Protein–RNA interactions for Protein: Q12142

ATG9, Autophagy-related protein 9, yeastyeast

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG9Q12142 SDH1YKL148C 1923 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG9Q12142 IRC15YPL017C 1500 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG9Q12142 RKM5YLR137W 1104 nt13.43□□□□□ -0.26
ATG9Q12142 ART5YGR068C 1761 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG9Q12142 GFD2YCL036W 1701 nt13.37□□□□□ -0.27
ATG9Q12142 SCC4YER147C 1875 nt13.33□□□□□ -0.27
ATG9Q12142 GIS3YLR094C 1509 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG9Q12142 PET9YBL030C 957 nt13.29□□□□□ -0.28
ATG9Q12142 PAC11YDR488C 1602 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG9Q12142 TIR4YOR009W 1464 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG9Q12142 RTS2YOR077W 699 nt13.25□□□□□ -0.29
ATG9Q12142 YCH1YGR203W 447 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG9Q12142 NPL3YDR432W 1245 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG9Q12142 YMR057CYMR057C 372 nt13.16□□□□□ -0.3
ATG9Q12142 CUE1YMR264W 612 nt13.13□□□□□ -0.31
ATG9Q12142 YOL037CYOL037C 354 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG9Q12142 PCH2YBR186W 1695 nt13.08□□□□□ -0.31
ATG9Q12142 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 YOR139CYOR139C 393 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 SEC11YIR022W 504 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 YSC84YHR016C 1407 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 FPS1YLL043W 2010 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 GUT2YIL155C 1950 nt13.03□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 YJL152WYJL152W 360 nt13.03□□□□□ -0.32
ATG9Q12142 YHL050CYHL050C 2094 nt13.01□□□□□ -0.33
ATG9Q12142 RRT12YCR045C 1476 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG9Q12142 YIL100WYIL100W 354 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG9Q12142 YLR236CYLR236C 324 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG9Q12142 WHI5YOR083W 888 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG9Q12142 PIB2YGL023C 1908 nt12.88□□□□□ -0.35
ATG9Q12142 YLR281CYLR281C 468 nt12.88□□□□□ -0.35
ATG9Q12142 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG9Q12142 YNL195CYNL195C 786 nt12.86□□□□□ -0.35
ATG9Q12142 RTF1YGL244W 1677 nt12.76□□□□□ -0.37
ATG9Q12142 NVJ2YPR091C 2313 nt12.73□□□□□ -0.37
ATG9Q12142 BOP3YNL042W 1191 nt12.68□□□□□ -0.38
ATG9Q12142 RRD1YIL153W 1182 nt12.67□□□□□ -0.38
ATG9Q12142 IDH1YNL037C 1083 nt12.67□□□□□ -0.38
ATG9Q12142 GBP2YCL011C 1284 nt12.66□□□□□ -0.38
ATG9Q12142 PUS2YGL063W 1113 nt12.64□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 NCP1YHR042W 2076 nt12.64□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 PTK1YKL198C 1989 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 DED1YOR204W 1815 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.61□□□□□ -0.39
ATG9Q12142 YPR011CYPR011C 981 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG9Q12142 IMP2'YIL154C 1041 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG9Q12142 DSK2YMR276W 1122 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG9Q12142 FMT1YBL013W 1206 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG9Q12142 TCD2YKL027W 1344 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG9Q12142 LCB1YMR296C 1677 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG9Q12142 FMP52YER004W 696 nt12.51□□□□□ -0.41
ATG9Q12142 PCM1YEL058W 1674 nt12.48□□□□□ -0.41
ATG9Q12142 FMP45YDL222C 930 nt12.47□□□□□ -0.41
ATG9Q12142 YDR433WYDR433W 441 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG9Q12142 MXR2YCL033C 507 nt12.45□□□□□ -0.42
ATG9Q12142 ADH2YMR303C 1047 nt12.42□□□□□ -0.42
ATG9Q12142 CWP1YKL096W 720 nt12.4□□□□□ -0.42
ATG9Q12142 SIM1YIL123W 1431 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG9Q12142 ERV46YAL042W 1248 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG9Q12142 LPX1YOR084W 1164 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG9Q12142 YFL054CYFL054C 1941 nt12.34□□□□□ -0.43
ATG9Q12142 YKR040CYKR040C 504 nt12.33□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 SOR2YDL246C 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 SNF6YHL025W 999 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 SOR1YJR159W 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 BIO4YNR057C 714 nt12.3□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 LYS4YDR234W 2082 nt12.29□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 FRD1YEL047C 1413 nt12.28□□□□□ -0.44
ATG9Q12142 YCL042WYCL042W 360 nt12.27□□□□□ -0.45
ATG9Q12142 SPT8YLR055C 1809 nt12.25□□□□□ -0.45
ATG9Q12142 YIH1YCR059C 777 nt12.2□□□□□ -0.46
ATG9Q12142 BOR1YNL275W 1731 nt12.15□□□□□ -0.46
ATG9Q12142 RNQ1YCL028W 1218 nt12.15□□□□□ -0.46
ATG9Q12142 YLL053CYLL053C 459 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG9Q12142 ERF2YLR246W 1080 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG9Q12142 CRR1YLR213C 1269 nt12.09□□□□□ -0.47
ATG9Q12142 SWE1YJL187C 2460 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG9Q12142 ATF2YGR177C 1608 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG9Q12142 SPP1YPL138C 1062 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG9Q12142 DIC1YLR348C 897 nt12.03□□□□□ -0.48
ATG9Q12142 FTR1YER145C 1215 nt12.02□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 MIC10YCL057C-A 294 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 GAL1YBR020W 1587 nt11.98□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 TRM5YHR070W 1500 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 HEM12YDR047W 1089 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 YFL067WYFL067W 528 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.96□□□□□ -0.49
ATG9Q12142 SNG1YGR197C 1644 nt11.96□□□□□ -0.5
ATG9Q12142 PTH1YHR189W 573 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG9Q12142 MOT3YMR070W 1473 nt11.91□□□□□ -0.5
ATG9Q12142 DDR2YOL052C-A 186 nt11.91□□□□□ -0.5
ATG9Q12142 YJL225CYJL225C 5277 nt11.89□□□□□ -0.51
ATG9Q12142 UME6YDR207C 2511 nt11.88□□□□□ -0.51
ATG9Q12142 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG9Q12142 YLR235CYLR235C 399 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG9Q12142 RAX1YOR301W 1308 nt11.86□□□□□ -0.51
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