Protein–RNA interactions for Protein: Q12026

YLR053C, Putative uncharacterized protein YLR053C, yeastyeast

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR053CQ12026 IRC15YPL017C 1500 nt12.52□□□□□ -0.4
YLR053CQ12026 YKL097CYKL097C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR053CQ12026 ART5YGR068C 1761 nt12.48□□□□□ -0.41
YLR053CQ12026 GFD2YCL036W 1701 nt12.48□□□□□ -0.41
YLR053CQ12026 RKM5YLR137W 1104 nt12.47□□□□□ -0.41
YLR053CQ12026 SCC4YER147C 1875 nt12.45□□□□□ -0.42
YLR053CQ12026 GIS3YLR094C 1509 nt12.43□□□□□ -0.42
YLR053CQ12026 PET9YBL030C 957 nt12.38□□□□□ -0.43
YLR053CQ12026 RTS2YOR077W 699 nt12.36□□□□□ -0.43
YLR053CQ12026 TIR4YOR009W 1464 nt12.34□□□□□ -0.43
YLR053CQ12026 YCH1YGR203W 447 nt12.3□□□□□ -0.44
YLR053CQ12026 SEC11YIR022W 504 nt12.24□□□□□ -0.45
YLR053CQ12026 CUE1YMR264W 612 nt12.24□□□□□ -0.45
YLR053CQ12026 PCH2YBR186W 1695 nt12.24□□□□□ -0.45
YLR053CQ12026 NPL3YDR432W 1245 nt12.23□□□□□ -0.45
YLR053CQ12026 YMR057CYMR057C 372 nt12.23□□□□□ -0.45
YLR053CQ12026 YSC84YHR016C 1407 nt12.2□□□□□ -0.46
YLR053CQ12026 GUT2YIL155C 1950 nt12.19□□□□□ -0.46
YLR053CQ12026 YOL037CYOL037C 354 nt12.18□□□□□ -0.46
YLR053CQ12026 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.15□□□□□ -0.46
YLR053CQ12026 FPS1YLL043W 2010 nt12.15□□□□□ -0.47
YLR053CQ12026 YHL050CYHL050C 2094 nt12.14□□□□□ -0.47
YLR053CQ12026 YJL152WYJL152W 360 nt12.1□□□□□ -0.47
YLR053CQ12026 RRT12YCR045C 1476 nt12.09□□□□□ -0.47
YLR053CQ12026 YOR139CYOR139C 393 nt12.09□□□□□ -0.47
YLR053CQ12026 YIL100WYIL100W 354 nt12.07□□□□□ -0.48
YLR053CQ12026 PIB2YGL023C 1908 nt12.04□□□□□ -0.48
YLR053CQ12026 YLR236CYLR236C 324 nt12.02□□□□□ -0.49
YLR053CQ12026 YNL195CYNL195C 786 nt12.01□□□□□ -0.49
YLR053CQ12026 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.99□□□□□ -0.49
YLR053CQ12026 WHI5YOR083W 888 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR053CQ12026 YLR281CYLR281C 468 nt11.94□□□□□ -0.5
YLR053CQ12026 RTF1YGL244W 1677 nt11.94□□□□□ -0.5
YLR053CQ12026 PAC11YDR488C 1602 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR053CQ12026 BOP3YNL042W 1191 nt11.86□□□□□ -0.51
YLR053CQ12026 NCP1YHR042W 2076 nt11.8□□□□□ -0.52
YLR053CQ12026 RRD1YIL153W 1182 nt11.79□□□□□ -0.52
YLR053CQ12026 IDH1YNL037C 1083 nt11.79□□□□□ -0.52
YLR053CQ12026 PTK1YKL198C 1989 nt11.78□□□□□ -0.52
YLR053CQ12026 GBP2YCL011C 1284 nt11.75□□□□□ -0.53
YLR053CQ12026 DED1YOR204W 1815 nt11.71□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 PUS2YGL063W 1113 nt11.7□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 LCB1YMR296C 1677 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 FMP52YER004W 696 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 IMP2'YIL154C 1041 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 TCD2YKL027W 1344 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 DSK2YMR276W 1122 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR053CQ12026 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 FMT1YBL013W 1206 nt11.64□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 YPR011CYPR011C 981 nt11.62□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 PCM1YEL058W 1674 nt11.6□□□□□ -0.55
YLR053CQ12026 YDR433WYDR433W 441 nt11.56□□□□□ -0.56
YLR053CQ12026 FMP45YDL222C 930 nt11.55□□□□□ -0.56
YLR053CQ12026 MXR2YCL033C 507 nt11.55□□□□□ -0.56
YLR053CQ12026 SIM1YIL123W 1431 nt11.53□□□□□ -0.56
YLR053CQ12026 ADH2YMR303C 1047 nt11.53□□□□□ -0.56
YLR053CQ12026 YFL054CYFL054C 1941 nt11.52□□□□□ -0.56
YLR053CQ12026 CWP1YKL096W 720 nt11.51□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 ERV46YAL042W 1248 nt11.49□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 SOR2YDL246C 1074 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 SNF6YHL025W 999 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 SOR1YJR159W 1074 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 LPX1YOR084W 1164 nt11.47□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 BIO4YNR057C 714 nt11.46□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 LYS4YDR234W 2082 nt11.46□□□□□ -0.57
YLR053CQ12026 SPT8YLR055C 1809 nt11.46□□□□□ -0.58
YLR053CQ12026 YKR040CYKR040C 504 nt11.42□□□□□ -0.58
YLR053CQ12026 YCL042WYCL042W 360 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR053CQ12026 FRD1YEL047C 1413 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR053CQ12026 YIH1YCR059C 777 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR053CQ12026 NVJ2YPR091C 2313 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR053CQ12026 ERF2YLR246W 1080 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR053CQ12026 RNQ1YCL028W 1218 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR053CQ12026 YJL225CYJL225C 5277 nt11.29□□□□□ -0.6
YLR053CQ12026 YLL053CYLL053C 459 nt11.29□□□□□ -0.6
YLR053CQ12026 CRR1YLR213C 1269 nt11.29□□□□□ -0.6
YLR053CQ12026 SWE1YJL187C 2460 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR053CQ12026 ATF2YGR177C 1608 nt11.21□□□□□ -0.61
YLR053CQ12026 DIC1YLR348C 897 nt11.2□□□□□ -0.62
YLR053CQ12026 FTR1YER145C 1215 nt11.18□□□□□ -0.62
YLR053CQ12026 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.17□□□□□ -0.62
YLR053CQ12026 MIC10YCL057C-A 294 nt11.17□□□□□ -0.62
YLR053CQ12026 HEM12YDR047W 1089 nt11.16□□□□□ -0.62
YLR053CQ12026 GAL1YBR020W 1587 nt11.15□□□□□ -0.62
YLR053CQ12026 SNG1YGR197C 1644 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR053CQ12026 TRM5YHR070W 1500 nt11.14□□□□□ -0.63
YLR053CQ12026 YFL067WYFL067W 528 nt11.13□□□□□ -0.63
YLR053CQ12026 SPP1YPL138C 1062 nt11.12□□□□□ -0.63
YLR053CQ12026 BOR1YNL275W 1731 nt11.09□□□□□ -0.63
YLR053CQ12026 PTH1YHR189W 573 nt11.08□□□□□ -0.64
YLR053CQ12026 DDR2YOL052C-A 186 nt11.07□□□□□ -0.64
YLR053CQ12026 RAX1YOR301W 1308 nt11.06□□□□□ -0.64
YLR053CQ12026 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.04□□□□□ -0.64
YLR053CQ12026 YLR235CYLR235C 399 nt11.03□□□□□ -0.64
YLR053CQ12026 AQY1YPR192W 918 nt11.03□□□□□ -0.64
YLR053CQ12026 CCA1YER168C 1641 nt11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms