Protein–RNA interactions for Protein: Q12108

RTC5, Restriction of telomere capping protein 5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTC5Q12108 RKM5YLR137W 1104 nt11.17□□□□□ -0.62
RTC5Q12108 YOR139CYOR139C 393 nt11.17□□□□□ -0.62
RTC5Q12108 YOL037CYOL037C 354 nt11.16□□□□□ -0.62
RTC5Q12108 RPP2AYOL039W 321 nt11.16□□□□□ -0.62
RTC5Q12108 NPL3YDR432W 1245 nt11.15□□□□□ -0.62
RTC5Q12108 CCT6YDR188W 1641 nt11.12□□□□□ -0.63
RTC5Q12108 YBR220CYBR220C 1683 nt11.11□□□□□ -0.63
RTC5Q12108 YDL221WYDL221W 552 nt11.11□□□□□ -0.63
RTC5Q12108 PTP1YDL230W 1008 nt11.1□□□□□ -0.63
RTC5Q12108 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.09□□□□□ -0.63
RTC5Q12108 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.09□□□□□ -0.63
RTC5Q12108 SDH1YKL148C 1923 nt11.04□□□□□ -0.64
RTC5Q12108 SIS1YNL007C 1059 nt11.04□□□□□ -0.64
RTC5Q12108 CAC2YML102W 1407 nt11.03□□□□□ -0.64
RTC5Q12108 SCC4YER147C 1875 nt10.91□□□□□ -0.66
RTC5Q12108 IRC15YPL017C 1500 nt10.9□□□□□ -0.66
RTC5Q12108 RPM1RPM1 483 nt10.9□□□□□ -0.66
RTC5Q12108 SEC11YIR022W 504 nt10.87□□□□□ -0.67
RTC5Q12108 GFD2YCL036W 1701 nt10.84□□□□□ -0.67
RTC5Q12108 PET9YBL030C 957 nt10.84□□□□□ -0.67
RTC5Q12108 ART5YGR068C 1761 nt10.83□□□□□ -0.68
RTC5Q12108 YLR281CYLR281C 468 nt10.83□□□□□ -0.68
RTC5Q12108 GIS3YLR094C 1509 nt10.83□□□□□ -0.68
RTC5Q12108 YCH1YGR203W 447 nt10.82□□□□□ -0.68
RTC5Q12108 PCH2YBR186W 1695 nt10.79□□□□□ -0.68
RTC5Q12108 WHI5YOR083W 888 nt10.78□□□□□ -0.68
RTC5Q12108 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.77□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.75□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.75□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.75□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.75□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.75□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 GUT2YIL155C 1950 nt10.75□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 RTS2YOR077W 699 nt10.74□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 CUE1YMR264W 612 nt10.72□□□□□ -0.69
RTC5Q12108 PUS2YGL063W 1113 nt10.69□□□□□ -0.7
RTC5Q12108 TIR4YOR009W 1464 nt10.68□□□□□ -0.7
RTC5Q12108 BOR1YNL275W 1731 nt10.68□□□□□ -0.7
RTC5Q12108 IMP2'YIL154C 1041 nt10.66□□□□□ -0.7
RTC5Q12108 YSC84YHR016C 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
RTC5Q12108 YJL152WYJL152W 360 nt10.63□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 YNL195CYNL195C 786 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 MCH5YOR306C 1566 nt10.6□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 YIL100WYIL100W 354 nt10.59□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 YMR057CYMR057C 372 nt10.59□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 DSK2YMR276W 1122 nt10.59□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 YHL050CYHL050C 2094 nt10.59□□□□□ -0.71
RTC5Q12108 RRT12YCR045C 1476 nt10.55□□□□□ -0.72
RTC5Q12108 YLR236CYLR236C 324 nt10.55□□□□□ -0.72
RTC5Q12108 PIB2YGL023C 1908 nt10.53□□□□□ -0.72
RTC5Q12108 IDH1YNL037C 1083 nt10.53□□□□□ -0.72
RTC5Q12108 RTF1YGL244W 1677 nt10.51□□□□□ -0.73
RTC5Q12108 BOP3YNL042W 1191 nt10.48□□□□□ -0.73
RTC5Q12108 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.48□□□□□ -0.73
RTC5Q12108 FMP45YDL222C 930 nt10.42□□□□□ -0.74
RTC5Q12108 YPR011CYPR011C 981 nt10.41□□□□□ -0.74
RTC5Q12108 GBP2YCL011C 1284 nt10.39□□□□□ -0.75
RTC5Q12108 ERV46YAL042W 1248 nt10.37□□□□□ -0.75
RTC5Q12108 YDR433WYDR433W 441 nt10.32□□□□□ -0.76
RTC5Q12108 PTK1YKL198C 1989 nt10.31□□□□□ -0.76
RTC5Q12108 TCD2YKL027W 1344 nt10.31□□□□□ -0.76
RTC5Q12108 LPX1YOR084W 1164 nt10.3□□□□□ -0.76
RTC5Q12108 NCP1YHR042W 2076 nt10.29□□□□□ -0.76
RTC5Q12108 ALG12YNR030W 1656 nt10.29□□□□□ -0.76
RTC5Q12108 YKR040CYKR040C 504 nt10.27□□□□□ -0.77
RTC5Q12108 FMP52YER004W 696 nt10.23□□□□□ -0.77
RTC5Q12108 RRD1YIL153W 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
RTC5Q12108 DED1YOR204W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
RTC5Q12108 MXR2YCL033C 507 nt10.19□□□□□ -0.78
RTC5Q12108 LCB1YMR296C 1677 nt10.16□□□□□ -0.78
RTC5Q12108 YFL054CYFL054C 1941 nt10.15□□□□□ -0.79
RTC5Q12108 SOR2YDL246C 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
RTC5Q12108 SOR1YJR159W 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
RTC5Q12108 YCL042WYCL042W 360 nt10.1□□□□□ -0.79
RTC5Q12108 SSN3YPL042C 1668 nt10.09□□□□□ -0.79
RTC5Q12108 PCM1YEL058W 1674 nt10.09□□□□□ -0.79
RTC5Q12108 FRD1YEL047C 1413 nt10.07□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 FMT1YBL013W 1206 nt10.07□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 SPT8YLR055C 1809 nt10.07□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 SIM1YIL123W 1431 nt10.07□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 HSP60YLR259C 1719 nt10.06□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 SPP1YPL138C 1062 nt10.04□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 FRE6YLL051C 2139 nt10.04□□□□□ -0.8
RTC5Q12108 MRPL8YJL063C 717 nt10.02□□□□□ -0.81
RTC5Q12108 SNF6YHL025W 999 nt10□□□□□ -0.81
RTC5Q12108 CWP1YKL096W 720 nt10□□□□□ -0.81
RTC5Q12108 ADH2YMR303C 1047 nt9.97□□□□□ -0.81
RTC5Q12108 BIO4YNR057C 714 nt9.97□□□□□ -0.81
RTC5Q12108 LYS4YDR234W 2082 nt9.96□□□□□ -0.81
RTC5Q12108 NAR1YNL240C 1476 nt9.95□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 YLR235CYLR235C 399 nt9.94□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 RTG1YOL067C 534 nt9.93□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 ADO1YJR105W 1023 nt9.92□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 ERF2YLR246W 1080 nt9.92□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.91□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 YEL076CYEL076C 651 nt9.91□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 YLR464WYLR464W 651 nt9.91□□□□□ -0.82
RTC5Q12108 SWE1YJL187C 2460 nt9.89□□□□□ -0.83
RTC5Q12108 YIH1YCR059C 777 nt9.89□□□□□ -0.83
RTC5Q12108 HSL7YBR133C 2484 nt9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.4 ms