Protein–RNA interactions for Protein: Q12133

SPC3, Signal peptidase complex subunit SPC3, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC3Q12133 RKM5YLR137W 1104 nt11.34□□□□□ -0.59
SPC3Q12133 SDH1YKL148C 1923 nt11.27□□□□□ -0.61
SPC3Q12133 TAT1YBR069C 1860 nt11.26□□□□□ -0.61
SPC3Q12133 IRC15YPL017C 1500 nt11.25□□□□□ -0.61
SPC3Q12133 ART5YGR068C 1761 nt11.24□□□□□ -0.61
SPC3Q12133 GFD2YCL036W 1701 nt11.23□□□□□ -0.61
SPC3Q12133 NVJ2YPR091C 2313 nt11.2□□□□□ -0.62
SPC3Q12133 GIS3YLR094C 1509 nt11.16□□□□□ -0.62
SPC3Q12133 PET9YBL030C 957 nt11.16□□□□□ -0.62
SPC3Q12133 SCC4YER147C 1875 nt11.16□□□□□ -0.62
SPC3Q12133 TIR4YOR009W 1464 nt11.14□□□□□ -0.63
SPC3Q12133 YOL037CYOL037C 354 nt11.12□□□□□ -0.63
SPC3Q12133 RTS2YOR077W 699 nt11.11□□□□□ -0.63
SPC3Q12133 YCH1YGR203W 447 nt11.1□□□□□ -0.63
SPC3Q12133 NPL3YDR432W 1245 nt11.09□□□□□ -0.63
SPC3Q12133 YOR139CYOR139C 393 nt11.08□□□□□ -0.64
SPC3Q12133 YMR057CYMR057C 372 nt11.03□□□□□ -0.64
SPC3Q12133 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.02□□□□□ -0.65
SPC3Q12133 CUE1YMR264W 612 nt11.01□□□□□ -0.65
SPC3Q12133 YJL152WYJL152W 360 nt10.96□□□□□ -0.65
SPC3Q12133 FPS1YLL043W 2010 nt10.96□□□□□ -0.66
SPC3Q12133 SEC11YIR022W 504 nt10.94□□□□□ -0.66
SPC3Q12133 PCH2YBR186W 1695 nt10.92□□□□□ -0.66
SPC3Q12133 YSC84YHR016C 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
SPC3Q12133 YLR281CYLR281C 468 nt10.9□□□□□ -0.66
SPC3Q12133 WHI5YOR083W 888 nt10.89□□□□□ -0.67
SPC3Q12133 GUT2YIL155C 1950 nt10.88□□□□□ -0.67
SPC3Q12133 YHL050CYHL050C 2094 nt10.88□□□□□ -0.67
SPC3Q12133 YIL100WYIL100W 354 nt10.85□□□□□ -0.67
SPC3Q12133 RRT12YCR045C 1476 nt10.85□□□□□ -0.67
SPC3Q12133 YLR236CYLR236C 324 nt10.84□□□□□ -0.67
SPC3Q12133 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.83□□□□□ -0.68
SPC3Q12133 YNL195CYNL195C 786 nt10.78□□□□□ -0.68
SPC3Q12133 PIB2YGL023C 1908 nt10.75□□□□□ -0.69
SPC3Q12133 IDH1YNL037C 1083 nt10.7□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 PUS2YGL063W 1113 nt10.69□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.67□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 RRD1YIL153W 1182 nt10.66□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 GBP2YCL011C 1284 nt10.66□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 RTF1YGL244W 1677 nt10.66□□□□□ -0.7
SPC3Q12133 IMP2'YIL154C 1041 nt10.64□□□□□ -0.71
SPC3Q12133 DSK2YMR276W 1122 nt10.63□□□□□ -0.71
SPC3Q12133 DED1YOR204W 1815 nt10.61□□□□□ -0.71
SPC3Q12133 BOP3YNL042W 1191 nt10.6□□□□□ -0.71
SPC3Q12133 YPR011CYPR011C 981 nt10.6□□□□□ -0.71
SPC3Q12133 NCP1YHR042W 2076 nt10.58□□□□□ -0.72
SPC3Q12133 TCD2YKL027W 1344 nt10.58□□□□□ -0.72
SPC3Q12133 FMP52YER004W 696 nt10.54□□□□□ -0.72
SPC3Q12133 FMT1YBL013W 1206 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC3Q12133 PTK1YKL198C 1989 nt10.53□□□□□ -0.72
SPC3Q12133 FMP45YDL222C 930 nt10.51□□□□□ -0.73
SPC3Q12133 YDR433WYDR433W 441 nt10.51□□□□□ -0.73
SPC3Q12133 LCB1YMR296C 1677 nt10.5□□□□□ -0.73
SPC3Q12133 MXR2YCL033C 507 nt10.49□□□□□ -0.73
SPC3Q12133 PCM1YEL058W 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
SPC3Q12133 ERV46YAL042W 1248 nt10.46□□□□□ -0.73
SPC3Q12133 LPX1YOR084W 1164 nt10.45□□□□□ -0.74
SPC3Q12133 ADH2YMR303C 1047 nt10.43□□□□□ -0.74
SPC3Q12133 CWP1YKL096W 720 nt10.42□□□□□ -0.74
SPC3Q12133 SOR2YDL246C 1074 nt10.4□□□□□ -0.74
SPC3Q12133 SOR1YJR159W 1074 nt10.4□□□□□ -0.74
SPC3Q12133 YKR040CYKR040C 504 nt10.4□□□□□ -0.74
SPC3Q12133 SIM1YIL123W 1431 nt10.38□□□□□ -0.75
SPC3Q12133 UME6YDR207C 2511 nt10.37□□□□□ -0.75
SPC3Q12133 SNF6YHL025W 999 nt10.36□□□□□ -0.75
SPC3Q12133 YCL042WYCL042W 360 nt10.35□□□□□ -0.75
SPC3Q12133 FRD1YEL047C 1413 nt10.34□□□□□ -0.75
SPC3Q12133 BIO4YNR057C 714 nt10.33□□□□□ -0.76
SPC3Q12133 LYS4YDR234W 2082 nt10.3□□□□□ -0.76
SPC3Q12133 YFL054CYFL054C 1941 nt10.3□□□□□ -0.76
SPC3Q12133 YIH1YCR059C 777 nt10.26□□□□□ -0.77
SPC3Q12133 SPT8YLR055C 1809 nt10.23□□□□□ -0.77
SPC3Q12133 RNQ1YCL028W 1218 nt10.22□□□□□ -0.77
SPC3Q12133 YLL053CYLL053C 459 nt10.2□□□□□ -0.78
SPC3Q12133 BOR1YNL275W 1731 nt10.2□□□□□ -0.78
SPC3Q12133 YJL225CYJL225C 5277 nt10.19□□□□□ -0.78
SPC3Q12133 ERF2YLR246W 1080 nt10.18□□□□□ -0.78
SPC3Q12133 CRR1YLR213C 1269 nt10.17□□□□□ -0.78
SPC3Q12133 SPP1YPL138C 1062 nt10.16□□□□□ -0.78
SPC3Q12133 DIC1YLR348C 897 nt10.14□□□□□ -0.79
SPC3Q12133 MOT3YMR070W 1473 nt10.12□□□□□ -0.79
SPC3Q12133 ATF2YGR177C 1608 nt10.11□□□□□ -0.79
SPC3Q12133 FTR1YER145C 1215 nt10.11□□□□□ -0.79
SPC3Q12133 SWE1YJL187C 2460 nt10.08□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 PTH1YHR189W 573 nt10.08□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 GAL1YBR020W 1587 nt10.07□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 YFL067WYFL067W 528 nt10.06□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 MIC10YCL057C-A 294 nt10.06□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 TRM5YHR070W 1500 nt10.06□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 HEM12YDR047W 1089 nt10.05□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.04□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 SNG1YGR197C 1644 nt10.04□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 YLR235CYLR235C 399 nt10.03□□□□□ -0.8
SPC3Q12133 DDR2YOL052C-A 186 nt10□□□□□ -0.81
SPC3Q12133 TIM23YNR017W 669 nt9.99□□□□□ -0.81
SPC3Q12133 AQY1YPR192W 918 nt9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.3 ms