Protein–RNA interactions for Protein: Q06091

SNT309, Pre-mRNA-splicing factor SNT309, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT309Q06091 NPL3YDR432W 1245 nt11.13□□□□□ -0.63
SNT309Q06091 YBR220CYBR220C 1683 nt11.12□□□□□ -0.63
SNT309Q06091 Q0182Q0182 405 nt11.12□□□□□ -0.63
SNT309Q06091 YOR139CYOR139C 393 nt11.11□□□□□ -0.63
SNT309Q06091 GFD2YCL036W 1701 nt11.09□□□□□ -0.63
SNT309Q06091 SDH1YKL148C 1923 nt11.09□□□□□ -0.63
SNT309Q06091 PET9YBL030C 957 nt11.08□□□□□ -0.64
SNT309Q06091 BDF1YLR399C 2061 nt11.08□□□□□ -0.64
SNT309Q06091 YCH1YGR203W 447 nt11.07□□□□□ -0.64
SNT309Q06091 IRC15YPL017C 1500 nt11.06□□□□□ -0.64
SNT309Q06091 TIR4YOR009W 1464 nt11.04□□□□□ -0.64
SNT309Q06091 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.02□□□□□ -0.65
SNT309Q06091 YJL152WYJL152W 360 nt11.01□□□□□ -0.65
SNT309Q06091 SCC4YER147C 1875 nt11.01□□□□□ -0.65
SNT309Q06091 GIS3YLR094C 1509 nt11□□□□□ -0.65
SNT309Q06091 RTS2YOR077W 699 nt11□□□□□ -0.65
SNT309Q06091 YMR057CYMR057C 372 nt10.97□□□□□ -0.65
SNT309Q06091 TAT1YBR069C 1860 nt10.95□□□□□ -0.66
SNT309Q06091 YLR281CYLR281C 468 nt10.91□□□□□ -0.66
SNT309Q06091 WHI5YOR083W 888 nt10.91□□□□□ -0.66
SNT309Q06091 CUE1YMR264W 612 nt10.9□□□□□ -0.66
SNT309Q06091 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.85□□□□□ -0.67
SNT309Q06091 FPS1YLL043W 2010 nt10.82□□□□□ -0.68
SNT309Q06091 YIL100WYIL100W 354 nt10.81□□□□□ -0.68
SNT309Q06091 YLR236CYLR236C 324 nt10.79□□□□□ -0.68
SNT309Q06091 SEC11YIR022W 504 nt10.78□□□□□ -0.68
SNT309Q06091 PUS2YGL063W 1113 nt10.76□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 YSC84YHR016C 1407 nt10.75□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 YNL195CYNL195C 786 nt10.75□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 IDH1YNL037C 1083 nt10.73□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 PCH2YBR186W 1695 nt10.72□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.71□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.71□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.71□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.71□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.71□□□□□ -0.69
SNT309Q06091 IMP2'YIL154C 1041 nt10.7□□□□□ -0.7
SNT309Q06091 RRT12YCR045C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
SNT309Q06091 DSK2YMR276W 1122 nt10.67□□□□□ -0.7
SNT309Q06091 GBP2YCL011C 1284 nt10.67□□□□□ -0.7
SNT309Q06091 YHL050CYHL050C 2094 nt10.67□□□□□ -0.7
SNT309Q06091 MOT3YMR070W 1473 nt10.67□□□□□ -0.7
SNT309Q06091 GUT2YIL155C 1950 nt10.65□□□□□ -0.71
SNT309Q06091 TCD2YKL027W 1344 nt10.58□□□□□ -0.71
SNT309Q06091 RRD1YIL153W 1182 nt10.56□□□□□ -0.72
SNT309Q06091 YDR433WYDR433W 441 nt10.55□□□□□ -0.72
SNT309Q06091 YPR011CYPR011C 981 nt10.54□□□□□ -0.72
SNT309Q06091 FMP45YDL222C 930 nt10.5□□□□□ -0.73
SNT309Q06091 DED1YOR204W 1815 nt10.49□□□□□ -0.73
SNT309Q06091 FMP52YER004W 696 nt10.49□□□□□ -0.73
SNT309Q06091 RTF1YGL244W 1677 nt10.47□□□□□ -0.73
SNT309Q06091 MXR2YCL033C 507 nt10.47□□□□□ -0.73
SNT309Q06091 BOP3YNL042W 1191 nt10.46□□□□□ -0.73
SNT309Q06091 ERV46YAL042W 1248 nt10.45□□□□□ -0.74
SNT309Q06091 LPX1YOR084W 1164 nt10.44□□□□□ -0.74
SNT309Q06091 PIB2YGL023C 1908 nt10.44□□□□□ -0.74
SNT309Q06091 FMT1YBL013W 1206 nt10.42□□□□□ -0.74
SNT309Q06091 YKR040CYKR040C 504 nt10.41□□□□□ -0.74
SNT309Q06091 PCM1YEL058W 1674 nt10.39□□□□□ -0.75
SNT309Q06091 CWP1YKL096W 720 nt10.38□□□□□ -0.75
SNT309Q06091 YCL042WYCL042W 360 nt10.38□□□□□ -0.75
SNT309Q06091 ADH2YMR303C 1047 nt10.35□□□□□ -0.75
SNT309Q06091 LCB1YMR296C 1677 nt10.34□□□□□ -0.75
SNT309Q06091 NCP1YHR042W 2076 nt10.34□□□□□ -0.75
SNT309Q06091 SOR2YDL246C 1074 nt10.33□□□□□ -0.76
SNT309Q06091 SNF6YHL025W 999 nt10.33□□□□□ -0.76
SNT309Q06091 SOR1YJR159W 1074 nt10.33□□□□□ -0.76
SNT309Q06091 SIM1YIL123W 1431 nt10.32□□□□□ -0.76
SNT309Q06091 PTK1YKL198C 1989 nt10.29□□□□□ -0.76
SNT309Q06091 FRD1YEL047C 1413 nt10.28□□□□□ -0.76
SNT309Q06091 BIO4YNR057C 714 nt10.23□□□□□ -0.77
SNT309Q06091 PAC11YDR488C 1602 nt10.18□□□□□ -0.78
SNT309Q06091 YIH1YCR059C 777 nt10.18□□□□□ -0.78
SNT309Q06091 RNQ1YCL028W 1218 nt10.16□□□□□ -0.78
SNT309Q06091 YFL054CYFL054C 1941 nt10.15□□□□□ -0.78
SNT309Q06091 SPP1YPL138C 1062 nt10.15□□□□□ -0.78
SNT309Q06091 YLL053CYLL053C 459 nt10.13□□□□□ -0.79
SNT309Q06091 ERF2YLR246W 1080 nt10.11□□□□□ -0.79
SNT309Q06091 DIC1YLR348C 897 nt10.11□□□□□ -0.79
SNT309Q06091 LYS4YDR234W 2082 nt10.11□□□□□ -0.79
SNT309Q06091 PTH1YHR189W 573 nt10.09□□□□□ -0.79
SNT309Q06091 YLR235CYLR235C 399 nt10.07□□□□□ -0.8
SNT309Q06091 CRR1YLR213C 1269 nt10.05□□□□□ -0.8
SNT309Q06091 FTR1YER145C 1215 nt10.04□□□□□ -0.8
SNT309Q06091 SPT8YLR055C 1809 nt10.03□□□□□ -0.8
SNT309Q06091 ATF2YGR177C 1608 nt10.01□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 YFL067WYFL067W 528 nt10.01□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 TRM5YHR070W 1500 nt10□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 GAL1YBR020W 1587 nt10□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 HEM12YDR047W 1089 nt9.99□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 TIM23YNR017W 669 nt9.99□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 DDR2YOL052C-A 186 nt9.99□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 YLR179CYLR179C 606 nt9.97□□□□□ -0.81
SNT309Q06091 YKL030WYKL030W 606 nt9.96□□□□□ -0.82
SNT309Q06091 AQY1YPR192W 918 nt9.96□□□□□ -0.82
SNT309Q06091 YJL225CYJL225C 5277 nt9.95□□□□□ -0.82
SNT309Q06091 MIC10YCL057C-A 294 nt9.94□□□□□ -0.82
SNT309Q06091 SNG1YGR197C 1644 nt9.93□□□□□ -0.82
SNT309Q06091 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.92□□□□□ -0.82
SNT309Q06091 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.3 ms