Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 SDH1YKL148C 1923 nt14.25□□□□□ -0.13
HRQ1Q05549 IRC15YPL017C 1500 nt14.22□□□□□ -0.13
HRQ1Q05549 ART5YGR068C 1761 nt14.21□□□□□ -0.13
HRQ1Q05549 RKM5YLR137W 1104 nt14.19□□□□□ -0.14
HRQ1Q05549 GFD2YCL036W 1701 nt14.17□□□□□ -0.14
HRQ1Q05549 GIS3YLR094C 1509 nt14.12□□□□□ -0.15
HRQ1Q05549 SCC4YER147C 1875 nt14.11□□□□□ -0.15
HRQ1Q05549 RTS2YOR077W 699 nt14.1□□□□□ -0.15
HRQ1Q05549 TIR4YOR009W 1464 nt14.06□□□□□ -0.16
HRQ1Q05549 PET9YBL030C 957 nt14.02□□□□□ -0.17
HRQ1Q05549 YMR057CYMR057C 372 nt13.95□□□□□ -0.18
HRQ1Q05549 NPL3YDR432W 1245 nt13.92□□□□□ -0.18
HRQ1Q05549 YCH1YGR203W 447 nt13.89□□□□□ -0.19
HRQ1Q05549 CUE1YMR264W 612 nt13.88□□□□□ -0.19
HRQ1Q05549 YSC84YHR016C 1407 nt13.85□□□□□ -0.19
HRQ1Q05549 PCH2YBR186W 1695 nt13.84□□□□□ -0.19
HRQ1Q05549 YJL152WYJL152W 360 nt13.83□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 YOR139CYOR139C 393 nt13.83□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.82□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 YOL037CYOL037C 354 nt13.82□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 FPS1YLL043W 2010 nt13.81□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 GUT2YIL155C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 YHL050CYHL050C 2094 nt13.78□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 SEC11YIR022W 504 nt13.78□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 RRT12YCR045C 1476 nt13.78□□□□□ -0.2
HRQ1Q05549 YIL100WYIL100W 354 nt13.68□□□□□ -0.22
HRQ1Q05549 YLR236CYLR236C 324 nt13.63□□□□□ -0.23
HRQ1Q05549 WHI5YOR083W 888 nt13.63□□□□□ -0.23
HRQ1Q05549 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.63□□□□□ -0.23
HRQ1Q05549 PIB2YGL023C 1908 nt13.62□□□□□ -0.23
HRQ1Q05549 YLR281CYLR281C 468 nt13.6□□□□□ -0.23
HRQ1Q05549 YNL195CYNL195C 786 nt13.6□□□□□ -0.23
HRQ1Q05549 RTF1YGL244W 1677 nt13.5□□□□□ -0.25
HRQ1Q05549 RRD1YIL153W 1182 nt13.41□□□□□ -0.26
HRQ1Q05549 PAC11YDR488C 1602 nt13.41□□□□□ -0.26
HRQ1Q05549 BOP3YNL042W 1191 nt13.4□□□□□ -0.26
HRQ1Q05549 GBP2YCL011C 1284 nt13.4□□□□□ -0.26
HRQ1Q05549 IDH1YNL037C 1083 nt13.39□□□□□ -0.27
HRQ1Q05549 PUS2YGL063W 1113 nt13.37□□□□□ -0.27
HRQ1Q05549 NCP1YHR042W 2076 nt13.36□□□□□ -0.27
HRQ1Q05549 DED1YOR204W 1815 nt13.35□□□□□ -0.27
HRQ1Q05549 PTK1YKL198C 1989 nt13.35□□□□□ -0.27
HRQ1Q05549 YPR011CYPR011C 981 nt13.32□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.31□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.31□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.31□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.31□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.31□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 LCB1YMR296C 1677 nt13.29□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 DSK2YMR276W 1122 nt13.28□□□□□ -0.28
HRQ1Q05549 FMT1YBL013W 1206 nt13.27□□□□□ -0.29
HRQ1Q05549 TCD2YKL027W 1344 nt13.27□□□□□ -0.29
HRQ1Q05549 MXR2YCL033C 507 nt13.24□□□□□ -0.29
HRQ1Q05549 YDR433WYDR433W 441 nt13.22□□□□□ -0.29
HRQ1Q05549 Q0182Q0182 405 nt13.22□□□□□ -0.29
HRQ1Q05549 IMP2'YIL154C 1041 nt13.2□□□□□ -0.3
HRQ1Q05549 PCM1YEL058W 1674 nt13.19□□□□□ -0.3
HRQ1Q05549 FMP45YDL222C 930 nt13.19□□□□□ -0.3
HRQ1Q05549 FMP52YER004W 696 nt13.18□□□□□ -0.3
HRQ1Q05549 ADH2YMR303C 1047 nt13.16□□□□□ -0.3
HRQ1Q05549 CWP1YKL096W 720 nt13.14□□□□□ -0.31
HRQ1Q05549 LPX1YOR084W 1164 nt13.13□□□□□ -0.31
HRQ1Q05549 SIM1YIL123W 1431 nt13.12□□□□□ -0.31
HRQ1Q05549 YFL054CYFL054C 1941 nt13.08□□□□□ -0.32
HRQ1Q05549 ERV46YAL042W 1248 nt13.05□□□□□ -0.32
HRQ1Q05549 SNF6YHL025W 999 nt13.04□□□□□ -0.32
HRQ1Q05549 BIO4YNR057C 714 nt13.03□□□□□ -0.32
HRQ1Q05549 SOR2YDL246C 1074 nt13.01□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 SOR1YJR159W 1074 nt13.01□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 LYS4YDR234W 2082 nt13□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 YKR040CYKR040C 504 nt13□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 MOT3YMR070W 1473 nt12.99□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 FRD1YEL047C 1413 nt12.98□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 YCL042WYCL042W 360 nt12.98□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 SPT8YLR055C 1809 nt12.96□□□□□ -0.33
HRQ1Q05549 YIH1YCR059C 777 nt12.87□□□□□ -0.35
HRQ1Q05549 YLL053CYLL053C 459 nt12.85□□□□□ -0.35
HRQ1Q05549 RNQ1YCL028W 1218 nt12.82□□□□□ -0.36
HRQ1Q05549 CRR1YLR213C 1269 nt12.79□□□□□ -0.36
HRQ1Q05549 SPP1YPL138C 1062 nt12.79□□□□□ -0.36
HRQ1Q05549 NVJ2YPR091C 2313 nt12.78□□□□□ -0.36
HRQ1Q05549 ERF2YLR246W 1080 nt12.78□□□□□ -0.36
HRQ1Q05549 SWE1YJL187C 2460 nt12.77□□□□□ -0.37
HRQ1Q05549 ATF2YGR177C 1608 nt12.76□□□□□ -0.37
HRQ1Q05549 DIC1YLR348C 897 nt12.75□□□□□ -0.37
HRQ1Q05549 MIC10YCL057C-A 294 nt12.74□□□□□ -0.37
HRQ1Q05549 PTH1YHR189W 573 nt12.71□□□□□ -0.37
HRQ1Q05549 FTR1YER145C 1215 nt12.7□□□□□ -0.38
HRQ1Q05549 TRM5YHR070W 1500 nt12.68□□□□□ -0.38
HRQ1Q05549 GAL1YBR020W 1587 nt12.68□□□□□ -0.38
HRQ1Q05549 HEM12YDR047W 1089 nt12.67□□□□□ -0.38
HRQ1Q05549 SNG1YGR197C 1644 nt12.66□□□□□ -0.38
HRQ1Q05549 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.65□□□□□ -0.38
HRQ1Q05549 YFL067WYFL067W 528 nt12.61□□□□□ -0.39
HRQ1Q05549 DDR2YOL052C-A 186 nt12.59□□□□□ -0.39
HRQ1Q05549 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.53□□□□□ -0.4
HRQ1Q05549 TIM23YNR017W 669 nt12.53□□□□□ -0.4
HRQ1Q05549 RAX1YOR301W 1308 nt12.53□□□□□ -0.4
HRQ1Q05549 BOR1YNL275W 1731 nt12.53□□□□□ -0.4
HRQ1Q05549 CCA1YER168C 1641 nt12.52□□□□□ -0.4
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