Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Nbr1P97432 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Nbr1P97432 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nbr1P97432 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nbr1P97432 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Nbr1P97432 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nbr1P97432 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nbr1P97432 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Nbr1P97432 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Nbr1P97432 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nbr1P97432 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Nbr1P97432 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Nbr1P97432 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Nbr1P97432 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nbr1P97432 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nbr1P97432 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Nbr1P97432 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nbr1P97432 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nbr1P97432 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Nbr1P97432 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nbr1P97432 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nbr1P97432 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nbr1P97432 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nbr1P97432 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nbr1P97432 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nbr1P97432 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nbr1P97432 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nbr1P97432 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nbr1P97432 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nbr1P97432 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nbr1P97432 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Nbr1P97432 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nbr1P97432 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nbr1P97432 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nbr1P97432 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nbr1P97432 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nbr1P97432 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nbr1P97432 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nbr1P97432 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nbr1P97432 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Nbr1P97432 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Nbr1P97432 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nbr1P97432 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nbr1P97432 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nbr1P97432 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nbr1P97432 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nbr1P97432 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nbr1P97432 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nbr1P97432 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Nbr1P97432 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nbr1P97432 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Nbr1P97432 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nbr1P97432 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nbr1P97432 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nbr1P97432 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nbr1P97432 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nbr1P97432 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nbr1P97432 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nbr1P97432 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nbr1P97432 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nbr1P97432 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nbr1P97432 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nbr1P97432 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Nbr1P97432 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Nbr1P97432 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nbr1P97432 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Nbr1P97432 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nbr1P97432 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nbr1P97432 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nbr1P97432 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nbr1P97432 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nbr1P97432 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Nbr1P97432 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nbr1P97432 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nbr1P97432 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nbr1P97432 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Nbr1P97432 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Nbr1P97432 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nbr1P97432 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Nbr1P97432 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nbr1P97432 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nbr1P97432 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms