -0.76
YLR108CQ12259 PET9YBL030C 957 nt10.29□□□□□ -0.76
YLR108CQ12259 TIR4YOR009W 1464 nt10.27□□□□□ -0.77
YLR108CQ12259 YJL225CYJL225C 5277 nt10.24□□□□□ -0.77
YLR108CQ12259 YCH1YGR203W 447 nt10.23□□□□□ -0.77
YLR108CQ12259 NCP1YHR042W 2076 nt10.22□□□□□ -0.77
YLR108CQ12259 YFL054CYFL054C 1941 nt10.22□□□□□ -0.77
YLR108CQ12259 YJL152WYJL152W 360 nt10.21□□□□□ -0.77
YLR108CQ12259 YIL100WYIL100W 354 nt10.2□□□□□ -0.78
YLR108CQ12259 IMP2'YIL154C 1041 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR108CQ12259 DSK2YMR276W 1122 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR108CQ12259 YPR011CYPR011C 981 nt10.19□□□□□ -0.78
YLR108CQ12259 SPT8YLR055C 1809 nt10.18□□□□□ -0.78
YLR108CQ12259 YLR236CYLR236C 324 nt10.17□□□□□ -0.78
YLR108CQ12259 YMR057CYMR057C 372 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR108CQ12259 MOT3YMR070W 1473 nt10.09□□□□□ -0.79
YLR108CQ12259 IDH1YNL037C 1083 nt10.08□□□□□ -0.8
YLR108CQ12259 FMP45YDL222C 930 nt10.05□□□□□ -0.8
YLR108CQ12259 MCH5YOR306C 1566 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR108CQ12259 HSP60YLR259C 1719 nt10.02□□□□□ -0.8
YLR108CQ12259 ERV46YAL042W 1248 nt10.01□□□□□ -0.81
YLR108CQ12259 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.01□□□□□ -0.81
YLR108CQ12259 GBP2YCL011C 1284 nt9.99□□□□□ -0.81
YLR108CQ12259 LPX1YOR084W 1164 nt9.98□□□□□ -0.81
YLR108CQ12259 ALG12YNR030W 1656 nt9.98□□□□□ -0.81
YLR108CQ12259 LCB1YMR296C 1677 nt9.95□□□□□ -0.82
YLR108CQ12259 SWE1YJL187C 2460 nt9.94□□□□□ -0.82
YLR108CQ12259 YDR433WYDR433W 441 nt9.94□□□□□ -0.82
YLR108CQ12259 YKR040CYKR040C 504 nt9.91□□□□□ -0.82
YLR108CQ12259 RRD1YIL153W 1182 nt9.9□□□□□ -0.82
YLR108CQ12259 DED1YOR204W 1815 nt9.9□□□□□ -0.82
YLR108CQ12259 MXR2YCL033C 507 nt9.89□□□□□ -0.83
YLR108CQ12259 TCD2YKL027W 1344 nt9.88□□□□□ -0.83
YLR108CQ12259 GLK1YCL040W 1503 nt9.87□□□□□ -0.83
YLR108CQ12259 SPP1YPL138C 1062 nt9.8□□□□□ -0.84
YLR108CQ12259 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR108CQ12259 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR108CQ12259 FMT1YBL013W 1206 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR108CQ12259 RPM1RPM1 483 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR108CQ12259 FRD1YEL047C 1413 nt9.76□□□□□ -0.85
YLR108CQ12259 LYS4YDR234W 2082 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR108CQ12259 FMP52YER004W 696 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR108CQ12259 SOR2YDL246C 1074 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR108CQ12259 SOR1YJR159W 1074 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR108CQ12259 FUR4YBR021W 1902 nt9.71□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 NAR1YNL240C 1476 nt9.7□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 SIM1YIL123W 1431 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 YCL042WYCL042W 360 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 MRPL8YJL063C 717 nt9.66□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 BIO4YNR057C 714 nt9.66□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 RTG1YOL067C 534 nt9.66□□□□□ -0.86
YLR108CQ12259 AAC1YMR056C 930 nt9.64□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 ADH2YMR303C 1047 nt9.64□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 PRP4YPR178W 1398 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 CWP1YKL096W 720 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 PCM1YEL058W 1674 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.6□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 YEL076CYEL076C 651 nt9.6□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 YLR464WYLR464W 651 nt9.6□□□□□ -0.87
YLR108CQ12259 DPS1YLL018C 1674 nt9.58□□□□□ -0.88
YLR108CQ12259 SNF6YHL025W 999 nt9.55□□□□□ -0.88
YLR108CQ12259 PTH1YHR189W 573 nt9.54□□□□□ -0.88
YLR108CQ12259 ADO1YJR105W 1023 nt9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms