Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 BDF1YLR399C 2061 nt11.32□□□□□ -0.6
BRX1Q08235 EMI2YDR516C 1503 nt11.29□□□□□ -0.6
BRX1Q08235 CAC2YML102W 1407 nt11.26□□□□□ -0.61
BRX1Q08235 YMR090WYMR090W 684 nt11.24□□□□□ -0.61
BRX1Q08235 UME6YDR207C 2511 nt11.19□□□□□ -0.62
BRX1Q08235 ART5YGR068C 1761 nt11.19□□□□□ -0.62
BRX1Q08235 YDL221WYDL221W 552 nt11.19□□□□□ -0.62
BRX1Q08235 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.15□□□□□ -0.62
BRX1Q08235 GFD2YCL036W 1701 nt11.15□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 PET9YBL030C 957 nt11.14□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 TIR4YOR009W 1464 nt11.13□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 YCH1YGR203W 447 nt11.13□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 TAT1YBR069C 1860 nt11.12□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 YLR281CYLR281C 468 nt11.12□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 WHI5YOR083W 888 nt11.1□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 IRC15YPL017C 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 YBR220CYBR220C 1683 nt11.09□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 YJL152WYJL152W 360 nt11.09□□□□□ -0.63
BRX1Q08235 SDH1YKL148C 1923 nt11.07□□□□□ -0.64
BRX1Q08235 YMR057CYMR057C 372 nt11.04□□□□□ -0.64
BRX1Q08235 RTS2YOR077W 699 nt11.02□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 GIS3YLR094C 1509 nt11.02□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 SCC4YER147C 1875 nt11□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.98□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.98□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.98□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.98□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.98□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 PUS2YGL063W 1113 nt10.97□□□□□ -0.65
BRX1Q08235 CUE1YMR264W 612 nt10.94□□□□□ -0.66
BRX1Q08235 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.9□□□□□ -0.66
BRX1Q08235 IMP2'YIL154C 1041 nt10.88□□□□□ -0.67
BRX1Q08235 IDH1YNL037C 1083 nt10.86□□□□□ -0.67
BRX1Q08235 DSK2YMR276W 1122 nt10.85□□□□□ -0.67
BRX1Q08235 YLR236CYLR236C 324 nt10.83□□□□□ -0.68
BRX1Q08235 YIL100WYIL100W 354 nt10.82□□□□□ -0.68
BRX1Q08235 RPM1RPM1 483 nt10.81□□□□□ -0.68
BRX1Q08235 GBP2YCL011C 1284 nt10.79□□□□□ -0.68
BRX1Q08235 YPR011CYPR011C 981 nt10.78□□□□□ -0.68
BRX1Q08235 YSC84YHR016C 1407 nt10.73□□□□□ -0.69
BRX1Q08235 SEC11YIR022W 504 nt10.72□□□□□ -0.69
BRX1Q08235 YNL195CYNL195C 786 nt10.72□□□□□ -0.69
BRX1Q08235 RRT12YCR045C 1476 nt10.69□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 YDR433WYDR433W 441 nt10.69□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 TCD2YKL027W 1344 nt10.68□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 FMP45YDL222C 930 nt10.68□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 RRD1YIL153W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 YHL050CYHL050C 2094 nt10.67□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 PCH2YBR186W 1695 nt10.66□□□□□ -0.7
BRX1Q08235 ERV46YAL042W 1248 nt10.64□□□□□ -0.71
BRX1Q08235 DED1YOR204W 1815 nt10.63□□□□□ -0.71
BRX1Q08235 LPX1YOR084W 1164 nt10.62□□□□□ -0.71
BRX1Q08235 MXR2YCL033C 507 nt10.61□□□□□ -0.71
BRX1Q08235 GUT2YIL155C 1950 nt10.6□□□□□ -0.71
BRX1Q08235 YKR040CYKR040C 504 nt10.59□□□□□ -0.71
BRX1Q08235 FMP52YER004W 696 nt10.57□□□□□ -0.72
BRX1Q08235 FMT1YBL013W 1206 nt10.55□□□□□ -0.72
BRX1Q08235 Q0182Q0182 405 nt10.54□□□□□ -0.72
BRX1Q08235 MCH5YOR306C 1566 nt10.5□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 MOT3YMR070W 1473 nt10.49□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 YCL042WYCL042W 360 nt10.47□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 PCM1YEL058W 1674 nt10.47□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 SOR2YDL246C 1074 nt10.46□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 SOR1YJR159W 1074 nt10.46□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 CWP1YKL096W 720 nt10.46□□□□□ -0.73
BRX1Q08235 ADH2YMR303C 1047 nt10.45□□□□□ -0.74
BRX1Q08235 FRD1YEL047C 1413 nt10.44□□□□□ -0.74
BRX1Q08235 PIB2YGL023C 1908 nt10.43□□□□□ -0.74
BRX1Q08235 RTF1YGL244W 1677 nt10.43□□□□□ -0.74
BRX1Q08235 BOP3YNL042W 1191 nt10.41□□□□□ -0.74
BRX1Q08235 SNF6YHL025W 999 nt10.4□□□□□ -0.74
BRX1Q08235 BOR1YNL275W 1731 nt10.38□□□□□ -0.75
BRX1Q08235 SPP1YPL138C 1062 nt10.37□□□□□ -0.75
BRX1Q08235 LCB1YMR296C 1677 nt10.37□□□□□ -0.75
BRX1Q08235 NCP1YHR042W 2076 nt10.37□□□□□ -0.75
BRX1Q08235 SIM1YIL123W 1431 nt10.34□□□□□ -0.75
BRX1Q08235 BIO4YNR057C 714 nt10.29□□□□□ -0.76
BRX1Q08235 YIH1YCR059C 777 nt10.28□□□□□ -0.76
BRX1Q08235 RNQ1YCL028W 1218 nt10.27□□□□□ -0.77
BRX1Q08235 PTK1YKL198C 1989 nt10.26□□□□□ -0.77
BRX1Q08235 PTH1YHR189W 573 nt10.23□□□□□ -0.77
BRX1Q08235 DIC1YLR348C 897 nt10.22□□□□□ -0.77
BRX1Q08235 YLR235CYLR235C 399 nt10.21□□□□□ -0.77
BRX1Q08235 YLL053CYLL053C 459 nt10.2□□□□□ -0.78
BRX1Q08235 ERF2YLR246W 1080 nt10.16□□□□□ -0.78
BRX1Q08235 LYS4YDR234W 2082 nt10.15□□□□□ -0.78
BRX1Q08235 FTR1YER145C 1215 nt10.13□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 YKL030WYKL030W 606 nt10.13□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 YJL225CYJL225C 5277 nt10.13□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 TIM23YNR017W 669 nt10.12□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 RTG1YOL067C 534 nt10.12□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 CRR1YLR213C 1269 nt10.11□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.11□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.11□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 GAL1YBR020W 1587 nt10.09□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 YFL054CYFL054C 1941 nt10.09□□□□□ -0.79
BRX1Q08235 ATF2YGR177C 1608 nt10.08□□□□□ -0.8
BRX1Q08235 YFL067WYFL067W 528 nt10.07□□□□□ -0.8
BRX1Q08235 YLR179CYLR179C 606 nt10.07□□□□□ -0.8
BRX1Q08235 TRM5YHR070W 1500 nt10.07□□□□□ -0.8
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