Protein–RNA interactions for Protein: P59808

Sash1, SAM and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash1P59808 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sash1P59808 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sash1P59808 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sash1P59808 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sash1P59808 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sash1P59808 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sash1P59808 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sash1P59808 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sash1P59808 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sash1P59808 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sash1P59808 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sash1P59808 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sash1P59808 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sash1P59808 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sash1P59808 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sash1P59808 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sash1P59808 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sash1P59808 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sash1P59808 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sash1P59808 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sash1P59808 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sash1P59808 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sash1P59808 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sash1P59808 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sash1P59808 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sash1P59808 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sash1P59808 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sash1P59808 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sash1P59808 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sash1P59808 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sash1P59808 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sash1P59808 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sash1P59808 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sash1P59808 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sash1P59808 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sash1P59808 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sash1P59808 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sash1P59808 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sash1P59808 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sash1P59808 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sash1P59808 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Sash1P59808 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sash1P59808 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sash1P59808 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sash1P59808 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Sash1P59808 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sash1P59808 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sash1P59808 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sash1P59808 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sash1P59808 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sash1P59808 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Sash1P59808 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sash1P59808 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sash1P59808 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sash1P59808 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sash1P59808 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sash1P59808 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sash1P59808 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sash1P59808 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sash1P59808 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sash1P59808 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sash1P59808 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sash1P59808 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sash1P59808 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sash1P59808 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sash1P59808 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sash1P59808 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sash1P59808 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sash1P59808 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sash1P59808 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sash1P59808 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sash1P59808 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sash1P59808 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sash1P59808 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sash1P59808 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sash1P59808 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sash1P59808 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sash1P59808 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sash1P59808 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sash1P59808 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sash1P59808 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sash1P59808 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sash1P59808 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sash1P59808 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sash1P59808 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sash1P59808 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sash1P59808 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sash1P59808 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sash1P59808 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sash1P59808 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sash1P59808 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sash1P59808 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sash1P59808 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms