Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.64□□□□□ -0.55
NFI1Q12216 YDL221WYDL221W 552 nt11.63□□□□□ -0.55
NFI1Q12216 YGR021WYGR021W 873 nt11.63□□□□□ -0.55
NFI1Q12216 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.62□□□□□ -0.55
NFI1Q12216 HOM6YJR139C 1080 nt11.59□□□□□ -0.55
NFI1Q12216 SIS1YNL007C 1059 nt11.59□□□□□ -0.55
NFI1Q12216 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.58□□□□□ -0.56
NFI1Q12216 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.58□□□□□ -0.56
NFI1Q12216 SDH1YKL148C 1923 nt11.54□□□□□ -0.56
NFI1Q12216 PIB2YGL023C 1908 nt11.53□□□□□ -0.56
NFI1Q12216 MNP1YGL068W 585 nt11.52□□□□□ -0.57
NFI1Q12216 IRC15YPL017C 1500 nt11.48□□□□□ -0.57
NFI1Q12216 ART5YGR068C 1761 nt11.46□□□□□ -0.57
NFI1Q12216 GFD2YCL036W 1701 nt11.44□□□□□ -0.58
NFI1Q12216 SCC4YER147C 1875 nt11.44□□□□□ -0.58
NFI1Q12216 SEC11YIR022W 504 nt11.43□□□□□ -0.58
NFI1Q12216 YKL097CYKL097C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
NFI1Q12216 RKM5YLR137W 1104 nt11.43□□□□□ -0.58
NFI1Q12216 GIS3YLR094C 1509 nt11.41□□□□□ -0.58
NFI1Q12216 RTS2YOR077W 699 nt11.37□□□□□ -0.59
NFI1Q12216 PET9YBL030C 957 nt11.34□□□□□ -0.59
NFI1Q12216 TIR4YOR009W 1464 nt11.32□□□□□ -0.6
NFI1Q12216 ALG12YNR030W 1656 nt11.3□□□□□ -0.6
NFI1Q12216 YCH1YGR203W 447 nt11.27□□□□□ -0.61
NFI1Q12216 RPM1RPM1 483 nt11.23□□□□□ -0.61
NFI1Q12216 YMR057CYMR057C 372 nt11.23□□□□□ -0.61
NFI1Q12216 CUE1YMR264W 612 nt11.22□□□□□ -0.61
NFI1Q12216 RTF1YGL244W 1677 nt11.21□□□□□ -0.61
NFI1Q12216 YSC84YHR016C 1407 nt11.21□□□□□ -0.61
NFI1Q12216 NPL3YDR432W 1245 nt11.2□□□□□ -0.62
NFI1Q12216 YOL037CYOL037C 354 nt11.15□□□□□ -0.62
NFI1Q12216 YHL050CYHL050C 2094 nt11.15□□□□□ -0.63
NFI1Q12216 YJL152WYJL152W 360 nt11.14□□□□□ -0.63
NFI1Q12216 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.13□□□□□ -0.63
NFI1Q12216 PTK1YKL198C 1989 nt11.12□□□□□ -0.63
NFI1Q12216 RRT12YCR045C 1476 nt11.12□□□□□ -0.63
NFI1Q12216 YIL100WYIL100W 354 nt11.09□□□□□ -0.63
NFI1Q12216 YOR139CYOR139C 393 nt11.06□□□□□ -0.64
NFI1Q12216 YNL195CYNL195C 786 nt11.04□□□□□ -0.64
NFI1Q12216 YLR236CYLR236C 324 nt11.03□□□□□ -0.64
NFI1Q12216 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.02□□□□□ -0.65
NFI1Q12216 HSP60YLR259C 1719 nt11□□□□□ -0.65
NFI1Q12216 HSL7YBR133C 2484 nt10.99□□□□□ -0.65
NFI1Q12216 NAR1YNL240C 1476 nt10.95□□□□□ -0.66
NFI1Q12216 BOP3YNL042W 1191 nt10.95□□□□□ -0.66
NFI1Q12216 WHI5YOR083W 888 nt10.95□□□□□ -0.66
NFI1Q12216 YLR281CYLR281C 468 nt10.93□□□□□ -0.66
NFI1Q12216 DED1YOR204W 1815 nt10.93□□□□□ -0.66
NFI1Q12216 NCP1YHR042W 2076 nt10.82□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 HEL2YDR266C 1920 nt10.82□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 IDH1YNL037C 1083 nt10.81□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 RRD1YIL153W 1182 nt10.79□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 GBP2YCL011C 1284 nt10.79□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 SPT8YLR055C 1809 nt10.79□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.79□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.79□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 CMP2YML057W 1815 nt10.78□□□□□ -0.68
NFI1Q12216 YFL054CYFL054C 1941 nt10.75□□□□□ -0.69
NFI1Q12216 LCB1YMR296C 1677 nt10.73□□□□□ -0.69
NFI1Q12216 PUS2YGL063W 1113 nt10.72□□□□□ -0.69
NFI1Q12216 TCD2YKL027W 1344 nt10.71□□□□□ -0.69
NFI1Q12216 DSK2YMR276W 1122 nt10.69□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 FMP52YER004W 696 nt10.68□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 IMP2'YIL154C 1041 nt10.67□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 SFP1YLR403W 2052 nt10.66□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 GLK1YCL040W 1503 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 FMT1YBL013W 1206 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 PCM1YEL058W 1674 nt10.65□□□□□ -0.7
NFI1Q12216 YDR433WYDR433W 441 nt10.63□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 YPR011CYPR011C 981 nt10.63□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 MET2YNL277W 1461 nt10.61□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 YAT1YAR035W 2064 nt10.61□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 MXR2YCL033C 507 nt10.61□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 SIM1YIL123W 1431 nt10.6□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 ADH2YMR303C 1047 nt10.59□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 NPP1YCR026C 2229 nt10.59□□□□□ -0.71
NFI1Q12216 SSN3YPL042C 1668 nt10.58□□□□□ -0.72
NFI1Q12216 FMP45YDL222C 930 nt10.58□□□□□ -0.72
NFI1Q12216 CWP1YKL096W 720 nt10.58□□□□□ -0.72
NFI1Q12216 SNF6YHL025W 999 nt10.54□□□□□ -0.72
NFI1Q12216 PBP1YGR178C 2169 nt10.53□□□□□ -0.72
NFI1Q12216 BIO4YNR057C 714 nt10.52□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 LPX1YOR084W 1164 nt10.52□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 LYS4YDR234W 2082 nt10.52□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 SOR2YDL246C 1074 nt10.5□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 SOR1YJR159W 1074 nt10.5□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 ERV46YAL042W 1248 nt10.5□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 CYT2YKL087C 675 nt10.5□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 GID7YCL039W 2238 nt10.5□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 YCL042WYCL042W 360 nt10.48□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 YJL225CYJL225C 5277 nt10.46□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 YKR040CYKR040C 504 nt10.46□□□□□ -0.73
NFI1Q12216 SWE1YJL187C 2460 nt10.45□□□□□ -0.74
NFI1Q12216 FRD1YEL047C 1413 nt10.44□□□□□ -0.74
NFI1Q12216 AAC1YMR056C 930 nt10.44□□□□□ -0.74
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