Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.38□□□□□ -0.11
LSP1Q12230 SHU1YHL006C 453 nt14.36□□□□□ -0.11
LSP1Q12230 GFD2YCL036W 1701 nt14.35□□□□□ -0.11
LSP1Q12230 RTS2YOR077W 699 nt14.35□□□□□ -0.11
LSP1Q12230 HOM6YJR139C 1080 nt14.31□□□□□ -0.12
LSP1Q12230 PCH2YBR186W 1695 nt14.27□□□□□ -0.12
LSP1Q12230 MNP1YGL068W 585 nt14.24□□□□□ -0.13
LSP1Q12230 SEC11YIR022W 504 nt14.23□□□□□ -0.13
LSP1Q12230 PET9YBL030C 957 nt14.21□□□□□ -0.13
LSP1Q12230 GUT2YIL155C 1950 nt14.2□□□□□ -0.14
LSP1Q12230 YSC84YHR016C 1407 nt14.2□□□□□ -0.14
LSP1Q12230 TIR4YOR009W 1464 nt14.16□□□□□ -0.14
LSP1Q12230 PAC11YDR488C 1602 nt14.13□□□□□ -0.15
LSP1Q12230 RKM5YLR137W 1104 nt14.12□□□□□ -0.15
LSP1Q12230 CUE1YMR264W 612 nt14.1□□□□□ -0.15
LSP1Q12230 YCH1YGR203W 447 nt14.09□□□□□ -0.15
LSP1Q12230 YMR057CYMR057C 372 nt14.09□□□□□ -0.15
LSP1Q12230 YHL050CYHL050C 2094 nt14.06□□□□□ -0.16
LSP1Q12230 RRT12YCR045C 1476 nt14.06□□□□□ -0.16
LSP1Q12230 YIL100WYIL100W 354 nt13.99□□□□□ -0.17
LSP1Q12230 YNL195CYNL195C 786 nt13.98□□□□□ -0.17
LSP1Q12230 YKL097CYKL097C 411 nt13.95□□□□□ -0.18
LSP1Q12230 PIB2YGL023C 1908 nt13.94□□□□□ -0.18
LSP1Q12230 YJL152WYJL152W 360 nt13.93□□□□□ -0.18
LSP1Q12230 FPS1YLL043W 2010 nt13.93□□□□□ -0.18
LSP1Q12230 RTF1YGL244W 1677 nt13.91□□□□□ -0.18
LSP1Q12230 NPL3YDR432W 1245 nt13.89□□□□□ -0.19
LSP1Q12230 YLR236CYLR236C 324 nt13.87□□□□□ -0.19
LSP1Q12230 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.83□□□□□ -0.2
LSP1Q12230 BOP3YNL042W 1191 nt13.8□□□□□ -0.2
LSP1Q12230 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.8□□□□□ -0.2
LSP1Q12230 YOL037CYOL037C 354 nt13.69□□□□□ -0.22
LSP1Q12230 PTK1YKL198C 1989 nt13.68□□□□□ -0.22
LSP1Q12230 NCP1YHR042W 2076 nt13.58□□□□□ -0.24
LSP1Q12230 WHI5YOR083W 888 nt13.52□□□□□ -0.25
LSP1Q12230 LCB1YMR296C 1677 nt13.5□□□□□ -0.25
LSP1Q12230 YFL054CYFL054C 1941 nt13.49□□□□□ -0.25
LSP1Q12230 YOR139CYOR139C 393 nt13.48□□□□□ -0.25
LSP1Q12230 NVJ2YPR091C 2313 nt13.44□□□□□ -0.26
LSP1Q12230 RRD1YIL153W 1182 nt13.44□□□□□ -0.26
LSP1Q12230 YLR281CYLR281C 468 nt13.43□□□□□ -0.26
LSP1Q12230 IDH1YNL037C 1083 nt13.43□□□□□ -0.26
LSP1Q12230 GBP2YCL011C 1284 nt13.43□□□□□ -0.26
LSP1Q12230 TCD2YKL027W 1344 nt13.34□□□□□ -0.27
LSP1Q12230 SIM1YIL123W 1431 nt13.33□□□□□ -0.28
LSP1Q12230 SPT8YLR055C 1809 nt13.33□□□□□ -0.28
LSP1Q12230 DED1YOR204W 1815 nt13.32□□□□□ -0.28
LSP1Q12230 PCM1YEL058W 1674 nt13.32□□□□□ -0.28
LSP1Q12230 FMP52YER004W 696 nt13.31□□□□□ -0.28
LSP1Q12230 FMT1YBL013W 1206 nt13.27□□□□□ -0.29
LSP1Q12230 CWP1YKL096W 720 nt13.24□□□□□ -0.29
LSP1Q12230 ADH2YMR303C 1047 nt13.23□□□□□ -0.29
LSP1Q12230 YDR433WYDR433W 441 nt13.2□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 PUS2YGL063W 1113 nt13.19□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 SNF6YHL025W 999 nt13.19□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 BIO4YNR057C 714 nt13.18□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 MXR2YCL033C 507 nt13.18□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 LYS4YDR234W 2082 nt13.17□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 DSK2YMR276W 1122 nt13.16□□□□□ -0.3
LSP1Q12230 BOR1YNL275W 1731 nt13.13□□□□□ -0.31
LSP1Q12230 IMP2'YIL154C 1041 nt13.13□□□□□ -0.31
LSP1Q12230 SWE1YJL187C 2460 nt13.12□□□□□ -0.31
LSP1Q12230 FMP45YDL222C 930 nt13.07□□□□□ -0.32
LSP1Q12230 YPR011CYPR011C 981 nt13.07□□□□□ -0.32
LSP1Q12230 YCL042WYCL042W 360 nt13.06□□□□□ -0.32
LSP1Q12230 SOR2YDL246C 1074 nt13.02□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 SOR1YJR159W 1074 nt13.02□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.99□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 ERF2YLR246W 1080 nt12.99□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 LPX1YOR084W 1164 nt12.98□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 YLL053CYLL053C 459 nt12.96□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 CRR1YLR213C 1269 nt12.96□□□□□ -0.33
LSP1Q12230 YIH1YCR059C 777 nt12.95□□□□□ -0.34
LSP1Q12230 FRD1YEL047C 1413 nt12.91□□□□□ -0.34
LSP1Q12230 ERV46YAL042W 1248 nt12.91□□□□□ -0.34
LSP1Q12230 YKR040CYKR040C 504 nt12.91□□□□□ -0.34
LSP1Q12230 HSP60YLR259C 1719 nt12.91□□□□□ -0.34
LSP1Q12230 RNQ1YCL028W 1218 nt12.9□□□□□ -0.34
LSP1Q12230 MIC10YCL057C-A 294 nt12.89□□□□□ -0.35
LSP1Q12230 HEM12YDR047W 1089 nt12.88□□□□□ -0.35
LSP1Q12230 ATF2YGR177C 1608 nt12.88□□□□□ -0.35
LSP1Q12230 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.87□□□□□ -0.35
LSP1Q12230 GLK1YCL040W 1503 nt12.81□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 SNG1YGR197C 1644 nt12.8□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 FTR1YER145C 1215 nt12.79□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 RAX1YOR301W 1308 nt12.79□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 TRM5YHR070W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 YFL067WYFL067W 528 nt12.78□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 DIC1YLR348C 897 nt12.78□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 CCA1YER168C 1641 nt12.77□□□□□ -0.36
LSP1Q12230 FUR4YBR021W 1902 nt12.77□□□□□ -0.37
LSP1Q12230 GAL1YBR020W 1587 nt12.77□□□□□ -0.37
LSP1Q12230 DDR2YOL052C-A 186 nt12.75□□□□□ -0.37
LSP1Q12230 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.66□□□□□ -0.38
LSP1Q12230 PTH1YHR189W 573 nt12.65□□□□□ -0.38
LSP1Q12230 BNA2YJR078W 1362 nt12.63□□□□□ -0.39
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