Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Sox12Q04890 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sox12Q04890 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Sox12Q04890 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Sox12Q04890 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Sox12Q04890 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Sox12Q04890 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Sox12Q04890 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Sox12Q04890 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sox12Q04890 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sox12Q04890 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Sox12Q04890 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Sox12Q04890 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sox12Q04890 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Sox12Q04890 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Sox12Q04890 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Sox12Q04890 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Sox12Q04890 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Sox12Q04890 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Sox12Q04890 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Sox12Q04890 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Sox12Q04890 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Sox12Q04890 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Sox12Q04890 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Sox12Q04890 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Sox12Q04890 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Sox12Q04890 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Sox12Q04890 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Sox12Q04890 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Sox12Q04890 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Sox12Q04890 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Sox12Q04890 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Sox12Q04890 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Sox12Q04890 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Sox12Q04890 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Sox12Q04890 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Sox12Q04890 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Sox12Q04890 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sox12Q04890 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Sox12Q04890 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sox12Q04890 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sox12Q04890 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Sox12Q04890 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Sox12Q04890 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Sox12Q04890 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Sox12Q04890 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Sox12Q04890 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Sox12Q04890 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Sox12Q04890 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Sox12Q04890 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Sox12Q04890 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Sox12Q04890 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Sox12Q04890 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Sox12Q04890 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Sox12Q04890 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sox12Q04890 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Sox12Q04890 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Sox12Q04890 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sox12Q04890 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Sox12Q04890 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Sox12Q04890 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Sox12Q04890 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sox12Q04890 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sox12Q04890 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sox12Q04890 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Sox12Q04890 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Sox12Q04890 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Sox12Q04890 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Sox12Q04890 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Sox12Q04890 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Sox12Q04890 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Sox12Q04890 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Sox12Q04890 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Sox12Q04890 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Sox12Q04890 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sox12Q04890 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sox12Q04890 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Sox12Q04890 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Sox12Q04890 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Sox12Q04890 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Sox12Q04890 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Sox12Q04890 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Sox12Q04890 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Sox12Q04890 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Sox12Q04890 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Sox12Q04890 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Sox12Q04890 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Sox12Q04890 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Sox12Q04890 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Sox12Q04890 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Sox12Q04890 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Sox12Q04890 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Sox12Q04890 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.2 ms