Protein–RNA interactions for Protein: Q08219

RRT8, Outer spore wall protein RRT8, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT8Q08219 RKM5YLR137W 1104 nt11.65□□□□□ -0.54
RRT8Q08219 TAT1YBR069C 1860 nt11.65□□□□□ -0.54
RRT8Q08219 SDH1YKL148C 1923 nt11.61□□□□□ -0.55
RRT8Q08219 ART5YGR068C 1761 nt11.59□□□□□ -0.55
RRT8Q08219 GFD2YCL036W 1701 nt11.55□□□□□ -0.56
RRT8Q08219 IRC15YPL017C 1500 nt11.54□□□□□ -0.56
RRT8Q08219 SCC4YER147C 1875 nt11.52□□□□□ -0.57
RRT8Q08219 PET9YBL030C 957 nt11.51□□□□□ -0.57
RRT8Q08219 YCH1YGR203W 447 nt11.48□□□□□ -0.57
RRT8Q08219 RTS2YOR077W 699 nt11.48□□□□□ -0.57
RRT8Q08219 GIS3YLR094C 1509 nt11.48□□□□□ -0.57
RRT8Q08219 TIR4YOR009W 1464 nt11.44□□□□□ -0.58
RRT8Q08219 YOL037CYOL037C 354 nt11.44□□□□□ -0.58
RRT8Q08219 FPS1YLL043W 2010 nt11.4□□□□□ -0.58
RRT8Q08219 YJL152WYJL152W 360 nt11.38□□□□□ -0.59
RRT8Q08219 YMR057CYMR057C 372 nt11.38□□□□□ -0.59
RRT8Q08219 NPL3YDR432W 1245 nt11.36□□□□□ -0.59
RRT8Q08219 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.36□□□□□ -0.59
RRT8Q08219 CUE1YMR264W 612 nt11.36□□□□□ -0.59
RRT8Q08219 SEC11YIR022W 504 nt11.33□□□□□ -0.6
RRT8Q08219 YOR139CYOR139C 393 nt11.3□□□□□ -0.6
RRT8Q08219 YIL100WYIL100W 354 nt11.28□□□□□ -0.6
RRT8Q08219 YSC84YHR016C 1407 nt11.27□□□□□ -0.6
RRT8Q08219 PCH2YBR186W 1695 nt11.27□□□□□ -0.61
RRT8Q08219 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.25□□□□□ -0.61
RRT8Q08219 PAC11YDR488C 1602 nt11.24□□□□□ -0.61
RRT8Q08219 YNL195CYNL195C 786 nt11.24□□□□□ -0.61
RRT8Q08219 YLR236CYLR236C 324 nt11.23□□□□□ -0.61
RRT8Q08219 WHI5YOR083W 888 nt11.2□□□□□ -0.62
RRT8Q08219 GUT2YIL155C 1950 nt11.19□□□□□ -0.62
RRT8Q08219 RRT12YCR045C 1476 nt11.17□□□□□ -0.62
RRT8Q08219 YHL050CYHL050C 2094 nt11.16□□□□□ -0.62
RRT8Q08219 YLR281CYLR281C 468 nt11.16□□□□□ -0.62
RRT8Q08219 MOT3YMR070W 1473 nt11.1□□□□□ -0.63
RRT8Q08219 IDH1YNL037C 1083 nt11.07□□□□□ -0.64
RRT8Q08219 GBP2YCL011C 1284 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT8Q08219 RTF1YGL244W 1677 nt11.01□□□□□ -0.65
RRT8Q08219 PUS2YGL063W 1113 nt11□□□□□ -0.65
RRT8Q08219 NVJ2YPR091C 2313 nt10.99□□□□□ -0.65
RRT8Q08219 IMP2'YIL154C 1041 nt10.98□□□□□ -0.65
RRT8Q08219 BOP3YNL042W 1191 nt10.98□□□□□ -0.65
RRT8Q08219 PIB2YGL023C 1908 nt10.96□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 TCD2YKL027W 1344 nt10.94□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 DSK2YMR276W 1122 nt10.94□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 RRD1YIL153W 1182 nt10.92□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.9□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.9□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.9□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.9□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.9□□□□□ -0.66
RRT8Q08219 YDR433WYDR433W 441 nt10.87□□□□□ -0.67
RRT8Q08219 FMP52YER004W 696 nt10.87□□□□□ -0.67
RRT8Q08219 DED1YOR204W 1815 nt10.84□□□□□ -0.67
RRT8Q08219 NCP1YHR042W 2076 nt10.8□□□□□ -0.68
RRT8Q08219 PTK1YKL198C 1989 nt10.79□□□□□ -0.68
RRT8Q08219 PCM1YEL058W 1674 nt10.79□□□□□ -0.68
RRT8Q08219 YPR011CYPR011C 981 nt10.78□□□□□ -0.68
RRT8Q08219 LCB1YMR296C 1677 nt10.78□□□□□ -0.68
RRT8Q08219 FMP45YDL222C 930 nt10.77□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 MXR2YCL033C 507 nt10.77□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 FMT1YBL013W 1206 nt10.76□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 CWP1YKL096W 720 nt10.75□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 SIM1YIL123W 1431 nt10.75□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 SNF6YHL025W 999 nt10.72□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 ADH2YMR303C 1047 nt10.72□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 YCL042WYCL042W 360 nt10.72□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 ERV46YAL042W 1248 nt10.71□□□□□ -0.69
RRT8Q08219 LPX1YOR084W 1164 nt10.7□□□□□ -0.7
RRT8Q08219 YKR040CYKR040C 504 nt10.69□□□□□ -0.7
RRT8Q08219 YFL054CYFL054C 1941 nt10.67□□□□□ -0.7
RRT8Q08219 SOR2YDL246C 1074 nt10.66□□□□□ -0.7
RRT8Q08219 SOR1YJR159W 1074 nt10.66□□□□□ -0.7
RRT8Q08219 BIO4YNR057C 714 nt10.63□□□□□ -0.71
RRT8Q08219 FRD1YEL047C 1413 nt10.58□□□□□ -0.72
RRT8Q08219 SPT8YLR055C 1809 nt10.54□□□□□ -0.72
RRT8Q08219 YIH1YCR059C 777 nt10.54□□□□□ -0.72
RRT8Q08219 LYS4YDR234W 2082 nt10.53□□□□□ -0.72
RRT8Q08219 ERF2YLR246W 1080 nt10.53□□□□□ -0.72
RRT8Q08219 RNQ1YCL028W 1218 nt10.52□□□□□ -0.73
RRT8Q08219 YJL225CYJL225C 5277 nt10.5□□□□□ -0.73
RRT8Q08219 YLL053CYLL053C 459 nt10.5□□□□□ -0.73
RRT8Q08219 RPM1RPM1 483 nt10.46□□□□□ -0.73
RRT8Q08219 CRR1YLR213C 1269 nt10.45□□□□□ -0.74
RRT8Q08219 DIC1YLR348C 897 nt10.45□□□□□ -0.74
RRT8Q08219 HEM12YDR047W 1089 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT8Q08219 FTR1YER145C 1215 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT8Q08219 YFL067WYFL067W 528 nt10.4□□□□□ -0.74
RRT8Q08219 ATF2YGR177C 1608 nt10.39□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 PTH1YHR189W 573 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 SWE1YJL187C 2460 nt10.38□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 DDR2YOL052C-A 186 nt10.37□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 SPP1YPL138C 1062 nt10.37□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 TRM5YHR070W 1500 nt10.37□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 GAL1YBR020W 1587 nt10.36□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 YLR235CYLR235C 399 nt10.36□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 BOR1YNL275W 1731 nt10.35□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 MIC10YCL057C-A 294 nt10.34□□□□□ -0.75
RRT8Q08219 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.33□□□□□ -0.76
RRT8Q08219 SNG1YGR197C 1644 nt10.33□□□□□ -0.76
RRT8Q08219 TIM23YNR017W 669 nt10.3□□□□□ -0.76
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