Protein–RNA interactions for Protein: P98154

Dgcr2, Integral membrane protein DGCR2/IDD, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr2P98154 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Dgcr2P98154 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Dgcr2P98154 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Dgcr2P98154 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Dgcr2P98154 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Dgcr2P98154 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Dgcr2P98154 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dgcr2P98154 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dgcr2P98154 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Dgcr2P98154 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Dgcr2P98154 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Dgcr2P98154 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dgcr2P98154 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Dgcr2P98154 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Dgcr2P98154 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dgcr2P98154 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Dgcr2P98154 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dgcr2P98154 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dgcr2P98154 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dgcr2P98154 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Dgcr2P98154 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dgcr2P98154 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dgcr2P98154 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dgcr2P98154 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Dgcr2P98154 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dgcr2P98154 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dgcr2P98154 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dgcr2P98154 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dgcr2P98154 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dgcr2P98154 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dgcr2P98154 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dgcr2P98154 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dgcr2P98154 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dgcr2P98154 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dgcr2P98154 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dgcr2P98154 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Dgcr2P98154 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dgcr2P98154 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dgcr2P98154 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dgcr2P98154 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Dgcr2P98154 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dgcr2P98154 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dgcr2P98154 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dgcr2P98154 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dgcr2P98154 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dgcr2P98154 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dgcr2P98154 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dgcr2P98154 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Dgcr2P98154 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dgcr2P98154 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dgcr2P98154 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dgcr2P98154 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dgcr2P98154 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dgcr2P98154 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dgcr2P98154 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dgcr2P98154 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dgcr2P98154 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dgcr2P98154 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dgcr2P98154 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Dgcr2P98154 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dgcr2P98154 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Dgcr2P98154 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dgcr2P98154 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dgcr2P98154 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dgcr2P98154 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Dgcr2P98154 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Dgcr2P98154 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dgcr2P98154 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dgcr2P98154 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dgcr2P98154 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Dgcr2P98154 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dgcr2P98154 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dgcr2P98154 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dgcr2P98154 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dgcr2P98154 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dgcr2P98154 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Dgcr2P98154 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dgcr2P98154 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Dgcr2P98154 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dgcr2P98154 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dgcr2P98154 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dgcr2P98154 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dgcr2P98154 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dgcr2P98154 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dgcr2P98154 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Dgcr2P98154 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dgcr2P98154 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dgcr2P98154 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dgcr2P98154 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dgcr2P98154 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Dgcr2P98154 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dgcr2P98154 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dgcr2P98154 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dgcr2P98154 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms