Protein–RNA interactions for Protein: Q01589

SED1, Cell wall protein SED1, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SED1Q01589 SIS1YNL007C 1059 nt10.41□□□□□ -0.74
SED1Q01589 DSK2YMR276W 1122 nt10.37□□□□□ -0.75
SED1Q01589 IMP2'YIL154C 1041 nt10.36□□□□□ -0.75
SED1Q01589 MEP2YNL142W 1500 nt10.36□□□□□ -0.75
SED1Q01589 YLR236CYLR236C 324 nt10.34□□□□□ -0.75
SED1Q01589 RPP2AYOL039W 321 nt10.34□□□□□ -0.75
SED1Q01589 YPR011CYPR011C 981 nt10.33□□□□□ -0.76
SED1Q01589 YJL152WYJL152W 360 nt10.31□□□□□ -0.76
SED1Q01589 MOT3YMR070W 1473 nt10.3□□□□□ -0.76
SED1Q01589 FMP45YDL222C 930 nt10.29□□□□□ -0.76
SED1Q01589 TIR4YOR009W 1464 nt10.29□□□□□ -0.76
SED1Q01589 PTP1YDL230W 1008 nt10.28□□□□□ -0.76
SED1Q01589 YCH1YGR203W 447 nt10.28□□□□□ -0.76
SED1Q01589 ART5YGR068C 1761 nt10.21□□□□□ -0.77
SED1Q01589 IDH1YNL037C 1083 nt10.21□□□□□ -0.77
SED1Q01589 DCW1YKL046C 1350 nt10.2□□□□□ -0.78
SED1Q01589 PET9YBL030C 957 nt10.2□□□□□ -0.78
SED1Q01589 GFD2YCL036W 1701 nt10.18□□□□□ -0.78
SED1Q01589 CAC2YML102W 1407 nt10.16□□□□□ -0.78
SED1Q01589 ERV46YAL042W 1248 nt10.15□□□□□ -0.78
SED1Q01589 LPX1YOR084W 1164 nt10.14□□□□□ -0.79
SED1Q01589 YMR057CYMR057C 372 nt10.13□□□□□ -0.79
SED1Q01589 GBP2YCL011C 1284 nt10.1□□□□□ -0.79
SED1Q01589 YDR433WYDR433W 441 nt10.09□□□□□ -0.79
SED1Q01589 EMI2YDR516C 1503 nt10.08□□□□□ -0.8
SED1Q01589 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.08□□□□□ -0.8
SED1Q01589 YDL221WYDL221W 552 nt10.04□□□□□ -0.8
SED1Q01589 YKR040CYKR040C 504 nt10.03□□□□□ -0.8
SED1Q01589 RTS2YOR077W 699 nt10.03□□□□□ -0.8
SED1Q01589 IRC15YPL017C 1500 nt10.02□□□□□ -0.81
SED1Q01589 MXR2YCL033C 507 nt10□□□□□ -0.81
SED1Q01589 FPS1YLL043W 2010 nt10□□□□□ -0.81
SED1Q01589 YMR090WYMR090W 684 nt9.99□□□□□ -0.81
SED1Q01589 SPP1YPL138C 1062 nt9.99□□□□□ -0.81
SED1Q01589 TCD2YKL027W 1344 nt9.98□□□□□ -0.81
SED1Q01589 MRPL8YJL063C 717 nt9.97□□□□□ -0.81
SED1Q01589 SSA4YER103W 1929 nt9.97□□□□□ -0.81
SED1Q01589 CUE1YMR264W 612 nt9.95□□□□□ -0.82
SED1Q01589 GIS3YLR094C 1509 nt9.92□□□□□ -0.82
SED1Q01589 RRD1YIL153W 1182 nt9.92□□□□□ -0.82
SED1Q01589 DED1YOR204W 1815 nt9.91□□□□□ -0.82
SED1Q01589 SDH1YKL148C 1923 nt9.87□□□□□ -0.83
SED1Q01589 RTG1YOL067C 534 nt9.86□□□□□ -0.83
SED1Q01589 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.85□□□□□ -0.83
SED1Q01589 YEL076CYEL076C 651 nt9.85□□□□□ -0.83
SED1Q01589 YLR464WYLR464W 651 nt9.85□□□□□ -0.83
SED1Q01589 FRD1YEL047C 1413 nt9.84□□□□□ -0.83
SED1Q01589 ADO1YJR105W 1023 nt9.84□□□□□ -0.83
SED1Q01589 SCC4YER147C 1875 nt9.84□□□□□ -0.83
SED1Q01589 YBR220CYBR220C 1683 nt9.83□□□□□ -0.84
SED1Q01589 YIL100WYIL100W 354 nt9.81□□□□□ -0.84
SED1Q01589 FMT1YBL013W 1206 nt9.81□□□□□ -0.84
SED1Q01589 SOR2YDL246C 1074 nt9.8□□□□□ -0.84
SED1Q01589 SOR1YJR159W 1074 nt9.8□□□□□ -0.84
SED1Q01589 FMP52YER004W 696 nt9.78□□□□□ -0.84
SED1Q01589 YCL042WYCL042W 360 nt9.77□□□□□ -0.85
SED1Q01589 HUA1YGR268C 597 nt9.68□□□□□ -0.86
SED1Q01589 PTH1YHR189W 573 nt9.68□□□□□ -0.86
SED1Q01589 CWP1YKL096W 720 nt9.68□□□□□ -0.86
SED1Q01589 YLR235CYLR235C 399 nt9.67□□□□□ -0.86
SED1Q01589 ADH2YMR303C 1047 nt9.66□□□□□ -0.86
SED1Q01589 YKL030WYKL030W 606 nt9.64□□□□□ -0.87
SED1Q01589 YNL195CYNL195C 786 nt9.62□□□□□ -0.87
SED1Q01589 PCM1YEL058W 1674 nt9.61□□□□□ -0.87
SED1Q01589 LCB1YMR296C 1677 nt9.58□□□□□ -0.88
SED1Q01589 SNF6YHL025W 999 nt9.58□□□□□ -0.88
SED1Q01589 YSC84YHR016C 1407 nt9.56□□□□□ -0.88
SED1Q01589 RRT12YCR045C 1476 nt9.56□□□□□ -0.88
SED1Q01589 UBX6YJL048C 1191 nt9.56□□□□□ -0.88
SED1Q01589 DIC1YLR348C 897 nt9.56□□□□□ -0.88
SED1Q01589 BDF1YLR399C 2061 nt9.54□□□□□ -0.88
SED1Q01589 YHL050CYHL050C 2094 nt9.52□□□□□ -0.88
SED1Q01589 YIH1YCR059C 777 nt9.52□□□□□ -0.89
SED1Q01589 TIM23YNR017W 669 nt9.52□□□□□ -0.89
SED1Q01589 RNQ1YCL028W 1218 nt9.51□□□□□ -0.89
SED1Q01589 YDR094WYDR094W 336 nt9.5□□□□□ -0.89
SED1Q01589 SEC11YIR022W 504 nt9.47□□□□□ -0.89
SED1Q01589 YLR179CYLR179C 606 nt9.45□□□□□ -0.9
SED1Q01589 TAT1YBR069C 1860 nt9.45□□□□□ -0.9
SED1Q01589 BIO4YNR057C 714 nt9.44□□□□□ -0.9
SED1Q01589 SIM1YIL123W 1431 nt9.41□□□□□ -0.9
SED1Q01589 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.41□□□□□ -0.9
SED1Q01589 YLL053CYLL053C 459 nt9.4□□□□□ -0.9
SED1Q01589 YPR064WYPR064W 420 nt9.39□□□□□ -0.91
SED1Q01589 WSC2YNL283C 1512 nt9.39□□□□□ -0.91
SED1Q01589 PCH2YBR186W 1695 nt9.37□□□□□ -0.91
SED1Q01589 AHT1YHR093W 549 nt9.37□□□□□ -0.91
SED1Q01589 FTR1YER145C 1215 nt9.36□□□□□ -0.91
SED1Q01589 TAD3YLR316C 969 nt9.35□□□□□ -0.91
SED1Q01589 AQY1YPR192W 918 nt9.35□□□□□ -0.91
SED1Q01589 GAL1YBR020W 1587 nt9.33□□□□□ -0.92
SED1Q01589 YFR018CYFR018C 1092 nt9.31□□□□□ -0.92
SED1Q01589 GUT2YIL155C 1950 nt9.31□□□□□ -0.92
SED1Q01589 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.3□□□□□ -0.92
SED1Q01589 TRM5YHR070W 1500 nt9.29□□□□□ -0.92
SED1Q01589 ERF2YLR246W 1080 nt9.28□□□□□ -0.92
SED1Q01589 NCP1YHR042W 2076 nt9.27□□□□□ -0.93
SED1Q01589 ATF2YGR177C 1608 nt9.25□□□□□ -0.93
SED1Q01589 CRR1YLR213C 1269 nt9.25□□□□□ -0.93
SED1Q01589 SPC25YER018C 666 nt9.24□□□□□ -0.93
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