Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 PAC11YDR488C 1602 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG41Q12048 GUT2YIL155C 1950 nt10.97□□□□□ -0.65
ATG41Q12048 SEC11YIR022W 504 nt10.95□□□□□ -0.66
ATG41Q12048 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG41Q12048 RTS2YOR077W 699 nt10.93□□□□□ -0.66
ATG41Q12048 YSC84YHR016C 1407 nt10.9□□□□□ -0.66
ATG41Q12048 YGR021WYGR021W 873 nt10.89□□□□□ -0.67
ATG41Q12048 HOM6YJR139C 1080 nt10.86□□□□□ -0.67
ATG41Q12048 SHU1YHL006C 453 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG41Q12048 PET9YBL030C 957 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG41Q12048 YHL050CYHL050C 2094 nt10.84□□□□□ -0.67
ATG41Q12048 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG41Q12048 PIB2YGL023C 1908 nt10.83□□□□□ -0.68
ATG41Q12048 TIR4YOR009W 1464 nt10.8□□□□□ -0.68
ATG41Q12048 CUE1YMR264W 612 nt10.79□□□□□ -0.68
ATG41Q12048 RRT12YCR045C 1476 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG41Q12048 MNP1YGL068W 585 nt10.77□□□□□ -0.69
ATG41Q12048 YCH1YGR203W 447 nt10.74□□□□□ -0.69
ATG41Q12048 RTF1YGL244W 1677 nt10.72□□□□□ -0.69
ATG41Q12048 YMR057CYMR057C 372 nt10.71□□□□□ -0.69
ATG41Q12048 RKM5YLR137W 1104 nt10.7□□□□□ -0.7
ATG41Q12048 FPS1YLL043W 2010 nt10.66□□□□□ -0.7
ATG41Q12048 YNL195CYNL195C 786 nt10.65□□□□□ -0.7
ATG41Q12048 YIL100WYIL100W 354 nt10.64□□□□□ -0.71
ATG41Q12048 BOP3YNL042W 1191 nt10.6□□□□□ -0.71
ATG41Q12048 PTK1YKL198C 1989 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG41Q12048 NPL3YDR432W 1245 nt10.58□□□□□ -0.72
ATG41Q12048 YLR236CYLR236C 324 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG41Q12048 NVJ2YPR091C 2313 nt10.56□□□□□ -0.72
ATG41Q12048 NCP1YHR042W 2076 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG41Q12048 YJL152WYJL152W 360 nt10.51□□□□□ -0.73
ATG41Q12048 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.48□□□□□ -0.73
ATG41Q12048 YKL097CYKL097C 411 nt10.46□□□□□ -0.73
ATG41Q12048 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.45□□□□□ -0.74
ATG41Q12048 LCB1YMR296C 1677 nt10.37□□□□□ -0.75
ATG41Q12048 YOL037CYOL037C 354 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG41Q12048 YFL054CYFL054C 1941 nt10.35□□□□□ -0.75
ATG41Q12048 SPT8YLR055C 1809 nt10.29□□□□□ -0.76
ATG41Q12048 RRD1YIL153W 1182 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG41Q12048 WHI5YOR083W 888 nt10.21□□□□□ -0.77
ATG41Q12048 DED1YOR204W 1815 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 IDH1YNL037C 1083 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 YOR139CYOR139C 393 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 GBP2YCL011C 1284 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 LYS4YDR234W 2082 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 SIM1YIL123W 1431 nt10.16□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 PCM1YEL058W 1674 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 FMP52YER004W 696 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 YLR281CYLR281C 468 nt10.15□□□□□ -0.78
ATG41Q12048 BOR1YNL275W 1731 nt10.14□□□□□ -0.79
ATG41Q12048 FMT1YBL013W 1206 nt10.11□□□□□ -0.79
ATG41Q12048 SWE1YJL187C 2460 nt10.11□□□□□ -0.79
ATG41Q12048 TCD2YKL027W 1344 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG41Q12048 BIO4YNR057C 714 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG41Q12048 ADH2YMR303C 1047 nt10.06□□□□□ -0.8
ATG41Q12048 CWP1YKL096W 720 nt10.04□□□□□ -0.8
ATG41Q12048 SNF6YHL025W 999 nt10.03□□□□□ -0.8
ATG41Q12048 HSP60YLR259C 1719 nt9.97□□□□□ -0.81
ATG41Q12048 MXR2YCL033C 507 nt9.97□□□□□ -0.81
ATG41Q12048 YDR433WYDR433W 441 nt9.95□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 DSK2YMR276W 1122 nt9.94□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 SOR2YDL246C 1074 nt9.93□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 IMP2'YIL154C 1041 nt9.93□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 SOR1YJR159W 1074 nt9.93□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 CRR1YLR213C 1269 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 ERF2YLR246W 1080 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 PUS2YGL063W 1113 nt9.91□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 FMP45YDL222C 930 nt9.9□□□□□ -0.82
ATG41Q12048 YPR011CYPR011C 981 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 UME6YDR207C 2511 nt9.89□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 YIH1YCR059C 777 nt9.88□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 YCL042WYCL042W 360 nt9.88□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.87□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 YLL053CYLL053C 459 nt9.86□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 GLK1YCL040W 1503 nt9.86□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 MIC10YCL057C-A 294 nt9.85□□□□□ -0.83
ATG41Q12048 ATF2YGR177C 1608 nt9.83□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 FUR4YBR021W 1902 nt9.83□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 FRD1YEL047C 1413 nt9.82□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 HEM12YDR047W 1089 nt9.82□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 RNQ1YCL028W 1218 nt9.82□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 LPX1YOR084W 1164 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 ERV46YAL042W 1248 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 CCA1YER168C 1641 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 SNG1YGR197C 1644 nt9.78□□□□□ -0.84
ATG41Q12048 ALG12YNR030W 1656 nt9.77□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 YKR040CYKR040C 504 nt9.76□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 RAX1YOR301W 1308 nt9.76□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 FTR1YER145C 1215 nt9.75□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 YFL067WYFL067W 528 nt9.74□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 TRM5YHR070W 1500 nt9.73□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 GAL1YBR020W 1587 nt9.72□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 MCH5YOR306C 1566 nt9.71□□□□□ -0.85
ATG41Q12048 DIC1YLR348C 897 nt9.71□□□□□ -0.86
ATG41Q12048 YJL225CYJL225C 5277 nt9.71□□□□□ -0.86
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