Protein–RNA interactions for Protein: Q07527

TRM3, tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM3Q07527 SPP1YPL138C 1062 nt18.31■□□□□ 0.52
TRM3Q07527 INM2YDR287W 879 nt18.27■□□□□ 0.52
TRM3Q07527 TRM9YML014W 840 nt18.26■□□□□ 0.51
TRM3Q07527 DAL1YIR027C 1383 nt18.26■□□□□ 0.51
TRM3Q07527 NAB2YGL122C 1578 nt18.26■□□□□ 0.51
TRM3Q07527 RTG1YOL067C 534 nt18.22■□□□□ 0.51
TRM3Q07527 FUN26YAL022C 1554 nt18.22■□□□□ 0.51
TRM3Q07527 PHO4YFR034C 939 nt18.21■□□□□ 0.51
TRM3Q07527 YJL152WYJL152W 360 nt18.13■□□□□ 0.49
TRM3Q07527 ERV46YAL042W 1248 nt18.13■□□□□ 0.49
TRM3Q07527 IDH1YNL037C 1083 nt18.06■□□□□ 0.48
TRM3Q07527 CCT6YDR188W 1641 nt18.06■□□□□ 0.48
TRM3Q07527 YDR433WYDR433W 441 nt18.03■□□□□ 0.48
TRM3Q07527 SIS1YNL007C 1059 nt18.01■□□□□ 0.47
TRM3Q07527 YDR094WYDR094W 336 nt17.93■□□□□ 0.46
TRM3Q07527 SUF2tP(AGG)C 72 nt17.91■□□□□ 0.46
TRM3Q07527 SUF10tP(AGG)N 72 nt17.91■□□□□ 0.46
TRM3Q07527 ALF1YNL148C 765 nt17.89■□□□□ 0.45
TRM3Q07527 HUA1YGR268C 597 nt17.88■□□□□ 0.45
TRM3Q07527 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.87■□□□□ 0.45
TRM3Q07527 MXR2YCL033C 507 nt17.83■□□□□ 0.45
TRM3Q07527 YKR040CYKR040C 504 nt17.79■□□□□ 0.44
TRM3Q07527 GBP2YCL011C 1284 nt17.76■□□□□ 0.43
TRM3Q07527 TIR4YOR009W 1464 nt17.63■□□□□ 0.41
TRM3Q07527 YPS1YLR120C 1710 nt17.56■□□□□ 0.4
TRM3Q07527 SBA1YKL117W 651 nt17.53■□□□□ 0.4
TRM3Q07527 YDR095CYDR095C 411 nt17.48■□□□□ 0.39
TRM3Q07527 PTH1YHR189W 573 nt17.47■□□□□ 0.39
TRM3Q07527 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.46■□□□□ 0.39
TRM3Q07527 TCD2YKL027W 1344 nt17.41■□□□□ 0.38
TRM3Q07527 PAU16YKL224C 372 nt17.38■□□□□ 0.37
TRM3Q07527 FRD1YEL047C 1413 nt17.29■□□□□ 0.36
TRM3Q07527 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt17.29■□□□□ 0.36
TRM3Q07527 CAC2YML102W 1407 nt17.27■□□□□ 0.35
TRM3Q07527 YKL030WYKL030W 606 nt17.24■□□□□ 0.35
TRM3Q07527 YMR057CYMR057C 372 nt17.21■□□□□ 0.34
TRM3Q07527 YLR235CYLR235C 399 nt17.2■□□□□ 0.34
TRM3Q07527 ART5YGR068C 1761 nt17.15■□□□□ 0.34
TRM3Q07527 YCL042WYCL042W 360 nt17.13■□□□□ 0.33
TRM3Q07527 LCB1YMR296C 1677 nt17.13■□□□□ 0.33
TRM3Q07527 RPP2AYOL039W 321 nt17.1■□□□□ 0.33
TRM3Q07527 DED1YOR204W 1815 nt17.08■□□□□ 0.32
TRM3Q07527 PRE6YOL038W 765 nt17.07■□□□□ 0.32
TRM3Q07527 RRT5YFR032C 870 nt17.06■□□□□ 0.32
TRM3Q07527 GFD2YCL036W 1701 nt17.04■□□□□ 0.32
TRM3Q07527 SOR2YDL246C 1074 nt17.02■□□□□ 0.31
TRM3Q07527 SOR1YJR159W 1074 nt17.02■□□□□ 0.31
TRM3Q07527 YFR018CYFR018C 1092 nt17■□□□□ 0.31
TRM3Q07527 RRD1YIL153W 1182 nt17■□□□□ 0.31
TRM3Q07527 PET9YBL030C 957 nt17■□□□□ 0.31
TRM3Q07527 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt16.96■□□□□ 0.31
TRM3Q07527 RTS2YOR077W 699 nt16.94■□□□□ 0.3
TRM3Q07527 SNF6YHL025W 999 nt16.9■□□□□ 0.3
TRM3Q07527 PTP1YDL230W 1008 nt16.87■□□□□ 0.29
TRM3Q07527 DIC1YLR348C 897 nt16.84■□□□□ 0.29
TRM3Q07527 FMT1YBL013W 1206 nt16.83■□□□□ 0.28
TRM3Q07527 TIM23YNR017W 669 nt16.8■□□□□ 0.28
TRM3Q07527 FPS1YLL043W 2010 nt16.78■□□□□ 0.28
TRM3Q07527 CWP1YKL096W 720 nt16.72■□□□□ 0.27
TRM3Q07527 YLR179CYLR179C 606 nt16.68■□□□□ 0.26
TRM3Q07527 NAT4YMR069W 858 nt16.67■□□□□ 0.26
TRM3Q07527 FMP52YER004W 696 nt16.6■□□□□ 0.25
TRM3Q07527 YPR064WYPR064W 420 nt16.6■□□□□ 0.25
TRM3Q07527 ADH2YMR303C 1047 nt16.57■□□□□ 0.24
TRM3Q07527 MEP2YNL142W 1500 nt16.56■□□□□ 0.24
TRM3Q07527 PEX25YPL112C 1185 nt16.55■□□□□ 0.24
TRM3Q07527 GLK1YCL040W 1503 nt16.52■□□□□ 0.24
TRM3Q07527 CUE1YMR264W 612 nt16.51■□□□□ 0.23
TRM3Q07527 YFL066CYFL066C 1179 nt16.49■□□□□ 0.23
TRM3Q07527 TAD3YLR316C 969 nt16.47■□□□□ 0.23
TRM3Q07527 DCW1YKL046C 1350 nt16.45■□□□□ 0.22
TRM3Q07527 WSC2YNL283C 1512 nt16.41■□□□□ 0.22
TRM3Q07527 YIL100WYIL100W 354 nt16.39■□□□□ 0.21
TRM3Q07527 MSF1YPR047W 1410 nt16.39■□□□□ 0.21
TRM3Q07527 IRC15YPL017C 1500 nt16.35■□□□□ 0.21
TRM3Q07527 YMR244WYMR244W 1068 nt16.34■□□□□ 0.21
TRM3Q07527 YNL115CYNL115C 1935 nt16.3■□□□□ 0.2
TRM3Q07527 AHT1YHR093W 549 nt16.27■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 THI74YDR438W 1113 nt16.26■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 EMI2YDR516C 1503 nt16.25■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 MIR1YJR077C 936 nt16.23■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 PCM1YEL058W 1674 nt16.22■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 YDL221WYDL221W 552 nt16.21■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 GLR1YPL091W 1452 nt16.21■□□□□ 0.19
TRM3Q07527 RNQ1YCL028W 1218 nt16.2■□□□□ 0.18
TRM3Q07527 YSP3YOR003W 1437 nt16.19■□□□□ 0.18
TRM3Q07527 YIH1YCR059C 777 nt16.18■□□□□ 0.18
TRM3Q07527 GIS3YLR094C 1509 nt16.17■□□□□ 0.18
TRM3Q07527 YLR415CYLR415C 339 nt16.16■□□□□ 0.18
TRM3Q07527 BDH1YAL060W 1149 nt16.13■□□□□ 0.17
TRM3Q07527 YSC84YHR016C 1407 nt16.13■□□□□ 0.17
TRM3Q07527 RBG2YGR173W 1107 nt16.09■□□□□ 0.17
TRM3Q07527 AQY1YPR192W 918 nt16.04■□□□□ 0.16
TRM3Q07527 YLL053CYLL053C 459 nt16.01■□□□□ 0.15
TRM3Q07527 VPS75YNL246W 795 nt16.01■□□□□ 0.15
TRM3Q07527 DAT1YML113W 747 nt15.99■□□□□ 0.15
TRM3Q07527 SWC5YBR231C 912 nt15.97■□□□□ 0.15
TRM3Q07527 FTR1YER145C 1215 nt15.96■□□□□ 0.15
TRM3Q07527 PAU7YAR020C 168 nt15.96■□□□□ 0.15
TRM3Q07527 YMR090WYMR090W 684 nt15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.9 ms