Protein–RNA interactions for Protein: Q04053

SNX41, Sorting nexin-41, yeastyeast

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX41Q04053 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.16□□□□□ -0.62
SNX41Q04053 SIS1YNL007C 1059 nt11.15□□□□□ -0.62
SNX41Q04053 DCW1YKL046C 1350 nt11.13□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 YLR281CYLR281C 468 nt11.12□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 RPP2AYOL039W 321 nt11.11□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.09□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.09□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.09□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.09□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.09□□□□□ -0.63
SNX41Q04053 PTP1YDL230W 1008 nt11.08□□□□□ -0.64
SNX41Q04053 WHI5YOR083W 888 nt11.08□□□□□ -0.64
SNX41Q04053 YBR220CYBR220C 1683 nt11.04□□□□□ -0.64
SNX41Q04053 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.04□□□□□ -0.64
SNX41Q04053 EMI2YDR516C 1503 nt11.01□□□□□ -0.65
SNX41Q04053 PUS2YGL063W 1113 nt10.99□□□□□ -0.65
SNX41Q04053 YMR090WYMR090W 684 nt10.97□□□□□ -0.65
SNX41Q04053 CAC2YML102W 1407 nt10.97□□□□□ -0.65
SNX41Q04053 ART5YGR068C 1761 nt10.95□□□□□ -0.66
SNX41Q04053 TIR4YOR009W 1464 nt10.93□□□□□ -0.66
SNX41Q04053 YDL221WYDL221W 552 nt10.92□□□□□ -0.66
SNX41Q04053 YJL152WYJL152W 360 nt10.92□□□□□ -0.66
SNX41Q04053 PET9YBL030C 957 nt10.91□□□□□ -0.66
SNX41Q04053 YCH1YGR203W 447 nt10.9□□□□□ -0.66
SNX41Q04053 GFD2YCL036W 1701 nt10.89□□□□□ -0.67
SNX41Q04053 PCH2YBR186W 1695 nt10.87□□□□□ -0.67
SNX41Q04053 GUT2YIL155C 1950 nt10.86□□□□□ -0.67
SNX41Q04053 IMP2'YIL154C 1041 nt10.85□□□□□ -0.67
SNX41Q04053 YMR057CYMR057C 372 nt10.83□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 DSK2YMR276W 1122 nt10.83□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 YPR011CYPR011C 981 nt10.82□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 IRC15YPL017C 1500 nt10.81□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 SDH1YKL148C 1923 nt10.79□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 YLR236CYLR236C 324 nt10.78□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 RTS2YOR077W 699 nt10.78□□□□□ -0.68
SNX41Q04053 GIS3YLR094C 1509 nt10.74□□□□□ -0.69
SNX41Q04053 IDH1YNL037C 1083 nt10.74□□□□□ -0.69
SNX41Q04053 SCC4YER147C 1875 nt10.73□□□□□ -0.69
SNX41Q04053 PIB2YGL023C 1908 nt10.71□□□□□ -0.69
SNX41Q04053 SEC11YIR022W 504 nt10.71□□□□□ -0.69
SNX41Q04053 FMP45YDL222C 930 nt10.69□□□□□ -0.7
SNX41Q04053 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.69□□□□□ -0.7
SNX41Q04053 UME6YDR207C 2511 nt10.67□□□□□ -0.7
SNX41Q04053 CUE1YMR264W 612 nt10.67□□□□□ -0.7
SNX41Q04053 GBP2YCL011C 1284 nt10.65□□□□□ -0.7
SNX41Q04053 ERV46YAL042W 1248 nt10.63□□□□□ -0.71
SNX41Q04053 MOT3YMR070W 1473 nt10.61□□□□□ -0.71
SNX41Q04053 LPX1YOR084W 1164 nt10.61□□□□□ -0.71
SNX41Q04053 YDR433WYDR433W 441 nt10.6□□□□□ -0.71
SNX41Q04053 Q0182Q0182 405 nt10.58□□□□□ -0.72
SNX41Q04053 YIL100WYIL100W 354 nt10.58□□□□□ -0.72
SNX41Q04053 YKR040CYKR040C 504 nt10.55□□□□□ -0.72
SNX41Q04053 TCD2YKL027W 1344 nt10.55□□□□□ -0.72
SNX41Q04053 RRD1YIL153W 1182 nt10.54□□□□□ -0.72
SNX41Q04053 MXR2YCL033C 507 nt10.53□□□□□ -0.72
SNX41Q04053 DED1YOR204W 1815 nt10.52□□□□□ -0.73
SNX41Q04053 RTF1YGL244W 1677 nt10.5□□□□□ -0.73
SNX41Q04053 YNL195CYNL195C 786 nt10.48□□□□□ -0.73
SNX41Q04053 YSC84YHR016C 1407 nt10.47□□□□□ -0.73
SNX41Q04053 BOR1YNL275W 1731 nt10.45□□□□□ -0.74
SNX41Q04053 FMT1YBL013W 1206 nt10.43□□□□□ -0.74
SNX41Q04053 SPP1YPL138C 1062 nt10.42□□□□□ -0.74
SNX41Q04053 RRT12YCR045C 1476 nt10.41□□□□□ -0.74
SNX41Q04053 YHL050CYHL050C 2094 nt10.4□□□□□ -0.74
SNX41Q04053 PTK1YKL198C 1989 nt10.4□□□□□ -0.74
SNX41Q04053 FMP52YER004W 696 nt10.39□□□□□ -0.75
SNX41Q04053 FRD1YEL047C 1413 nt10.37□□□□□ -0.75
SNX41Q04053 SOR2YDL246C 1074 nt10.35□□□□□ -0.75
SNX41Q04053 SOR1YJR159W 1074 nt10.35□□□□□ -0.75
SNX41Q04053 YCL042WYCL042W 360 nt10.33□□□□□ -0.76
SNX41Q04053 BOP3YNL042W 1191 nt10.32□□□□□ -0.76
SNX41Q04053 MCH5YOR306C 1566 nt10.3□□□□□ -0.76
SNX41Q04053 CWP1YKL096W 720 nt10.29□□□□□ -0.76
SNX41Q04053 ADH2YMR303C 1047 nt10.28□□□□□ -0.76
SNX41Q04053 PCM1YEL058W 1674 nt10.27□□□□□ -0.77
SNX41Q04053 RTG1YOL067C 534 nt10.24□□□□□ -0.77
SNX41Q04053 MRPL8YJL063C 717 nt10.22□□□□□ -0.77
SNX41Q04053 SNF6YHL025W 999 nt10.19□□□□□ -0.78
SNX41Q04053 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.16□□□□□ -0.78
SNX41Q04053 YEL076CYEL076C 651 nt10.16□□□□□ -0.78
SNX41Q04053 PTH1YHR189W 573 nt10.16□□□□□ -0.78
SNX41Q04053 YLR464WYLR464W 651 nt10.16□□□□□ -0.78
SNX41Q04053 YLR235CYLR235C 399 nt10.14□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 YIH1YCR059C 777 nt10.12□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 ADO1YJR105W 1023 nt10.12□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 YFL054CYFL054C 1941 nt10.11□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 SIM1YIL123W 1431 nt10.11□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 RNQ1YCL028W 1218 nt10.11□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 LCB1YMR296C 1677 nt10.11□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 SPT8YLR055C 1809 nt10.1□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 ALG12YNR030W 1656 nt10.09□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 YKL030WYKL030W 606 nt10.09□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 NCP1YHR042W 2076 nt10.09□□□□□ -0.79
SNX41Q04053 DIC1YLR348C 897 nt10.08□□□□□ -0.8
SNX41Q04053 BIO4YNR057C 714 nt10.07□□□□□ -0.8
SNX41Q04053 HSP60YLR259C 1719 nt10.04□□□□□ -0.8
SNX41Q04053 TIM23YNR017W 669 nt10.03□□□□□ -0.8
SNX41Q04053 HUA1YGR268C 597 nt10.02□□□□□ -0.81
SNX41Q04053 YLL053CYLL053C 459 nt10.02□□□□□ -0.81
SNX41Q04053 FTR1YER145C 1215 nt9.97□□□□□ -0.81
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