Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.43□□□□□ -0.42
LDB18Q07887 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.42□□□□□ -0.42
LDB18Q07887 PUS2YGL063W 1113 nt12.37□□□□□ -0.43
LDB18Q07887 PTP1YDL230W 1008 nt12.36□□□□□ -0.43
LDB18Q07887 DCW1YKL046C 1350 nt12.35□□□□□ -0.43
LDB18Q07887 YJL152WYJL152W 360 nt12.31□□□□□ -0.44
LDB18Q07887 ART5YGR068C 1761 nt12.27□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 YCH1YGR203W 447 nt12.26□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 TIR4YOR009W 1464 nt12.26□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 CAC2YML102W 1407 nt12.25□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 EMI2YDR516C 1503 nt12.24□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 PET9YBL030C 957 nt12.24□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 SSA4YER103W 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 IMP2'YIL154C 1041 nt12.23□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 GFD2YCL036W 1701 nt12.21□□□□□ -0.45
LDB18Q07887 YMR090WYMR090W 684 nt12.2□□□□□ -0.46
LDB18Q07887 DSK2YMR276W 1122 nt12.2□□□□□ -0.46
LDB18Q07887 YDL221WYDL221W 552 nt12.15□□□□□ -0.46
LDB18Q07887 YMR057CYMR057C 372 nt12.14□□□□□ -0.47
LDB18Q07887 IDH1YNL037C 1083 nt12.11□□□□□ -0.47
LDB18Q07887 YLR236CYLR236C 324 nt12.09□□□□□ -0.47
LDB18Q07887 YPR011CYPR011C 981 nt12.08□□□□□ -0.48
LDB18Q07887 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.07□□□□□ -0.48
LDB18Q07887 IRC15YPL017C 1500 nt12.06□□□□□ -0.48
LDB18Q07887 FMP45YDL222C 930 nt12.05□□□□□ -0.48
LDB18Q07887 RTS2YOR077W 699 nt12.05□□□□□ -0.48
LDB18Q07887 GBP2YCL011C 1284 nt12□□□□□ -0.49
LDB18Q07887 GIS3YLR094C 1509 nt11.99□□□□□ -0.49
LDB18Q07887 SDH1YKL148C 1923 nt11.98□□□□□ -0.49
LDB18Q07887 CUE1YMR264W 612 nt11.97□□□□□ -0.49
LDB18Q07887 YBR220CYBR220C 1683 nt11.97□□□□□ -0.49
LDB18Q07887 FPS1YLL043W 2010 nt11.96□□□□□ -0.5
LDB18Q07887 MOT3YMR070W 1473 nt11.95□□□□□ -0.5
LDB18Q07887 YDR433WYDR433W 441 nt11.94□□□□□ -0.5
LDB18Q07887 SCC4YER147C 1875 nt11.93□□□□□ -0.5
LDB18Q07887 ERV46YAL042W 1248 nt11.93□□□□□ -0.5
LDB18Q07887 LPX1YOR084W 1164 nt11.91□□□□□ -0.5
LDB18Q07887 TCD2YKL027W 1344 nt11.87□□□□□ -0.51
LDB18Q07887 YIL100WYIL100W 354 nt11.85□□□□□ -0.51
LDB18Q07887 YKR040CYKR040C 504 nt11.85□□□□□ -0.51
LDB18Q07887 MXR2YCL033C 507 nt11.81□□□□□ -0.52
LDB18Q07887 RRD1YIL153W 1182 nt11.79□□□□□ -0.52
LDB18Q07887 DED1YOR204W 1815 nt11.76□□□□□ -0.53
LDB18Q07887 BDF1YLR399C 2061 nt11.72□□□□□ -0.53
LDB18Q07887 YNL195CYNL195C 786 nt11.69□□□□□ -0.54
LDB18Q07887 FMP52YER004W 696 nt11.68□□□□□ -0.54
LDB18Q07887 SPP1YPL138C 1062 nt11.67□□□□□ -0.54
LDB18Q07887 FMT1YBL013W 1206 nt11.65□□□□□ -0.54
LDB18Q07887 YCL042WYCL042W 360 nt11.64□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 FRD1YEL047C 1413 nt11.62□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 YSC84YHR016C 1407 nt11.61□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 SOR2YDL246C 1074 nt11.61□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 SOR1YJR159W 1074 nt11.61□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 SEC11YIR022W 504 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 TAT1YBR069C 1860 nt11.59□□□□□ -0.55
LDB18Q07887 RRT12YCR045C 1476 nt11.58□□□□□ -0.56
LDB18Q07887 CWP1YKL096W 720 nt11.56□□□□□ -0.56
LDB18Q07887 YHL050CYHL050C 2094 nt11.54□□□□□ -0.56
LDB18Q07887 ADH2YMR303C 1047 nt11.52□□□□□ -0.57
LDB18Q07887 MRPL8YJL063C 717 nt11.51□□□□□ -0.57
LDB18Q07887 PCM1YEL058W 1674 nt11.51□□□□□ -0.57
LDB18Q07887 SNF6YHL025W 999 nt11.47□□□□□ -0.57
LDB18Q07887 RTG1YOL067C 534 nt11.46□□□□□ -0.57
LDB18Q07887 PCH2YBR186W 1695 nt11.46□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 YLR235CYLR235C 399 nt11.44□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.43□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 YEL076CYEL076C 651 nt11.43□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 PTH1YHR189W 573 nt11.43□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 YLR464WYLR464W 651 nt11.43□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 ADO1YJR105W 1023 nt11.42□□□□□ -0.58
LDB18Q07887 GUT2YIL155C 1950 nt11.37□□□□□ -0.59
LDB18Q07887 YKL030WYKL030W 606 nt11.36□□□□□ -0.59
LDB18Q07887 YIH1YCR059C 777 nt11.35□□□□□ -0.59
LDB18Q07887 RNQ1YCL028W 1218 nt11.35□□□□□ -0.59
LDB18Q07887 DIC1YLR348C 897 nt11.34□□□□□ -0.59
LDB18Q07887 SIM1YIL123W 1431 nt11.34□□□□□ -0.59
LDB18Q07887 HUA1YGR268C 597 nt11.31□□□□□ -0.6
LDB18Q07887 BIO4YNR057C 714 nt11.29□□□□□ -0.6
LDB18Q07887 LCB1YMR296C 1677 nt11.29□□□□□ -0.6
LDB18Q07887 TIM23YNR017W 669 nt11.28□□□□□ -0.6
LDB18Q07887 BOP3YNL042W 1191 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB18Q07887 YLL053CYLL053C 459 nt11.24□□□□□ -0.61
LDB18Q07887 RTF1YGL244W 1677 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB18Q07887 YLR179CYLR179C 606 nt11.22□□□□□ -0.61
LDB18Q07887 NCP1YHR042W 2076 nt11.21□□□□□ -0.61
LDB18Q07887 PIB2YGL023C 1908 nt11.17□□□□□ -0.62
LDB18Q07887 FTR1YER145C 1215 nt11.17□□□□□ -0.62
LDB18Q07887 ERF2YLR246W 1080 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB18Q07887 AQY1YPR192W 918 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB18Q07887 YPR064WYPR064W 420 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 GAL1YBR020W 1587 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 TRM5YHR070W 1500 nt11.1□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 AHT1YHR093W 549 nt11.1□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 YFL067WYFL067W 528 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 NVJ2YPR091C 2313 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 WSC2YNL283C 1512 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB18Q07887 CRR1YLR213C 1269 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 YJL225CYJL225C 5277 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 PAC11YDR488C 1602 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 ATF2YGR177C 1608 nt11.07□□□□□ -0.64
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