Protein–RNA interactions for Protein: Q12110

YLR049C, Uncharacterized protein YLR049C, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR049CQ12110 ART5YGR068C 1761 nt12.03□□□□□ -0.48
YLR049CQ12110 YOL037CYOL037C 354 nt12.02□□□□□ -0.49
YLR049CQ12110 YOR139CYOR139C 393 nt12.02□□□□□ -0.49
YLR049CQ12110 GFD2YCL036W 1701 nt12□□□□□ -0.49
YLR049CQ12110 SDH1YKL148C 1923 nt11.99□□□□□ -0.49
YLR049CQ12110 IRC15YPL017C 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
YLR049CQ12110 NPL3YDR432W 1245 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR049CQ12110 TIR4YOR009W 1464 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR049CQ12110 PET9YBL030C 957 nt11.94□□□□□ -0.5
YLR049CQ12110 TAT1YBR069C 1860 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR049CQ12110 GIS3YLR094C 1509 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR049CQ12110 YCH1YGR203W 447 nt11.89□□□□□ -0.51
YLR049CQ12110 SCC4YER147C 1875 nt11.89□□□□□ -0.51
YLR049CQ12110 RTS2YOR077W 699 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR049CQ12110 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.87□□□□□ -0.51
YLR049CQ12110 YMR057CYMR057C 372 nt11.82□□□□□ -0.52
YLR049CQ12110 YJL152WYJL152W 360 nt11.8□□□□□ -0.52
YLR049CQ12110 YLR281CYLR281C 468 nt11.77□□□□□ -0.53
YLR049CQ12110 CUE1YMR264W 612 nt11.76□□□□□ -0.53
YLR049CQ12110 WHI5YOR083W 888 nt11.76□□□□□ -0.53
YLR049CQ12110 FPS1YLL043W 2010 nt11.72□□□□□ -0.53
YLR049CQ12110 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR049CQ12110 YSC84YHR016C 1407 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR049CQ12110 YIL100WYIL100W 354 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR049CQ12110 SEC11YIR022W 504 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR049CQ12110 YLR236CYLR236C 324 nt11.6□□□□□ -0.55
YLR049CQ12110 PCH2YBR186W 1695 nt11.59□□□□□ -0.55
YLR049CQ12110 YHL050CYHL050C 2094 nt11.58□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 PUS2YGL063W 1113 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.57□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 RRT12YCR045C 1476 nt11.56□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 IDH1YNL037C 1083 nt11.54□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 GUT2YIL155C 1950 nt11.54□□□□□ -0.56
YLR049CQ12110 YNL195CYNL195C 786 nt11.51□□□□□ -0.57
YLR049CQ12110 DSK2YMR276W 1122 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR049CQ12110 IMP2'YIL154C 1041 nt11.49□□□□□ -0.57
YLR049CQ12110 GBP2YCL011C 1284 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR049CQ12110 YPR011CYPR011C 981 nt11.45□□□□□ -0.58
YLR049CQ12110 RRD1YIL153W 1182 nt11.43□□□□□ -0.58
YLR049CQ12110 PIB2YGL023C 1908 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR049CQ12110 DED1YOR204W 1815 nt11.38□□□□□ -0.59
YLR049CQ12110 TCD2YKL027W 1344 nt11.37□□□□□ -0.59
YLR049CQ12110 Q0182Q0182 405 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR049CQ12110 YDR433WYDR433W 441 nt11.35□□□□□ -0.59
YLR049CQ12110 FMP45YDL222C 930 nt11.33□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 RTF1YGL244W 1677 nt11.32□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 FMP52YER004W 696 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 MXR2YCL033C 507 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 FMT1YBL013W 1206 nt11.29□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 ERV46YAL042W 1248 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 LPX1YOR084W 1164 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR049CQ12110 BOP3YNL042W 1191 nt11.27□□□□□ -0.61
YLR049CQ12110 NCP1YHR042W 2076 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR049CQ12110 PCM1YEL058W 1674 nt11.22□□□□□ -0.61
YLR049CQ12110 YKR040CYKR040C 504 nt11.22□□□□□ -0.61
YLR049CQ12110 LCB1YMR296C 1677 nt11.2□□□□□ -0.62
YLR049CQ12110 CWP1YKL096W 720 nt11.18□□□□□ -0.62
YLR049CQ12110 ADH2YMR303C 1047 nt11.18□□□□□ -0.62
YLR049CQ12110 PTK1YKL198C 1989 nt11.17□□□□□ -0.62
YLR049CQ12110 SOR2YDL246C 1074 nt11.17□□□□□ -0.62
YLR049CQ12110 SOR1YJR159W 1074 nt11.17□□□□□ -0.62
YLR049CQ12110 YCL042WYCL042W 360 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR049CQ12110 FRD1YEL047C 1413 nt11.13□□□□□ -0.63
YLR049CQ12110 SNF6YHL025W 999 nt11.12□□□□□ -0.63
YLR049CQ12110 SIM1YIL123W 1431 nt11.11□□□□□ -0.63
YLR049CQ12110 MOT3YMR070W 1473 nt11.11□□□□□ -0.63
YLR049CQ12110 BIO4YNR057C 714 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR049CQ12110 PAC11YDR488C 1602 nt11.01□□□□□ -0.65
YLR049CQ12110 YIH1YCR059C 777 nt10.99□□□□□ -0.65
YLR049CQ12110 SPP1YPL138C 1062 nt10.99□□□□□ -0.65
YLR049CQ12110 LYS4YDR234W 2082 nt10.99□□□□□ -0.65
YLR049CQ12110 RNQ1YCL028W 1218 nt10.97□□□□□ -0.65
YLR049CQ12110 YFL054CYFL054C 1941 nt10.94□□□□□ -0.66
YLR049CQ12110 YLL053CYLL053C 459 nt10.93□□□□□ -0.66
YLR049CQ12110 DIC1YLR348C 897 nt10.9□□□□□ -0.66
YLR049CQ12110 PTH1YHR189W 573 nt10.88□□□□□ -0.67
YLR049CQ12110 ERF2YLR246W 1080 nt10.88□□□□□ -0.67
YLR049CQ12110 CRR1YLR213C 1269 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR049CQ12110 SPT8YLR055C 1809 nt10.86□□□□□ -0.67
YLR049CQ12110 FTR1YER145C 1215 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR049CQ12110 ATF2YGR177C 1608 nt10.83□□□□□ -0.68
YLR049CQ12110 YLR235CYLR235C 399 nt10.82□□□□□ -0.68
YLR049CQ12110 MRPL8YJL063C 717 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR049CQ12110 GAL1YBR020W 1587 nt10.81□□□□□ -0.68
YLR049CQ12110 TRM5YHR070W 1500 nt10.79□□□□□ -0.68
YLR049CQ12110 YFL067WYFL067W 528 nt10.77□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 TIM23YNR017W 669 nt10.76□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 HEM12YDR047W 1089 nt10.75□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 MIC10YCL057C-A 294 nt10.75□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 SNG1YGR197C 1644 nt10.73□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.72□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 YKL030WYKL030W 606 nt10.72□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 YLR179CYLR179C 606 nt10.72□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 DDR2YOL052C-A 186 nt10.72□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 AQY1YPR192W 918 nt10.71□□□□□ -0.69
YLR049CQ12110 SWE1YJL187C 2460 nt10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms