Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 RKM5YLR137W 1104 nt13.48□□□□□ -0.25
RRP6Q12149 MOT3YMR070W 1473 nt13.41□□□□□ -0.26
RRP6Q12149 TAT1YBR069C 1860 nt13.4□□□□□ -0.26
RRP6Q12149 SDH1YKL148C 1923 nt13.39□□□□□ -0.27
RRP6Q12149 IRC15YPL017C 1500 nt13.37□□□□□ -0.27
RRP6Q12149 ART5YGR068C 1761 nt13.37□□□□□ -0.27
RRP6Q12149 GFD2YCL036W 1701 nt13.35□□□□□ -0.27
RRP6Q12149 SCC4YER147C 1875 nt13.27□□□□□ -0.28
RRP6Q12149 GIS3YLR094C 1509 nt13.27□□□□□ -0.29
RRP6Q12149 PET9YBL030C 957 nt13.26□□□□□ -0.29
RRP6Q12149 TIR4YOR009W 1464 nt13.24□□□□□ -0.29
RRP6Q12149 YOL037CYOL037C 354 nt13.21□□□□□ -0.29
RRP6Q12149 RTS2YOR077W 699 nt13.21□□□□□ -0.29
RRP6Q12149 YCH1YGR203W 447 nt13.2□□□□□ -0.3
RRP6Q12149 NPL3YDR432W 1245 nt13.19□□□□□ -0.3
RRP6Q12149 YOR139CYOR139C 393 nt13.17□□□□□ -0.3
RRP6Q12149 YMR057CYMR057C 372 nt13.12□□□□□ -0.31
RRP6Q12149 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.1□□□□□ -0.31
RRP6Q12149 CUE1YMR264W 612 nt13.09□□□□□ -0.31
RRP6Q12149 FPS1YLL043W 2010 nt13.03□□□□□ -0.32
RRP6Q12149 YJL152WYJL152W 360 nt13.02□□□□□ -0.33
RRP6Q12149 SEC11YIR022W 504 nt13.01□□□□□ -0.33
RRP6Q12149 PCH2YBR186W 1695 nt12.99□□□□□ -0.33
RRP6Q12149 YSC84YHR016C 1407 nt12.98□□□□□ -0.33
RRP6Q12149 WHI5YOR083W 888 nt12.95□□□□□ -0.34
RRP6Q12149 GUT2YIL155C 1950 nt12.94□□□□□ -0.34
RRP6Q12149 YHL050CYHL050C 2094 nt12.94□□□□□ -0.34
RRP6Q12149 YLR281CYLR281C 468 nt12.94□□□□□ -0.34
RRP6Q12149 YIL100WYIL100W 354 nt12.9□□□□□ -0.34
RRP6Q12149 RRT12YCR045C 1476 nt12.9□□□□□ -0.34
RRP6Q12149 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.88□□□□□ -0.35
RRP6Q12149 YLR236CYLR236C 324 nt12.87□□□□□ -0.35
RRP6Q12149 YNL195CYNL195C 786 nt12.81□□□□□ -0.36
RRP6Q12149 PIB2YGL023C 1908 nt12.8□□□□□ -0.36
RRP6Q12149 IDH1YNL037C 1083 nt12.71□□□□□ -0.37
RRP6Q12149 PUS2YGL063W 1113 nt12.69□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 RTF1YGL244W 1677 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 RRD1YIL153W 1182 nt12.67□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 GBP2YCL011C 1284 nt12.66□□□□□ -0.38
RRP6Q12149 IMP2'YIL154C 1041 nt12.64□□□□□ -0.39
RRP6Q12149 DSK2YMR276W 1122 nt12.64□□□□□ -0.39
RRP6Q12149 DED1YOR204W 1815 nt12.61□□□□□ -0.39
RRP6Q12149 BOP3YNL042W 1191 nt12.61□□□□□ -0.39
RRP6Q12149 YPR011CYPR011C 981 nt12.61□□□□□ -0.39
RRP6Q12149 NCP1YHR042W 2076 nt12.58□□□□□ -0.39
RRP6Q12149 TCD2YKL027W 1344 nt12.57□□□□□ -0.4
RRP6Q12149 FMP52YER004W 696 nt12.53□□□□□ -0.4
RRP6Q12149 PTK1YKL198C 1989 nt12.52□□□□□ -0.4
RRP6Q12149 FMT1YBL013W 1206 nt12.51□□□□□ -0.41
RRP6Q12149 LCB1YMR296C 1677 nt12.49□□□□□ -0.41
RRP6Q12149 FMP45YDL222C 930 nt12.49□□□□□ -0.41
RRP6Q12149 YDR433WYDR433W 441 nt12.49□□□□□ -0.41
RRP6Q12149 MXR2YCL033C 507 nt12.47□□□□□ -0.41
RRP6Q12149 PAC11YDR488C 1602 nt12.47□□□□□ -0.41
RRP6Q12149 PCM1YEL058W 1674 nt12.45□□□□□ -0.42
RRP6Q12149 ERV46YAL042W 1248 nt12.43□□□□□ -0.42
RRP6Q12149 LPX1YOR084W 1164 nt12.42□□□□□ -0.42
RRP6Q12149 ADH2YMR303C 1047 nt12.39□□□□□ -0.43
RRP6Q12149 CWP1YKL096W 720 nt12.38□□□□□ -0.43
RRP6Q12149 SOR2YDL246C 1074 nt12.37□□□□□ -0.43
RRP6Q12149 SOR1YJR159W 1074 nt12.37□□□□□ -0.43
RRP6Q12149 YKR040CYKR040C 504 nt12.36□□□□□ -0.43
RRP6Q12149 SIM1YIL123W 1431 nt12.34□□□□□ -0.43
RRP6Q12149 SNF6YHL025W 999 nt12.32□□□□□ -0.44
RRP6Q12149 FRD1YEL047C 1413 nt12.3□□□□□ -0.44
RRP6Q12149 YCL042WYCL042W 360 nt12.29□□□□□ -0.44
RRP6Q12149 BIO4YNR057C 714 nt12.28□□□□□ -0.44
RRP6Q12149 NVJ2YPR091C 2313 nt12.26□□□□□ -0.45
RRP6Q12149 LYS4YDR234W 2082 nt12.25□□□□□ -0.45
RRP6Q12149 YFL054CYFL054C 1941 nt12.24□□□□□ -0.45
RRP6Q12149 YIH1YCR059C 777 nt12.2□□□□□ -0.46
RRP6Q12149 SPT8YLR055C 1809 nt12.17□□□□□ -0.46
RRP6Q12149 RNQ1YCL028W 1218 nt12.15□□□□□ -0.46
RRP6Q12149 YLL053CYLL053C 459 nt12.12□□□□□ -0.47
RRP6Q12149 YJL225CYJL225C 5277 nt12.1□□□□□ -0.47
RRP6Q12149 ERF2YLR246W 1080 nt12.1□□□□□ -0.47
RRP6Q12149 CRR1YLR213C 1269 nt12.09□□□□□ -0.47
RRP6Q12149 SPP1YPL138C 1062 nt12.07□□□□□ -0.48
RRP6Q12149 DIC1YLR348C 897 nt12.05□□□□□ -0.48
RRP6Q12149 ATF2YGR177C 1608 nt12.03□□□□□ -0.48
RRP6Q12149 FTR1YER145C 1215 nt12.02□□□□□ -0.49
RRP6Q12149 SWE1YJL187C 2460 nt11.99□□□□□ -0.49
RRP6Q12149 GAL1YBR020W 1587 nt11.98□□□□□ -0.49
RRP6Q12149 PTH1YHR189W 573 nt11.97□□□□□ -0.49
RRP6Q12149 MIC10YCL057C-A 294 nt11.96□□□□□ -0.49
RRP6Q12149 TRM5YHR070W 1500 nt11.96□□□□□ -0.5
RRP6Q12149 YFL067WYFL067W 528 nt11.95□□□□□ -0.5
RRP6Q12149 HEM12YDR047W 1089 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP6Q12149 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.94□□□□□ -0.5
RRP6Q12149 SNG1YGR197C 1644 nt11.93□□□□□ -0.5
RRP6Q12149 YLR235CYLR235C 399 nt11.92□□□□□ -0.5
RRP6Q12149 DDR2YOL052C-A 186 nt11.88□□□□□ -0.51
RRP6Q12149 TIM23YNR017W 669 nt11.87□□□□□ -0.51
RRP6Q12149 AQY1YPR192W 918 nt11.86□□□□□ -0.51
RRP6Q12149 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.85□□□□□ -0.51
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