Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 GFD2YCL036W 1701 nt11.34□□□□□ -0.59
NEJ1Q06148 ART5YGR068C 1761 nt11.32□□□□□ -0.6
NEJ1Q06148 YSC84YHR016C 1407 nt11.32□□□□□ -0.6
NEJ1Q06148 PST2YDR032C 597 nt11.31□□□□□ -0.6
NEJ1Q06148 RTS2YOR077W 699 nt11.28□□□□□ -0.6
NEJ1Q06148 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.27□□□□□ -0.61
NEJ1Q06148 PET9YBL030C 957 nt11.25□□□□□ -0.61
NEJ1Q06148 YGR021WYGR021W 873 nt11.23□□□□□ -0.61
NEJ1Q06148 PIB2YGL023C 1908 nt11.23□□□□□ -0.61
NEJ1Q06148 YHL050CYHL050C 2094 nt11.22□□□□□ -0.61
NEJ1Q06148 RTF1YGL244W 1677 nt11.2□□□□□ -0.62
NEJ1Q06148 YCH1YGR203W 447 nt11.19□□□□□ -0.62
NEJ1Q06148 CUE1YMR264W 612 nt11.19□□□□□ -0.62
NEJ1Q06148 YJL225CYJL225C 5277 nt11.17□□□□□ -0.62
NEJ1Q06148 YNL195CYNL195C 786 nt11.15□□□□□ -0.62
NEJ1Q06148 RRT12YCR045C 1476 nt11.12□□□□□ -0.63
NEJ1Q06148 NVJ2YPR091C 2313 nt11.12□□□□□ -0.63
NEJ1Q06148 HOM6YJR139C 1080 nt11.11□□□□□ -0.63
NEJ1Q06148 BOP3YNL042W 1191 nt11.11□□□□□ -0.63
NEJ1Q06148 TIR4YOR009W 1464 nt11.09□□□□□ -0.63
NEJ1Q06148 YIL100WYIL100W 354 nt11.09□□□□□ -0.63
NEJ1Q06148 YMR057CYMR057C 372 nt11.03□□□□□ -0.64
NEJ1Q06148 PTK1YKL198C 1989 nt10.99□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 FPS1YLL043W 2010 nt10.99□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 SHU1YHL006C 453 nt10.98□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 YLR236CYLR236C 324 nt10.98□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.97□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 MNP1YGL068W 585 nt10.96□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 RKM5YLR137W 1104 nt10.96□□□□□ -0.65
NEJ1Q06148 NCP1YHR042W 2076 nt10.87□□□□□ -0.67
NEJ1Q06148 NPL3YDR432W 1245 nt10.84□□□□□ -0.67
NEJ1Q06148 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.83□□□□□ -0.68
NEJ1Q06148 YJL152WYJL152W 360 nt10.82□□□□□ -0.68
NEJ1Q06148 YFL054CYFL054C 1941 nt10.8□□□□□ -0.68
NEJ1Q06148 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.77□□□□□ -0.69
NEJ1Q06148 SPT8YLR055C 1809 nt10.72□□□□□ -0.69
NEJ1Q06148 YKL097CYKL097C 411 nt10.71□□□□□ -0.69
NEJ1Q06148 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
NEJ1Q06148 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
NEJ1Q06148 BOR1YNL275W 1731 nt10.7□□□□□ -0.7
NEJ1Q06148 LCB1YMR296C 1677 nt10.7□□□□□ -0.7
NEJ1Q06148 YOL037CYOL037C 354 nt10.61□□□□□ -0.71
NEJ1Q06148 FMP52YER004W 696 nt10.54□□□□□ -0.72
NEJ1Q06148 SIM1YIL123W 1431 nt10.52□□□□□ -0.73
NEJ1Q06148 RRD1YIL153W 1182 nt10.52□□□□□ -0.73
NEJ1Q06148 SWE1YJL187C 2460 nt10.52□□□□□ -0.73
NEJ1Q06148 PCM1YEL058W 1674 nt10.48□□□□□ -0.73
NEJ1Q06148 LYS4YDR234W 2082 nt10.48□□□□□ -0.73
NEJ1Q06148 IDH1YNL037C 1083 nt10.47□□□□□ -0.73
NEJ1Q06148 GBP2YCL011C 1284 nt10.44□□□□□ -0.74
NEJ1Q06148 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
NEJ1Q06148 TCD2YKL027W 1344 nt10.42□□□□□ -0.74
NEJ1Q06148 WHI5YOR083W 888 nt10.42□□□□□ -0.74
NEJ1Q06148 DED1YOR204W 1815 nt10.4□□□□□ -0.75
NEJ1Q06148 BIO4YNR057C 714 nt10.39□□□□□ -0.75
NEJ1Q06148 SNF6YHL025W 999 nt10.37□□□□□ -0.75
NEJ1Q06148 UME6YDR207C 2511 nt10.36□□□□□ -0.75
NEJ1Q06148 YLR281CYLR281C 468 nt10.36□□□□□ -0.75
NEJ1Q06148 GLK1YCL040W 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 CWP1YKL096W 720 nt10.33□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 FMT1YBL013W 1206 nt10.33□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 ADH2YMR303C 1047 nt10.33□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 ERF2YLR246W 1080 nt10.32□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 CRR1YLR213C 1269 nt10.28□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 ALG12YNR030W 1656 nt10.28□□□□□ -0.76
NEJ1Q06148 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.26□□□□□ -0.77
NEJ1Q06148 IMP2'YIL154C 1041 nt10.25□□□□□ -0.77
NEJ1Q06148 FUR4YBR021W 1902 nt10.25□□□□□ -0.77
NEJ1Q06148 YOR139CYOR139C 393 nt10.24□□□□□ -0.77
NEJ1Q06148 SOR2YDL246C 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
NEJ1Q06148 SOR1YJR159W 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
NEJ1Q06148 YIH1YCR059C 777 nt10.2□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 HEM12YDR047W 1089 nt10.2□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 YCL042WYCL042W 360 nt10.2□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 MCH5YOR306C 1566 nt10.19□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 YDR433WYDR433W 441 nt10.18□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 RAX1YOR301W 1308 nt10.17□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 DSK2YMR276W 1122 nt10.17□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 CCA1YER168C 1641 nt10.16□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 YLL053CYLL053C 459 nt10.16□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 RNQ1YCL028W 1218 nt10.15□□□□□ -0.78
NEJ1Q06148 MXR2YCL033C 507 nt10.14□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 MIC10YCL057C-A 294 nt10.14□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 PRP4YPR178W 1398 nt10.14□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 ATF2YGR177C 1608 nt10.12□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 YFL067WYFL067W 528 nt10.12□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.11□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 YEL076CYEL076C 651 nt10.11□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 YLR464WYLR464W 651 nt10.11□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 AAC1YMR056C 930 nt10.11□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 SNG1YGR197C 1644 nt10.11□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 FMP45YDL222C 930 nt10.1□□□□□ -0.79
NEJ1Q06148 PUS2YGL063W 1113 nt10.08□□□□□ -0.8
NEJ1Q06148 DPS1YLL018C 1674 nt10.07□□□□□ -0.8
NEJ1Q06148 FTR1YER145C 1215 nt10.06□□□□□ -0.8
NEJ1Q06148 BMT6YLR063W 1098 nt10.06□□□□□ -0.8
NEJ1Q06148 FRD1YEL047C 1413 nt10.03□□□□□ -0.8
NEJ1Q06148 DDR2YOL052C-A 186 nt10.03□□□□□ -0.8
NEJ1Q06148 ERV46YAL042W 1248 nt10.02□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 TRM5YHR070W 1500 nt10.02□□□□□ -0.81
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