Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.07□□□□□ -0.96
RDS3Q06835 SSA4YER103W 1929 nt9.05□□□□□ -0.96
RDS3Q06835 SIS1YNL007C 1059 nt9.01□□□□□ -0.97
RDS3Q06835 DSK2YMR276W 1122 nt8.99□□□□□ -0.97
RDS3Q06835 IMP2'YIL154C 1041 nt8.98□□□□□ -0.97
RDS3Q06835 YPR011CYPR011C 981 nt8.98□□□□□ -0.97
RDS3Q06835 YLR236CYLR236C 324 nt8.95□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 DCW1YKL046C 1350 nt8.95□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 RPP2AYOL039W 321 nt8.94□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 MOT3YMR070W 1473 nt8.94□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 YJL152WYJL152W 360 nt8.93□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 FMP45YDL222C 930 nt8.92□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 PTP1YDL230W 1008 nt8.9□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 YCH1YGR203W 447 nt8.9□□□□□ -0.98
RDS3Q06835 TIR4YOR009W 1464 nt8.89□□□□□ -0.99
RDS3Q06835 YMR090WYMR090W 684 nt8.89□□□□□ -0.99
RDS3Q06835 EMI2YDR516C 1503 nt8.85□□□□□ -0.99
RDS3Q06835 ART5YGR068C 1761 nt8.85□□□□□ -0.99
RDS3Q06835 IDH1YNL037C 1083 nt8.84□□□□□ -0.99
RDS3Q06835 PET9YBL030C 957 nt8.82□□□□□ -1
RDS3Q06835 GFD2YCL036W 1701 nt8.8□□□□□ -1
RDS3Q06835 ERV46YAL042W 1248 nt8.8□□□□□ -1
RDS3Q06835 CAC2YML102W 1407 nt8.8□□□□□ -1
RDS3Q06835 LPX1YOR084W 1164 nt8.79□□□□□ -1
RDS3Q06835 YMR057CYMR057C 372 nt8.77□□□□□ -1.01
RDS3Q06835 YDL221WYDL221W 552 nt8.76□□□□□ -1.01
RDS3Q06835 YDR433WYDR433W 441 nt8.74□□□□□ -1.01
RDS3Q06835 GBP2YCL011C 1284 nt8.74□□□□□ -1.01
RDS3Q06835 YKR040CYKR040C 504 nt8.71□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt8.71□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 YBR220CYBR220C 1683 nt8.7□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 SDH1YKL148C 1923 nt8.68□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 SPP1YPL138C 1062 nt8.67□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 MXR2YCL033C 507 nt8.67□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 IRC15YPL017C 1500 nt8.66□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 MRPL8YJL063C 717 nt8.66□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 FPS1YLL043W 2010 nt8.66□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 RTS2YOR077W 699 nt8.65□□□□□ -1.02
RDS3Q06835 BDF1YLR399C 2061 nt8.65□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 TCD2YKL027W 1344 nt8.63□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 SCC4YER147C 1875 nt8.63□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 GIS3YLR094C 1509 nt8.6□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 DED1YOR204W 1815 nt8.6□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 CUE1YMR264W 612 nt8.6□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 RRD1YIL153W 1182 nt8.59□□□□□ -1.03
RDS3Q06835 RTG1YOL067C 534 nt8.57□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.55□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 YEL076CYEL076C 651 nt8.55□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 ADO1YJR105W 1023 nt8.55□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 YLR464WYLR464W 651 nt8.55□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 TAT1YBR069C 1860 nt8.55□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 FRD1YEL047C 1413 nt8.53□□□□□ -1.04
RDS3Q06835 YIL100WYIL100W 354 nt8.51□□□□□ -1.05
RDS3Q06835 FMT1YBL013W 1206 nt8.5□□□□□ -1.05
RDS3Q06835 YNL195CYNL195C 786 nt8.48□□□□□ -1.05
RDS3Q06835 SOR2YDL246C 1074 nt8.47□□□□□ -1.05
RDS3Q06835 SOR1YJR159W 1074 nt8.47□□□□□ -1.05
RDS3Q06835 FMP52YER004W 696 nt8.46□□□□□ -1.06
RDS3Q06835 SEC11YIR022W 504 nt8.46□□□□□ -1.06
RDS3Q06835 YCL042WYCL042W 360 nt8.46□□□□□ -1.06
RDS3Q06835 YSC84YHR016C 1407 nt8.44□□□□□ -1.06
RDS3Q06835 PCH2YBR186W 1695 nt8.4□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 HUA1YGR268C 597 nt8.39□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 PTH1YHR189W 573 nt8.38□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 CWP1YKL096W 720 nt8.38□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 YLR235CYLR235C 399 nt8.38□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 RRT12YCR045C 1476 nt8.38□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 ADH2YMR303C 1047 nt8.37□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 YKL030WYKL030W 606 nt8.36□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 YHL050CYHL050C 2094 nt8.34□□□□□ -1.07
RDS3Q06835 UBX6YJL048C 1191 nt8.33□□□□□ -1.08
RDS3Q06835 GUT2YIL155C 1950 nt8.33□□□□□ -1.08
RDS3Q06835 PCM1YEL058W 1674 nt8.33□□□□□ -1.08
RDS3Q06835 LCB1YMR296C 1677 nt8.3□□□□□ -1.08
RDS3Q06835 SNF6YHL025W 999 nt8.29□□□□□ -1.08
RDS3Q06835 YDR094WYDR094W 336 nt8.26□□□□□ -1.09
RDS3Q06835 DIC1YLR348C 897 nt8.25□□□□□ -1.09
RDS3Q06835 YIH1YCR059C 777 nt8.24□□□□□ -1.09
RDS3Q06835 TIM23YNR017W 669 nt8.24□□□□□ -1.09
RDS3Q06835 RNQ1YCL028W 1218 nt8.24□□□□□ -1.09
RDS3Q06835 RTF1YGL244W 1677 nt8.21□□□□□ -1.09
RDS3Q06835 BOP3YNL042W 1191 nt8.21□□□□□ -1.1
RDS3Q06835 YLR179CYLR179C 606 nt8.19□□□□□ -1.1
RDS3Q06835 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.16□□□□□ -1.1
RDS3Q06835 BIO4YNR057C 714 nt8.16□□□□□ -1.1
RDS3Q06835 YLL053CYLL053C 459 nt8.14□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 YPR064WYPR064W 420 nt8.14□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 WSC2YNL283C 1512 nt8.13□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 SIM1YIL123W 1431 nt8.13□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 AHT1YHR093W 549 nt8.13□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 PIB2YGL023C 1908 nt8.12□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 Q0182Q0182 405 nt8.11□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 TAD3YLR316C 969 nt8.11□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 FTR1YER145C 1215 nt8.1□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 AQY1YPR192W 918 nt8.09□□□□□ -1.11
RDS3Q06835 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.08□□□□□ -1.12
RDS3Q06835 YFR018CYFR018C 1092 nt8.08□□□□□ -1.12
RDS3Q06835 GAL1YBR020W 1587 nt8.08□□□□□ -1.12
RDS3Q06835 NCP1YHR042W 2076 nt8.05□□□□□ -1.12
RDS3Q06835 TRM5YHR070W 1500 nt8.04□□□□□ -1.12
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