Protein–RNA interactions for Protein: P89886

TMA20, Translation machinery-associated protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA20P89886 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TMA20P89886 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.68□□□□□ -0.54
TMA20P89886 YHL050CYHL050C 2094 nt11.67□□□□□ -0.54
TMA20P89886 GFD2YCL036W 1701 nt11.65□□□□□ -0.54
TMA20P89886 YJL225CYJL225C 5277 nt11.63□□□□□ -0.55
TMA20P89886 BOP3YNL042W 1191 nt11.61□□□□□ -0.55
TMA20P89886 ART5YGR068C 1761 nt11.61□□□□□ -0.55
TMA20P89886 RTS2YOR077W 699 nt11.6□□□□□ -0.55
TMA20P89886 LSM3YLR438C-A 270 nt11.59□□□□□ -0.55
TMA20P89886 RRT12YCR045C 1476 nt11.56□□□□□ -0.56
TMA20P89886 PET9YBL030C 957 nt11.53□□□□□ -0.56
TMA20P89886 YNL195CYNL195C 786 nt11.53□□□□□ -0.56
TMA20P89886 CUE1YMR264W 612 nt11.52□□□□□ -0.57
TMA20P89886 PTK1YKL198C 1989 nt11.52□□□□□ -0.57
TMA20P89886 WWM1YFL010C 636 nt11.46□□□□□ -0.57
TMA20P89886 YCH1YGR203W 447 nt11.43□□□□□ -0.58
TMA20P89886 YIL100WYIL100W 354 nt11.41□□□□□ -0.58
TMA20P89886 BOR1YNL275W 1731 nt11.38□□□□□ -0.59
TMA20P89886 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.33□□□□□ -0.6
TMA20P89886 TIR4YOR009W 1464 nt11.31□□□□□ -0.6
TMA20P89886 NCP1YHR042W 2076 nt11.31□□□□□ -0.6
TMA20P89886 YFL054CYFL054C 1941 nt11.29□□□□□ -0.6
TMA20P89886 YMR057CYMR057C 372 nt11.26□□□□□ -0.61
TMA20P89886 YLR236CYLR236C 324 nt11.25□□□□□ -0.61
TMA20P89886 SPT8YLR055C 1809 nt11.23□□□□□ -0.61
TMA20P89886 FPS1YLL043W 2010 nt11.23□□□□□ -0.61
TMA20P89886 YGR021WYGR021W 873 nt11.22□□□□□ -0.61
TMA20P89886 UME6YDR207C 2511 nt11.18□□□□□ -0.62
TMA20P89886 PST2YDR032C 597 nt11.12□□□□□ -0.63
TMA20P89886 HOM6YJR139C 1080 nt11.11□□□□□ -0.63
TMA20P89886 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.07□□□□□ -0.64
TMA20P89886 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.07□□□□□ -0.64
TMA20P89886 LCB1YMR296C 1677 nt11.05□□□□□ -0.64
TMA20P89886 HSP60YLR259C 1719 nt11.02□□□□□ -0.65
TMA20P89886 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11□□□□□ -0.65
TMA20P89886 SWE1YJL187C 2460 nt11□□□□□ -0.65
TMA20P89886 RKM5YLR137W 1104 nt10.95□□□□□ -0.66
TMA20P89886 NPL3YDR432W 1245 nt10.94□□□□□ -0.66
TMA20P89886 ALG12YNR030W 1656 nt10.94□□□□□ -0.66
TMA20P89886 MNP1YGL068W 585 nt10.93□□□□□ -0.66
TMA20P89886 MCH5YOR306C 1566 nt10.93□□□□□ -0.66
TMA20P89886 YJL152WYJL152W 360 nt10.92□□□□□ -0.66
TMA20P89886 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.89□□□□□ -0.67
TMA20P89886 GLK1YCL040W 1503 nt10.88□□□□□ -0.67
TMA20P89886 SHU1YHL006C 453 nt10.84□□□□□ -0.67
TMA20P89886 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.83□□□□□ -0.68
TMA20P89886 LYS4YDR234W 2082 nt10.82□□□□□ -0.68
TMA20P89886 SIM1YIL123W 1431 nt10.81□□□□□ -0.68
TMA20P89886 FMP52YER004W 696 nt10.73□□□□□ -0.69
TMA20P89886 FUR4YBR021W 1902 nt10.72□□□□□ -0.69
TMA20P89886 BIO4YNR057C 714 nt10.72□□□□□ -0.69
TMA20P89886 DSK2YMR276W 1122 nt10.71□□□□□ -0.69
TMA20P89886 PCM1YEL058W 1674 nt10.7□□□□□ -0.7
TMA20P89886 RRD1YIL153W 1182 nt10.68□□□□□ -0.7
TMA20P89886 PRP4YPR178W 1398 nt10.65□□□□□ -0.71
TMA20P89886 AAC1YMR056C 930 nt10.64□□□□□ -0.71
TMA20P89886 NAR1YNL240C 1476 nt10.63□□□□□ -0.71
TMA20P89886 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.61□□□□□ -0.71
TMA20P89886 YEL076CYEL076C 651 nt10.61□□□□□ -0.71
TMA20P89886 YLR464WYLR464W 651 nt10.61□□□□□ -0.71
TMA20P89886 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.58□□□□□ -0.72
TMA20P89886 ERF2YLR246W 1080 nt10.58□□□□□ -0.72
TMA20P89886 DPS1YLL018C 1674 nt10.57□□□□□ -0.72
TMA20P89886 SNF6YHL025W 999 nt10.56□□□□□ -0.72
TMA20P89886 CRR1YLR213C 1269 nt10.55□□□□□ -0.72
TMA20P89886 CCA1YER168C 1641 nt10.54□□□□□ -0.72
TMA20P89886 BMT6YLR063W 1098 nt10.53□□□□□ -0.72
TMA20P89886 DED1YOR204W 1815 nt10.53□□□□□ -0.72
TMA20P89886 TCD2YKL027W 1344 nt10.52□□□□□ -0.73
TMA20P89886 ADH2YMR303C 1047 nt10.51□□□□□ -0.73
TMA20P89886 IDH1YNL037C 1083 nt10.51□□□□□ -0.73
TMA20P89886 GBP2YCL011C 1284 nt10.51□□□□□ -0.73
TMA20P89886 YOL037CYOL037C 354 nt10.5□□□□□ -0.73
TMA20P89886 RAX1YOR301W 1308 nt10.5□□□□□ -0.73
TMA20P89886 CWP1YKL096W 720 nt10.49□□□□□ -0.73
TMA20P89886 FMT1YBL013W 1206 nt10.49□□□□□ -0.73
TMA20P89886 HEM12YDR047W 1089 nt10.46□□□□□ -0.73
TMA20P89886 BIO5YNR056C 1686 nt10.45□□□□□ -0.74
TMA20P89886 YKR005CYKR005C 1578 nt10.43□□□□□ -0.74
TMA20P89886 MIC10YCL057C-A 294 nt10.42□□□□□ -0.74
TMA20P89886 CYT2YKL087C 675 nt10.41□□□□□ -0.74
TMA20P89886 SNF1YDR477W 1902 nt10.4□□□□□ -0.74
TMA20P89886 PBP1YGR178C 2169 nt10.39□□□□□ -0.75
TMA20P89886 YIH1YCR059C 777 nt10.39□□□□□ -0.75
TMA20P89886 WHI5YOR083W 888 nt10.37□□□□□ -0.75
TMA20P89886 YLL053CYLL053C 459 nt10.36□□□□□ -0.75
TMA20P89886 WSC2YNL283C 1512 nt10.36□□□□□ -0.75
TMA20P89886 SNG1YGR197C 1644 nt10.36□□□□□ -0.75
TMA20P89886 ATF2YGR177C 1608 nt10.35□□□□□ -0.75
TMA20P89886 YFL067WYFL067W 528 nt10.34□□□□□ -0.75
TMA20P89886 SOR2YDL246C 1074 nt10.33□□□□□ -0.76
TMA20P89886 SOR1YJR159W 1074 nt10.33□□□□□ -0.76
TMA20P89886 IRC24YIR036C 792 nt10.31□□□□□ -0.76
TMA20P89886 RNQ1YCL028W 1218 nt10.31□□□□□ -0.76
TMA20P89886 CMP2YML057W 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
TMA20P89886 YGR259CYGR259C 441 nt10.3□□□□□ -0.76
TMA20P89886 YKL097CYKL097C 411 nt10.3□□□□□ -0.76
TMA20P89886 YLR281CYLR281C 468 nt10.28□□□□□ -0.76
TMA20P89886 YCL042WYCL042W 360 nt10.28□□□□□ -0.76
TMA20P89886 YCL074WYCL074W 927 nt10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.7 ms