Protein–RNA interactions for Protein: Q08622

GEP3, Genetic interactor of prohibitins 3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEP3Q08622 YMR090WYMR090W 684 nt9.74□□□□□ -0.85
GEP3Q08622 RPP2AYOL039W 321 nt9.73□□□□□ -0.85
GEP3Q08622 HOM6YJR139C 1080 nt9.71□□□□□ -0.86
GEP3Q08622 EMI2YDR516C 1503 nt9.7□□□□□ -0.86
GEP3Q08622 SIS1YNL007C 1059 nt9.65□□□□□ -0.86
GEP3Q08622 YBR220CYBR220C 1683 nt9.64□□□□□ -0.87
GEP3Q08622 PTP1YDL230W 1008 nt9.64□□□□□ -0.87
GEP3Q08622 YDL221WYDL221W 552 nt9.62□□□□□ -0.87
GEP3Q08622 MNP1YGL068W 585 nt9.58□□□□□ -0.88
GEP3Q08622 CAC2YML102W 1407 nt9.57□□□□□ -0.88
GEP3Q08622 RKM5YLR137W 1104 nt9.57□□□□□ -0.88
GEP3Q08622 YOL037CYOL037C 354 nt9.57□□□□□ -0.88
GEP3Q08622 SDH1YKL148C 1923 nt9.53□□□□□ -0.88
GEP3Q08622 YCH1YGR203W 447 nt9.49□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.48□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.48□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.48□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.48□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.48□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 ART5YGR068C 1761 nt9.47□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 PET9YBL030C 957 nt9.47□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 GFD2YCL036W 1701 nt9.46□□□□□ -0.89
GEP3Q08622 IRC15YPL017C 1500 nt9.46□□□□□ -0.9
GEP3Q08622 SCC4YER147C 1875 nt9.45□□□□□ -0.9
GEP3Q08622 PCH2YBR186W 1695 nt9.42□□□□□ -0.9
GEP3Q08622 GUT2YIL155C 1950 nt9.41□□□□□ -0.9
GEP3Q08622 GIS3YLR094C 1509 nt9.41□□□□□ -0.9
GEP3Q08622 SEC11YIR022W 504 nt9.38□□□□□ -0.91
GEP3Q08622 TIR4YOR009W 1464 nt9.37□□□□□ -0.91
GEP3Q08622 RTS2YOR077W 699 nt9.36□□□□□ -0.91
GEP3Q08622 CUE1YMR264W 612 nt9.33□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.32□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 PUS2YGL063W 1113 nt9.3□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 PIB2YGL023C 1908 nt9.29□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 YJL152WYJL152W 360 nt9.29□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 YMR057CYMR057C 372 nt9.29□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 RPM1RPM1 483 nt9.29□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 YLR281CYLR281C 468 nt9.28□□□□□ -0.92
GEP3Q08622 YIL100WYIL100W 354 nt9.25□□□□□ -0.93
GEP3Q08622 YLR236CYLR236C 324 nt9.23□□□□□ -0.93
GEP3Q08622 YNL195CYNL195C 786 nt9.23□□□□□ -0.93
GEP3Q08622 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.23□□□□□ -0.93
GEP3Q08622 FRE6YLL051C 2139 nt9.23□□□□□ -0.93
GEP3Q08622 YSC84YHR016C 1407 nt9.22□□□□□ -0.93
GEP3Q08622 WHI5YOR083W 888 nt9.2□□□□□ -0.94
GEP3Q08622 YHL050CYHL050C 2094 nt9.14□□□□□ -0.95
GEP3Q08622 RTF1YGL244W 1677 nt9.13□□□□□ -0.95
GEP3Q08622 RRT12YCR045C 1476 nt9.1□□□□□ -0.95
GEP3Q08622 IMP2'YIL154C 1041 nt9.1□□□□□ -0.95
GEP3Q08622 MRPL8YJL063C 717 nt9.1□□□□□ -0.95
GEP3Q08622 IDH1YNL037C 1083 nt9.1□□□□□ -0.95
GEP3Q08622 UME6YDR207C 2511 nt9.07□□□□□ -0.96
GEP3Q08622 FMP45YDL222C 930 nt9.05□□□□□ -0.96
GEP3Q08622 DSK2YMR276W 1122 nt9.05□□□□□ -0.96
GEP3Q08622 BOR1YNL275W 1731 nt9.04□□□□□ -0.96
GEP3Q08622 PTK1YKL198C 1989 nt9.04□□□□□ -0.96
GEP3Q08622 BOP3YNL042W 1191 nt9.03□□□□□ -0.96
GEP3Q08622 GBP2YCL011C 1284 nt9.02□□□□□ -0.97
GEP3Q08622 FMP52YER004W 696 nt8.98□□□□□ -0.97
GEP3Q08622 ADO1YJR105W 1023 nt8.98□□□□□ -0.97
GEP3Q08622 TCD2YKL027W 1344 nt8.98□□□□□ -0.97
GEP3Q08622 RRD1YIL153W 1182 nt8.94□□□□□ -0.98
GEP3Q08622 YPR011CYPR011C 981 nt8.92□□□□□ -0.98
GEP3Q08622 YDR433WYDR433W 441 nt8.89□□□□□ -0.99
GEP3Q08622 DED1YOR204W 1815 nt8.88□□□□□ -0.99
GEP3Q08622 NCP1YHR042W 2076 nt8.88□□□□□ -0.99
GEP3Q08622 PCM1YEL058W 1674 nt8.84□□□□□ -0.99
GEP3Q08622 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.83□□□□□ -1
GEP3Q08622 YEL076CYEL076C 651 nt8.83□□□□□ -1
GEP3Q08622 YLR464WYLR464W 651 nt8.83□□□□□ -1
GEP3Q08622 LCB1YMR296C 1677 nt8.83□□□□□ -1
GEP3Q08622 ERV46YAL042W 1248 nt8.82□□□□□ -1
GEP3Q08622 YCL042WYCL042W 360 nt8.81□□□□□ -1
GEP3Q08622 SIM1YIL123W 1431 nt8.8□□□□□ -1
GEP3Q08622 SNF6YHL025W 999 nt8.8□□□□□ -1
GEP3Q08622 SOR2YDL246C 1074 nt8.79□□□□□ -1
GEP3Q08622 SOR1YJR159W 1074 nt8.79□□□□□ -1
GEP3Q08622 CWP1YKL096W 720 nt8.79□□□□□ -1
GEP3Q08622 YKR040CYKR040C 504 nt8.79□□□□□ -1
GEP3Q08622 FMT1YBL013W 1206 nt8.79□□□□□ -1
GEP3Q08622 YFL054CYFL054C 1941 nt8.79□□□□□ -1
GEP3Q08622 MXR2YCL033C 507 nt8.78□□□□□ -1
GEP3Q08622 SPT8YLR055C 1809 nt8.77□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 MCH5YOR306C 1566 nt8.77□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 UBX6YJL048C 1191 nt8.76□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 ADH2YMR303C 1047 nt8.76□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 LPX1YOR084W 1164 nt8.76□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 BIO4YNR057C 714 nt8.72□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 RTG1YOL067C 534 nt8.72□□□□□ -1.01
GEP3Q08622 ALG12YNR030W 1656 nt8.7□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 SPP1YPL138C 1062 nt8.69□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 FRD1YEL047C 1413 nt8.68□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 YIH1YCR059C 777 nt8.67□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 ERF2YLR246W 1080 nt8.67□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 HUA1YGR268C 597 nt8.66□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 BSP1YPR171W 1731 nt8.66□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 SSN3YPL042C 1668 nt8.65□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 LYS4YDR234W 2082 nt8.65□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 RNQ1YCL028W 1218 nt8.65□□□□□ -1.02
GEP3Q08622 HSP60YLR259C 1719 nt8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms