Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 PHO4YFR034C 939 nt11.15□□□□□ -0.62
SRP1Q02821 DSK2YMR276W 1122 nt11.15□□□□□ -0.62
SRP1Q02821 MEP2YNL142W 1500 nt11.14□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 FMP45YDL222C 930 nt11.13□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 FRE6YLL051C 2139 nt11.13□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 TRM9YML014W 840 nt11.13□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 UME6YDR207C 2511 nt11.12□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 NME1NME1 340 nt11.12□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 YCH1YGR203W 447 nt11.09□□□□□ -0.63
SRP1Q02821 YPS1YLR120C 1710 nt11.06□□□□□ -0.64
SRP1Q02821 FUN26YAL022C 1554 nt11.04□□□□□ -0.64
SRP1Q02821 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.02□□□□□ -0.65
SRP1Q02821 YLR236CYLR236C 324 nt11.01□□□□□ -0.65
SRP1Q02821 CCT6YDR188W 1641 nt11□□□□□ -0.65
SRP1Q02821 YPR011CYPR011C 981 nt11□□□□□ -0.65
SRP1Q02821 ADO1YJR105W 1023 nt10.99□□□□□ -0.65
SRP1Q02821 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.96□□□□□ -0.65
SRP1Q02821 YDR095CYDR095C 411 nt10.93□□□□□ -0.66
SRP1Q02821 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.93□□□□□ -0.66
SRP1Q02821 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.93□□□□□ -0.66
SRP1Q02821 DCW1YKL046C 1350 nt10.91□□□□□ -0.66
SRP1Q02821 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.86□□□□□ -0.67
SRP1Q02821 YEL076CYEL076C 651 nt10.86□□□□□ -0.67
SRP1Q02821 YLR464WYLR464W 651 nt10.86□□□□□ -0.67
SRP1Q02821 ERV46YAL042W 1248 nt10.85□□□□□ -0.67
SRP1Q02821 ALF1YNL148C 765 nt10.84□□□□□ -0.67
SRP1Q02821 YJL225CYJL225C 5277 nt10.82□□□□□ -0.68
SRP1Q02821 IDH1YNL037C 1083 nt10.82□□□□□ -0.68
SRP1Q02821 YJL152WYJL152W 360 nt10.8□□□□□ -0.68
SRP1Q02821 LPX1YOR084W 1164 nt10.8□□□□□ -0.68
SRP1Q02821 EMI2YDR516C 1503 nt10.79□□□□□ -0.68
SRP1Q02821 YMR090WYMR090W 684 nt10.79□□□□□ -0.68
SRP1Q02821 SSN3YPL042C 1668 nt10.77□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 UBX6YJL048C 1191 nt10.76□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 SIS1YNL007C 1059 nt10.75□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 RTG1YOL067C 534 nt10.74□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 RPP2AYOL039W 321 nt10.73□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 PTP1YDL230W 1008 nt10.71□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 YDR433WYDR433W 441 nt10.71□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 YKR040CYKR040C 504 nt10.71□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 SPP1YPL138C 1062 nt10.71□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 YBR220CYBR220C 1683 nt10.71□□□□□ -0.69
SRP1Q02821 YDL221WYDL221W 552 nt10.7□□□□□ -0.7
SRP1Q02821 CAC2YML102W 1407 nt10.67□□□□□ -0.7
SRP1Q02821 SDH1YKL148C 1923 nt10.63□□□□□ -0.71
SRP1Q02821 HUA1YGR268C 597 nt10.63□□□□□ -0.71
SRP1Q02821 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
SRP1Q02821 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.62□□□□□ -0.71
SRP1Q02821 GBP2YCL011C 1284 nt10.61□□□□□ -0.71
SRP1Q02821 BSP1YPR171W 1731 nt10.59□□□□□ -0.71
SRP1Q02821 YDR094WYDR094W 336 nt10.57□□□□□ -0.72
SRP1Q02821 TIR4YOR009W 1464 nt10.55□□□□□ -0.72
SRP1Q02821 YGR139WYGR139W 339 nt10.54□□□□□ -0.72
SRP1Q02821 GUT2YIL155C 1950 nt10.52□□□□□ -0.72
SRP1Q02821 SCC4YER147C 1875 nt10.51□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 PCH2YBR186W 1695 nt10.51□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 MXR2YCL033C 507 nt10.51□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 IRC15YPL017C 1500 nt10.51□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 ART5YGR068C 1761 nt10.47□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.47□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 GFD2YCL036W 1701 nt10.47□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 PIB2YGL023C 1908 nt10.46□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 TCD2YKL027W 1344 nt10.46□□□□□ -0.73
SRP1Q02821 GIS3YLR094C 1509 nt10.46□□□□□ -0.74
SRP1Q02821 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.44□□□□□ -0.74
SRP1Q02821 PET9YBL030C 957 nt10.43□□□□□ -0.74
SRP1Q02821 SEC11YIR022W 504 nt10.41□□□□□ -0.74
SRP1Q02821 YMR057CYMR057C 372 nt10.37□□□□□ -0.75
SRP1Q02821 RTS2YOR077W 699 nt10.37□□□□□ -0.75
SRP1Q02821 GID7YCL039W 2238 nt10.35□□□□□ -0.75
SRP1Q02821 FRD1YEL047C 1413 nt10.34□□□□□ -0.75
SRP1Q02821 YKL030WYKL030W 606 nt10.32□□□□□ -0.76
SRP1Q02821 YLR235CYLR235C 399 nt10.32□□□□□ -0.76
SRP1Q02821 CUE1YMR264W 612 nt10.3□□□□□ -0.76
SRP1Q02821 YSC84YHR016C 1407 nt10.28□□□□□ -0.76
SRP1Q02821 YCL042WYCL042W 360 nt10.28□□□□□ -0.76
SRP1Q02821 DED1YOR204W 1815 nt10.27□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 MCH5YOR306C 1566 nt10.26□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 PTH1YHR189W 573 nt10.24□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 SOR2YDL246C 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 RRD1YIL153W 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 SOR1YJR159W 1074 nt10.23□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 YHL050CYHL050C 2094 nt10.22□□□□□ -0.77
SRP1Q02821 YIL100WYIL100W 354 nt10.2□□□□□ -0.78
SRP1Q02821 YNL195CYNL195C 786 nt10.19□□□□□ -0.78
SRP1Q02821 ESBP6YNL125C 2022 nt10.18□□□□□ -0.78
SRP1Q02821 LCB1YMR296C 1677 nt10.18□□□□□ -0.78
SRP1Q02821 RRT12YCR045C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
SRP1Q02821 RTF1YGL244W 1677 nt10.15□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 RRT5YFR032C 870 nt10.14□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 FMP52YER004W 696 nt10.13□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 YFR018CYFR018C 1092 nt10.13□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 PAU16YKL224C 372 nt10.13□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.12□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 SBA1YKL117W 651 nt10.11□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 FMT1YBL013W 1206 nt10.11□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 PTK1YKL198C 1989 nt10.1□□□□□ -0.79
SRP1Q02821 BOP3YNL042W 1191 nt10.06□□□□□ -0.8
SRP1Q02821 TIM23YNR017W 669 nt10.04□□□□□ -0.8
SRP1Q02821 CWP1YKL096W 720 nt10.01□□□□□ -0.81
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