Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 UME6YDR207C 2511 nt11.53□□□□□ -0.56
MSH5Q12175 BDH2YAL061W 1254 nt11.49□□□□□ -0.57
MSH5Q12175 SIS1YNL007C 1059 nt11.48□□□□□ -0.57
MSH5Q12175 RRT12YCR045C 1476 nt11.48□□□□□ -0.57
MSH5Q12175 TRM9YML014W 840 nt11.44□□□□□ -0.58
MSH5Q12175 GFD2YCL036W 1701 nt11.42□□□□□ -0.58
MSH5Q12175 SRB2YHR041C 633 nt11.41□□□□□ -0.58
MSH5Q12175 RTS2YOR077W 699 nt11.41□□□□□ -0.58
MSH5Q12175 ART5YGR068C 1761 nt11.38□□□□□ -0.59
MSH5Q12175 YNL195CYNL195C 786 nt11.37□□□□□ -0.59
MSH5Q12175 CCT6YDR188W 1641 nt11.36□□□□□ -0.59
MSH5Q12175 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.35□□□□□ -0.59
MSH5Q12175 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.35□□□□□ -0.59
MSH5Q12175 CUE1YMR264W 612 nt11.3□□□□□ -0.6
MSH5Q12175 YFL054CYFL054C 1941 nt11.29□□□□□ -0.6
MSH5Q12175 YJL225CYJL225C 5277 nt11.29□□□□□ -0.6
MSH5Q12175 PET9YBL030C 957 nt11.26□□□□□ -0.61
MSH5Q12175 NCP1YHR042W 2076 nt11.24□□□□□ -0.61
MSH5Q12175 SPT8YLR055C 1809 nt11.23□□□□□ -0.61
MSH5Q12175 YIL100WYIL100W 354 nt11.19□□□□□ -0.62
MSH5Q12175 MCH5YOR306C 1566 nt11.18□□□□□ -0.62
MSH5Q12175 LSM3YLR438C-A 270 nt11.17□□□□□ -0.62
MSH5Q12175 WWM1YFL010C 636 nt11.14□□□□□ -0.63
MSH5Q12175 YCH1YGR203W 447 nt11.12□□□□□ -0.63
MSH5Q12175 ALG12YNR030W 1656 nt11.11□□□□□ -0.63
MSH5Q12175 HSP60YLR259C 1719 nt11.1□□□□□ -0.63
MSH5Q12175 YLR236CYLR236C 324 nt11□□□□□ -0.65
MSH5Q12175 YMR057CYMR057C 372 nt11□□□□□ -0.65
MSH5Q12175 TIR4YOR009W 1464 nt11□□□□□ -0.65
MSH5Q12175 SWE1YJL187C 2460 nt10.97□□□□□ -0.65
MSH5Q12175 PST2YDR032C 597 nt10.96□□□□□ -0.65
MSH5Q12175 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.94□□□□□ -0.66
MSH5Q12175 Q0182Q0182 405 nt10.93□□□□□ -0.66
MSH5Q12175 GLK1YCL040W 1503 nt10.93□□□□□ -0.66
MSH5Q12175 LCB1YMR296C 1677 nt10.92□□□□□ -0.66
MSH5Q12175 YGR021WYGR021W 873 nt10.87□□□□□ -0.67
MSH5Q12175 HOM6YJR139C 1080 nt10.79□□□□□ -0.68
MSH5Q12175 NAR1YNL240C 1476 nt10.78□□□□□ -0.68
MSH5Q12175 DSK2YMR276W 1122 nt10.76□□□□□ -0.69
MSH5Q12175 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.73□□□□□ -0.69
MSH5Q12175 FUR4YBR021W 1902 nt10.72□□□□□ -0.69
MSH5Q12175 LYS4YDR234W 2082 nt10.7□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 AAC1YMR056C 930 nt10.69□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 MNP1YGL068W 585 nt10.67□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 PRP4YPR178W 1398 nt10.66□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 SHU1YHL006C 453 nt10.66□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.66□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 BIO4YNR057C 714 nt10.65□□□□□ -0.7
MSH5Q12175 RKM5YLR137W 1104 nt10.64□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.63□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.63□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.61□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 YEL076CYEL076C 651 nt10.61□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 YLR464WYLR464W 651 nt10.61□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 SIM1YIL123W 1431 nt10.6□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 DPS1YLL018C 1674 nt10.6□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 YJL152WYJL152W 360 nt10.59□□□□□ -0.71
MSH5Q12175 NPL3YDR432W 1245 nt10.57□□□□□ -0.72
MSH5Q12175 BIO5YNR056C 1686 nt10.53□□□□□ -0.72
MSH5Q12175 BMT6YLR063W 1098 nt10.51□□□□□ -0.73
MSH5Q12175 PBP1YGR178C 2169 nt10.5□□□□□ -0.73
MSH5Q12175 CYT2YKL087C 675 nt10.5□□□□□ -0.73
MSH5Q12175 CMP2YML057W 1815 nt10.49□□□□□ -0.73
MSH5Q12175 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.49□□□□□ -0.73
MSH5Q12175 SNF1YDR477W 1902 nt10.45□□□□□ -0.74
MSH5Q12175 PCM1YEL058W 1674 nt10.44□□□□□ -0.74
MSH5Q12175 CCA1YER168C 1641 nt10.43□□□□□ -0.74
MSH5Q12175 YKR005CYKR005C 1578 nt10.4□□□□□ -0.74
MSH5Q12175 FMP52YER004W 696 nt10.4□□□□□ -0.74
MSH5Q12175 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.4□□□□□ -0.74
MSH5Q12175 RRD1YIL153W 1182 nt10.35□□□□□ -0.75
MSH5Q12175 HSL7YBR133C 2484 nt10.35□□□□□ -0.75
MSH5Q12175 ERF2YLR246W 1080 nt10.34□□□□□ -0.75
MSH5Q12175 RAX1YOR301W 1308 nt10.33□□□□□ -0.76
MSH5Q12175 CRR1YLR213C 1269 nt10.32□□□□□ -0.76
MSH5Q12175 IRC24YIR036C 792 nt10.28□□□□□ -0.76
MSH5Q12175 SNF6YHL025W 999 nt10.26□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 WSC2YNL283C 1512 nt10.26□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 YGR259CYGR259C 441 nt10.25□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 HEM12YDR047W 1089 nt10.24□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 YOL037CYOL037C 354 nt10.24□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 YKL097CYKL097C 411 nt10.22□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 MIC10YCL057C-A 294 nt10.22□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 ADH2YMR303C 1047 nt10.21□□□□□ -0.77
MSH5Q12175 YAT1YAR035W 2064 nt10.21□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 NDI1YML120C 1542 nt10.2□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 GBP2YCL011C 1284 nt10.2□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 DED1YOR204W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 CWP1YKL096W 720 nt10.18□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 IDH1YNL037C 1083 nt10.18□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 FMT1YBL013W 1206 nt10.17□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 YCL074WYCL074W 927 nt10.16□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 TCD2YKL027W 1344 nt10.15□□□□□ -0.78
MSH5Q12175 SNG1YGR197C 1644 nt10.14□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 MOT3YMR070W 1473 nt10.13□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 DUS1YML080W 1272 nt10.13□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 WHI5YOR083W 888 nt10.13□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 HEL2YDR266C 1920 nt10.13□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 RPM1RPM1 483 nt10.12□□□□□ -0.79
MSH5Q12175 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.12□□□□□ -0.79
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