Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 IMP2'YIL154C 1041 nt12.41□□□□□ -0.42
CLP1Q08685 DSK2YMR276W 1122 nt12.41□□□□□ -0.42
CLP1Q08685 YJL152WYJL152W 360 nt12.38□□□□□ -0.43
CLP1Q08685 MOT3YMR070W 1473 nt12.38□□□□□ -0.43
CLP1Q08685 YPS1YLR120C 1710 nt12.37□□□□□ -0.43
CLP1Q08685 FMP45YDL222C 930 nt12.37□□□□□ -0.43
CLP1Q08685 YDR095CYDR095C 411 nt12.33□□□□□ -0.44
CLP1Q08685 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.32□□□□□ -0.44
CLP1Q08685 YCH1YGR203W 447 nt12.24□□□□□ -0.45
CLP1Q08685 YLR236CYLR236C 324 nt12.24□□□□□ -0.45
CLP1Q08685 SIS1YNL007C 1059 nt12.23□□□□□ -0.45
CLP1Q08685 YPR011CYPR011C 981 nt12.23□□□□□ -0.45
CLP1Q08685 SSA4YER103W 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
CLP1Q08685 IDH1YNL037C 1083 nt12.22□□□□□ -0.45
CLP1Q08685 RPP2AYOL039W 321 nt12.15□□□□□ -0.46
CLP1Q08685 YDR433WYDR433W 441 nt12.11□□□□□ -0.47
CLP1Q08685 TIR4YOR009W 1464 nt12.08□□□□□ -0.47
CLP1Q08685 LPX1YOR084W 1164 nt12.07□□□□□ -0.48
CLP1Q08685 GBP2YCL011C 1284 nt12.05□□□□□ -0.48
CLP1Q08685 ERV46YAL042W 1248 nt12.04□□□□□ -0.48
CLP1Q08685 MEP2YNL142W 1500 nt12.04□□□□□ -0.48
CLP1Q08685 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.03□□□□□ -0.48
CLP1Q08685 ART5YGR068C 1761 nt12.02□□□□□ -0.48
CLP1Q08685 PET9YBL030C 957 nt12□□□□□ -0.49
CLP1Q08685 MRPL8YJL063C 717 nt11.99□□□□□ -0.49
CLP1Q08685 YMR057CYMR057C 372 nt11.99□□□□□ -0.49
CLP1Q08685 CAC2YML102W 1407 nt11.99□□□□□ -0.49
CLP1Q08685 YKR040CYKR040C 504 nt11.98□□□□□ -0.49
CLP1Q08685 PTP1YDL230W 1008 nt11.94□□□□□ -0.5
CLP1Q08685 ADO1YJR105W 1023 nt11.92□□□□□ -0.5
CLP1Q08685 GFD2YCL036W 1701 nt11.91□□□□□ -0.5
CLP1Q08685 SPP1YPL138C 1062 nt11.9□□□□□ -0.5
CLP1Q08685 TCD2YKL027W 1344 nt11.89□□□□□ -0.51
CLP1Q08685 MXR2YCL033C 507 nt11.89□□□□□ -0.51
CLP1Q08685 DCW1YKL046C 1350 nt11.84□□□□□ -0.51
CLP1Q08685 BDF1YLR399C 2061 nt11.83□□□□□ -0.52
CLP1Q08685 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.81□□□□□ -0.52
CLP1Q08685 YEL076CYEL076C 651 nt11.81□□□□□ -0.52
CLP1Q08685 YLR464WYLR464W 651 nt11.81□□□□□ -0.52
CLP1Q08685 YMR090WYMR090W 684 nt11.78□□□□□ -0.52
CLP1Q08685 RTS2YOR077W 699 nt11.78□□□□□ -0.52
CLP1Q08685 Q0182Q0182 405 nt11.76□□□□□ -0.53
CLP1Q08685 EMI2YDR516C 1503 nt11.76□□□□□ -0.53
CLP1Q08685 RTG1YOL067C 534 nt11.73□□□□□ -0.53
CLP1Q08685 YCL042WYCL042W 360 nt11.7□□□□□ -0.54
CLP1Q08685 HUA1YGR268C 597 nt11.69□□□□□ -0.54
CLP1Q08685 YDL221WYDL221W 552 nt11.67□□□□□ -0.54
CLP1Q08685 CUE1YMR264W 612 nt11.66□□□□□ -0.54
CLP1Q08685 TAT1YBR069C 1860 nt11.66□□□□□ -0.54
CLP1Q08685 RRD1YIL153W 1182 nt11.64□□□□□ -0.55
CLP1Q08685 DED1YOR204W 1815 nt11.64□□□□□ -0.55
CLP1Q08685 YIL100WYIL100W 354 nt11.63□□□□□ -0.55
CLP1Q08685 IRC15YPL017C 1500 nt11.63□□□□□ -0.55
CLP1Q08685 FRD1YEL047C 1413 nt11.62□□□□□ -0.55
CLP1Q08685 PTH1YHR189W 573 nt11.58□□□□□ -0.56
CLP1Q08685 YLR235CYLR235C 399 nt11.57□□□□□ -0.56
CLP1Q08685 GIS3YLR094C 1509 nt11.56□□□□□ -0.56
CLP1Q08685 YBR220CYBR220C 1683 nt11.56□□□□□ -0.56
CLP1Q08685 UBX6YJL048C 1191 nt11.56□□□□□ -0.56
CLP1Q08685 SOR2YDL246C 1074 nt11.52□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 FMP52YER004W 696 nt11.52□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 SOR1YJR159W 1074 nt11.52□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 YKL030WYKL030W 606 nt11.52□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 CWP1YKL096W 720 nt11.5□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 FMT1YBL013W 1206 nt11.5□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 UME6YDR207C 2511 nt11.48□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 SDH1YKL148C 1923 nt11.47□□□□□ -0.57
CLP1Q08685 YDR094WYDR094W 336 nt11.42□□□□□ -0.58
CLP1Q08685 YNL195CYNL195C 786 nt11.42□□□□□ -0.58
CLP1Q08685 LCB1YMR296C 1677 nt11.41□□□□□ -0.58
CLP1Q08685 ADH2YMR303C 1047 nt11.41□□□□□ -0.58
CLP1Q08685 RPM1RPM1 483 nt11.39□□□□□ -0.59
CLP1Q08685 SNF6YHL025W 999 nt11.38□□□□□ -0.59
CLP1Q08685 TIM23YNR017W 669 nt11.34□□□□□ -0.59
CLP1Q08685 PCM1YEL058W 1674 nt11.33□□□□□ -0.6
CLP1Q08685 DIC1YLR348C 897 nt11.32□□□□□ -0.6
CLP1Q08685 YLR179CYLR179C 606 nt11.28□□□□□ -0.6
CLP1Q08685 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.25□□□□□ -0.61
CLP1Q08685 YPR064WYPR064W 420 nt11.25□□□□□ -0.61
CLP1Q08685 RNQ1YCL028W 1218 nt11.23□□□□□ -0.61
CLP1Q08685 PCH2YBR186W 1695 nt11.2□□□□□ -0.62
CLP1Q08685 YIH1YCR059C 777 nt11.18□□□□□ -0.62
CLP1Q08685 SEC11YIR022W 504 nt11.17□□□□□ -0.62
CLP1Q08685 GUT2YIL155C 1950 nt11.17□□□□□ -0.62
CLP1Q08685 RRT12YCR045C 1476 nt11.17□□□□□ -0.62
CLP1Q08685 RRT5YFR032C 870 nt11.15□□□□□ -0.62
CLP1Q08685 TAD3YLR316C 969 nt11.14□□□□□ -0.63
CLP1Q08685 YSC84YHR016C 1407 nt11.14□□□□□ -0.63
CLP1Q08685 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.12□□□□□ -0.63
CLP1Q08685 SIM1YIL123W 1431 nt11.11□□□□□ -0.63
CLP1Q08685 YFR018CYFR018C 1092 nt11.1□□□□□ -0.63
CLP1Q08685 YLL053CYLL053C 459 nt11.1□□□□□ -0.63
CLP1Q08685 AQY1YPR192W 918 nt11.08□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 PAU16YKL224C 372 nt11.07□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 YHL050CYHL050C 2094 nt11.06□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 AHT1YHR093W 549 nt11.06□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 BIO4YNR057C 714 nt11.06□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 WSC2YNL283C 1512 nt11.04□□□□□ -0.64
CLP1Q08685 FTR1YER145C 1215 nt11.03□□□□□ -0.64
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