Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dgcr2P98154 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dgcr2P98154 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dgcr2P98154 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dgcr2P98154 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dgcr2P98154 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dgcr2P98154 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dgcr2P98154 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Dgcr2P98154 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dgcr2P98154 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dgcr2P98154 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dgcr2P98154 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dgcr2P98154 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dgcr2P98154 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dgcr2P98154 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dgcr2P98154 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dgcr2P98154 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dgcr2P98154 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dgcr2P98154 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dgcr2P98154 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dgcr2P98154 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dgcr2P98154 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dgcr2P98154 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dgcr2P98154 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dgcr2P98154 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dgcr2P98154 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dgcr2P98154 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dgcr2P98154 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dgcr2P98154 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dgcr2P98154 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr2P98154 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr2P98154 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dgcr2P98154 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr2P98154 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dgcr2P98154 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dgcr2P98154 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dgcr2P98154 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dgcr2P98154 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dgcr2P98154 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dgcr2P98154 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dgcr2P98154 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dgcr2P98154 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dgcr2P98154 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dgcr2P98154 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dgcr2P98154 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dgcr2P98154 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dgcr2P98154 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dgcr2P98154 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dgcr2P98154 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dgcr2P98154 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dgcr2P98154 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dgcr2P98154 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dgcr2P98154 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dgcr2P98154 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dgcr2P98154 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dgcr2P98154 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dgcr2P98154 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr2P98154 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dgcr2P98154 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dgcr2P98154 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dgcr2P98154 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dgcr2P98154 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms