Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 FPS1YLL043W 2010 nt12.91□□□□□ -0.34
RUD3Q12234 WWM1YFL010C 636 nt12.9□□□□□ -0.34
RUD3Q12234 GFD2YCL036W 1701 nt12.84□□□□□ -0.35
RUD3Q12234 ART5YGR068C 1761 nt12.81□□□□□ -0.36
RUD3Q12234 YSC84YHR016C 1407 nt12.8□□□□□ -0.36
RUD3Q12234 YJL225CYJL225C 5277 nt12.79□□□□□ -0.36
RUD3Q12234 NVJ2YPR091C 2313 nt12.78□□□□□ -0.36
RUD3Q12234 PIB2YGL023C 1908 nt12.77□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.75□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 SHU1YHL006C 453 nt12.75□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 PET9YBL030C 957 nt12.75□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 RTS2YOR077W 699 nt12.74□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 YHL050CYHL050C 2094 nt12.73□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 YKL097CYKL097C 411 nt12.71□□□□□ -0.37
RUD3Q12234 YGR021WYGR021W 873 nt12.69□□□□□ -0.38
RUD3Q12234 RTF1YGL244W 1677 nt12.67□□□□□ -0.38
RUD3Q12234 CUE1YMR264W 612 nt12.67□□□□□ -0.38
RUD3Q12234 YCH1YGR203W 447 nt12.66□□□□□ -0.38
RUD3Q12234 RRT12YCR045C 1476 nt12.61□□□□□ -0.39
RUD3Q12234 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.6□□□□□ -0.39
RUD3Q12234 HOM6YJR139C 1080 nt12.59□□□□□ -0.39
RUD3Q12234 BOP3YNL042W 1191 nt12.58□□□□□ -0.4
RUD3Q12234 YNL195CYNL195C 786 nt12.58□□□□□ -0.4
RUD3Q12234 TIR4YOR009W 1464 nt12.55□□□□□ -0.4
RUD3Q12234 YIL100WYIL100W 354 nt12.52□□□□□ -0.41
RUD3Q12234 PTK1YKL198C 1989 nt12.49□□□□□ -0.41
RUD3Q12234 YMR057CYMR057C 372 nt12.48□□□□□ -0.41
RUD3Q12234 YLR236CYLR236C 324 nt12.41□□□□□ -0.42
RUD3Q12234 RKM5YLR137W 1104 nt12.4□□□□□ -0.42
RUD3Q12234 MNP1YGL068W 585 nt12.39□□□□□ -0.43
RUD3Q12234 NCP1YHR042W 2076 nt12.36□□□□□ -0.43
RUD3Q12234 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.35□□□□□ -0.43
RUD3Q12234 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.35□□□□□ -0.43
RUD3Q12234 NPL3YDR432W 1245 nt12.29□□□□□ -0.44
RUD3Q12234 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.22□□□□□ -0.45
RUD3Q12234 YFL054CYFL054C 1941 nt12.21□□□□□ -0.45
RUD3Q12234 YJL152WYJL152W 360 nt12.2□□□□□ -0.46
RUD3Q12234 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.18□□□□□ -0.46
RUD3Q12234 YOL037CYOL037C 354 nt12.17□□□□□ -0.46
RUD3Q12234 YOR139CYOR139C 393 nt12.17□□□□□ -0.46
RUD3Q12234 SPT8YLR055C 1809 nt12.16□□□□□ -0.46
RUD3Q12234 LCB1YMR296C 1677 nt12.13□□□□□ -0.47
RUD3Q12234 Q0182Q0182 405 nt12.11□□□□□ -0.47
RUD3Q12234 BOR1YNL275W 1731 nt12.09□□□□□ -0.47
RUD3Q12234 FMP52YER004W 696 nt11.93□□□□□ -0.5
RUD3Q12234 RRD1YIL153W 1182 nt11.93□□□□□ -0.5
RUD3Q12234 SWE1YJL187C 2460 nt11.92□□□□□ -0.5
RUD3Q12234 SIM1YIL123W 1431 nt11.9□□□□□ -0.5
RUD3Q12234 LYS4YDR234W 2082 nt11.9□□□□□ -0.51
RUD3Q12234 UME6YDR207C 2511 nt11.88□□□□□ -0.51
RUD3Q12234 WHI5YOR083W 888 nt11.87□□□□□ -0.51
RUD3Q12234 PCM1YEL058W 1674 nt11.87□□□□□ -0.51
RUD3Q12234 YLR281CYLR281C 468 nt11.86□□□□□ -0.51
RUD3Q12234 IDH1YNL037C 1083 nt11.82□□□□□ -0.52
RUD3Q12234 HSP60YLR259C 1719 nt11.82□□□□□ -0.52
RUD3Q12234 DED1YOR204W 1815 nt11.8□□□□□ -0.52
RUD3Q12234 GBP2YCL011C 1284 nt11.79□□□□□ -0.52
RUD3Q12234 TCD2YKL027W 1344 nt11.78□□□□□ -0.52
RUD3Q12234 BIO4YNR057C 714 nt11.76□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 PUS2YGL063W 1113 nt11.74□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 FMT1YBL013W 1206 nt11.73□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.72□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 SNF6YHL025W 999 nt11.72□□□□□ -0.53
RUD3Q12234 GLK1YCL040W 1503 nt11.7□□□□□ -0.54
RUD3Q12234 ADH2YMR303C 1047 nt11.69□□□□□ -0.54
RUD3Q12234 CWP1YKL096W 720 nt11.68□□□□□ -0.54
RUD3Q12234 ERF2YLR246W 1080 nt11.67□□□□□ -0.54
RUD3Q12234 ALG12YNR030W 1656 nt11.66□□□□□ -0.54
RUD3Q12234 IMP2'YIL154C 1041 nt11.65□□□□□ -0.54
RUD3Q12234 CRR1YLR213C 1269 nt11.64□□□□□ -0.55
RUD3Q12234 DSK2YMR276W 1122 nt11.62□□□□□ -0.55
RUD3Q12234 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.61□□□□□ -0.55
RUD3Q12234 FUR4YBR021W 1902 nt11.59□□□□□ -0.55
RUD3Q12234 SOR2YDL246C 1074 nt11.59□□□□□ -0.55
RUD3Q12234 SOR1YJR159W 1074 nt11.59□□□□□ -0.55
RUD3Q12234 MCH5YOR306C 1566 nt11.57□□□□□ -0.56
RUD3Q12234 YIH1YCR059C 777 nt11.56□□□□□ -0.56
RUD3Q12234 HEM12YDR047W 1089 nt11.52□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 YCL042WYCL042W 360 nt11.52□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 YLL053CYLL053C 459 nt11.51□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 RAX1YOR301W 1308 nt11.51□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 YDR433WYDR433W 441 nt11.5□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 CCA1YER168C 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 RNQ1YCL028W 1218 nt11.49□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 YPR011CYPR011C 981 nt11.48□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 MIC10YCL057C-A 294 nt11.48□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 ATF2YGR177C 1608 nt11.47□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 PRP4YPR178W 1398 nt11.47□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 RPM1RPM1 483 nt11.47□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 MXR2YCL033C 507 nt11.47□□□□□ -0.57
RUD3Q12234 YFL067WYFL067W 528 nt11.45□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 FMP45YDL222C 930 nt11.44□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.44□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 YEL076CYEL076C 651 nt11.44□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 YLR464WYLR464W 651 nt11.44□□□□□ -0.58
RUD3Q12234 SNG1YGR197C 1644 nt11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.4 ms