Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SmsP97355 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SmsP97355 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SmsP97355 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SmsP97355 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SmsP97355 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SmsP97355 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SmsP97355 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SmsP97355 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SmsP97355 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SmsP97355 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SmsP97355 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SmsP97355 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SmsP97355 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SmsP97355 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SmsP97355 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SmsP97355 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SmsP97355 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SmsP97355 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SmsP97355 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SmsP97355 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SmsP97355 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SmsP97355 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SmsP97355 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SmsP97355 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SmsP97355 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SmsP97355 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SmsP97355 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SmsP97355 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SmsP97355 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SmsP97355 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SmsP97355 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SmsP97355 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SmsP97355 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SmsP97355 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SmsP97355 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SmsP97355 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SmsP97355 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SmsP97355 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SmsP97355 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SmsP97355 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SmsP97355 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SmsP97355 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SmsP97355 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SmsP97355 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SmsP97355 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SmsP97355 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SmsP97355 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SmsP97355 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SmsP97355 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SmsP97355 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SmsP97355 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SmsP97355 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SmsP97355 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SmsP97355 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SmsP97355 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SmsP97355 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SmsP97355 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SmsP97355 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SmsP97355 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SmsP97355 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SmsP97355 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SmsP97355 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SmsP97355 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SmsP97355 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SmsP97355 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SmsP97355 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SmsP97355 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SmsP97355 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SmsP97355 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SmsP97355 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SmsP97355 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SmsP97355 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SmsP97355 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SmsP97355 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SmsP97355 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SmsP97355 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SmsP97355 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SmsP97355 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SmsP97355 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SmsP97355 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SmsP97355 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SmsP97355 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SmsP97355 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SmsP97355 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SmsP97355 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SmsP97355 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SmsP97355 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SmsP97355 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SmsP97355 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SmsP97355 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SmsP97355 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SmsP97355 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SmsP97355 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SmsP97355 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmsP97355 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SmsP97355 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SmsP97355 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SmsP97355 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SmsP97355 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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