Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 WHI5YOR083W 888 nt13.2□□□□□ -0.3
ABP140Q08641 PAC11YDR488C 1602 nt13.2□□□□□ -0.3
ABP140Q08641 SIS1YNL007C 1059 nt13.16□□□□□ -0.3
ABP140Q08641 TAT1YBR069C 1860 nt13.13□□□□□ -0.31
ABP140Q08641 PUS2YGL063W 1113 nt13.13□□□□□ -0.31
ABP140Q08641 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.12□□□□□ -0.31
ABP140Q08641 RPP2AYOL039W 321 nt13.1□□□□□ -0.31
ABP140Q08641 PTP1YDL230W 1008 nt13.06□□□□□ -0.32
ABP140Q08641 DCW1YKL046C 1350 nt13.03□□□□□ -0.32
ABP140Q08641 TIR4YOR009W 1464 nt12.98□□□□□ -0.33
ABP140Q08641 YJL152WYJL152W 360 nt12.97□□□□□ -0.33
ABP140Q08641 ART5YGR068C 1761 nt12.96□□□□□ -0.34
ABP140Q08641 YCH1YGR203W 447 nt12.94□□□□□ -0.34
ABP140Q08641 CAC2YML102W 1407 nt12.94□□□□□ -0.34
ABP140Q08641 DSK2YMR276W 1122 nt12.92□□□□□ -0.34
ABP140Q08641 YPR011CYPR011C 981 nt12.92□□□□□ -0.34
ABP140Q08641 GFD2YCL036W 1701 nt12.89□□□□□ -0.35
ABP140Q08641 IMP2'YIL154C 1041 nt12.89□□□□□ -0.35
ABP140Q08641 YLR236CYLR236C 324 nt12.89□□□□□ -0.35
ABP140Q08641 PET9YBL030C 957 nt12.88□□□□□ -0.35
ABP140Q08641 EMI2YDR516C 1503 nt12.86□□□□□ -0.35
ABP140Q08641 YMR057CYMR057C 372 nt12.82□□□□□ -0.36
ABP140Q08641 FMP45YDL222C 930 nt12.8□□□□□ -0.36
ABP140Q08641 YDL221WYDL221W 552 nt12.78□□□□□ -0.36
ABP140Q08641 IDH1YNL037C 1083 nt12.78□□□□□ -0.36
ABP140Q08641 NVJ2YPR091C 2313 nt12.74□□□□□ -0.37
ABP140Q08641 IRC15YPL017C 1500 nt12.74□□□□□ -0.37
ABP140Q08641 YMR090WYMR090W 684 nt12.73□□□□□ -0.37
ABP140Q08641 MOT3YMR070W 1473 nt12.72□□□□□ -0.37
ABP140Q08641 RTS2YOR077W 699 nt12.72□□□□□ -0.37
ABP140Q08641 YBR220CYBR220C 1683 nt12.7□□□□□ -0.38
ABP140Q08641 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.69□□□□□ -0.38
ABP140Q08641 GBP2YCL011C 1284 nt12.68□□□□□ -0.38
ABP140Q08641 LPX1YOR084W 1164 nt12.66□□□□□ -0.38
ABP140Q08641 FPS1YLL043W 2010 nt12.66□□□□□ -0.38
ABP140Q08641 ERV46YAL042W 1248 nt12.65□□□□□ -0.38
ABP140Q08641 GIS3YLR094C 1509 nt12.64□□□□□ -0.39
ABP140Q08641 YDR433WYDR433W 441 nt12.63□□□□□ -0.39
ABP140Q08641 CUE1YMR264W 612 nt12.61□□□□□ -0.39
ABP140Q08641 SDH1YKL148C 1923 nt12.6□□□□□ -0.39
ABP140Q08641 MXR2YCL033C 507 nt12.55□□□□□ -0.4
ABP140Q08641 SCC4YER147C 1875 nt12.55□□□□□ -0.4
ABP140Q08641 YKR040CYKR040C 504 nt12.54□□□□□ -0.4
ABP140Q08641 TCD2YKL027W 1344 nt12.52□□□□□ -0.41
ABP140Q08641 RRD1YIL153W 1182 nt12.5□□□□□ -0.41
ABP140Q08641 DED1YOR204W 1815 nt12.48□□□□□ -0.41
ABP140Q08641 PCH2YBR186W 1695 nt12.47□□□□□ -0.41
ABP140Q08641 SPP1YPL138C 1062 nt12.46□□□□□ -0.41
ABP140Q08641 YIL100WYIL100W 354 nt12.43□□□□□ -0.42
ABP140Q08641 GUT2YIL155C 1950 nt12.42□□□□□ -0.42
ABP140Q08641 FMT1YBL013W 1206 nt12.37□□□□□ -0.43
ABP140Q08641 SEC11YIR022W 504 nt12.35□□□□□ -0.43
ABP140Q08641 FRD1YEL047C 1413 nt12.34□□□□□ -0.43
ABP140Q08641 FMP52YER004W 696 nt12.29□□□□□ -0.44
ABP140Q08641 SOR2YDL246C 1074 nt12.28□□□□□ -0.44
ABP140Q08641 SOR1YJR159W 1074 nt12.28□□□□□ -0.44
ABP140Q08641 YCL042WYCL042W 360 nt12.26□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 MRPL8YJL063C 717 nt12.24□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 RRT12YCR045C 1476 nt12.23□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 RTG1YOL067C 534 nt12.23□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 YNL195CYNL195C 786 nt12.22□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 YSC84YHR016C 1407 nt12.21□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 CWP1YKL096W 720 nt12.21□□□□□ -0.45
ABP140Q08641 ADH2YMR303C 1047 nt12.2□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 YHL050CYHL050C 2094 nt12.18□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.17□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 YEL076CYEL076C 651 nt12.17□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 YLR464WYLR464W 651 nt12.17□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 PCM1YEL058W 1674 nt12.16□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 PIB2YGL023C 1908 nt12.15□□□□□ -0.46
ABP140Q08641 PTH1YHR189W 573 nt12.13□□□□□ -0.47
ABP140Q08641 ADO1YJR105W 1023 nt12.11□□□□□ -0.47
ABP140Q08641 RTF1YGL244W 1677 nt12.09□□□□□ -0.47
ABP140Q08641 SNF6YHL025W 999 nt12.08□□□□□ -0.48
ABP140Q08641 YLR235CYLR235C 399 nt12.07□□□□□ -0.48
ABP140Q08641 YKL030WYKL030W 606 nt12.02□□□□□ -0.49
ABP140Q08641 HUA1YGR268C 597 nt11.99□□□□□ -0.49
ABP140Q08641 DIC1YLR348C 897 nt11.99□□□□□ -0.49
ABP140Q08641 LCB1YMR296C 1677 nt11.98□□□□□ -0.49
ABP140Q08641 YIH1YCR059C 777 nt11.98□□□□□ -0.49
ABP140Q08641 RNQ1YCL028W 1218 nt11.98□□□□□ -0.49
ABP140Q08641 SIM1YIL123W 1431 nt11.94□□□□□ -0.5
ABP140Q08641 BIO4YNR057C 714 nt11.93□□□□□ -0.5
ABP140Q08641 BOR1YNL275W 1731 nt11.93□□□□□ -0.5
ABP140Q08641 BOP3YNL042W 1191 nt11.92□□□□□ -0.5
ABP140Q08641 TIM23YNR017W 669 nt11.92□□□□□ -0.5
ABP140Q08641 PTK1YKL198C 1989 nt11.88□□□□□ -0.51
ABP140Q08641 YLL053CYLL053C 459 nt11.87□□□□□ -0.51
ABP140Q08641 NCP1YHR042W 2076 nt11.86□□□□□ -0.51
ABP140Q08641 YLR179CYLR179C 606 nt11.85□□□□□ -0.51
ABP140Q08641 UME6YDR207C 2511 nt11.82□□□□□ -0.52
ABP140Q08641 FTR1YER145C 1215 nt11.8□□□□□ -0.52
ABP140Q08641 WSC2YNL283C 1512 nt11.77□□□□□ -0.52
ABP140Q08641 UBX6YJL048C 1191 nt11.77□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 GAL1YBR020W 1587 nt11.76□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 AHT1YHR093W 549 nt11.75□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 YPR064WYPR064W 420 nt11.75□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 TRM5YHR070W 1500 nt11.73□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 AQY1YPR192W 918 nt11.73□□□□□ -0.53
ABP140Q08641 ERF2YLR246W 1080 nt11.72□□□□□ -0.53
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