Protein–RNA interactions for Protein: P58871

Tnks1bp1, 182 kDa tankyrase-1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnks1bp1P58871 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Tnks1bp1P58871 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Tnks1bp1P58871 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Tnks1bp1P58871 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Tnks1bp1P58871 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Tnks1bp1P58871 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Tnks1bp1P58871 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Tnks1bp1P58871 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Tnks1bp1P58871 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Tnks1bp1P58871 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Tnks1bp1P58871 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Tnks1bp1P58871 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Tnks1bp1P58871 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Tnks1bp1P58871 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Tnks1bp1P58871 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Tnks1bp1P58871 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tnks1bp1P58871 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Tnks1bp1P58871 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tnks1bp1P58871 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Tnks1bp1P58871 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Tnks1bp1P58871 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Tnks1bp1P58871 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Tnks1bp1P58871 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Tnks1bp1P58871 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Tnks1bp1P58871 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Tnks1bp1P58871 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Tnks1bp1P58871 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Tnks1bp1P58871 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Tnks1bp1P58871 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tnks1bp1P58871 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Tnks1bp1P58871 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Tnks1bp1P58871 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Tnks1bp1P58871 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Tnks1bp1P58871 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tnks1bp1P58871 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Tnks1bp1P58871 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tnks1bp1P58871 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
Tnks1bp1P58871 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tnks1bp1P58871 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Tnks1bp1P58871 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Tnks1bp1P58871 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Tnks1bp1P58871 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Tnks1bp1P58871 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tnks1bp1P58871 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Tnks1bp1P58871 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tnks1bp1P58871 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Tnks1bp1P58871 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tnks1bp1P58871 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Tnks1bp1P58871 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tnks1bp1P58871 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tnks1bp1P58871 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Tnks1bp1P58871 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Tnks1bp1P58871 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Tnks1bp1P58871 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Tnks1bp1P58871 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Tnks1bp1P58871 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Tnks1bp1P58871 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Tnks1bp1P58871 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Tnks1bp1P58871 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Tnks1bp1P58871 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Tnks1bp1P58871 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Tnks1bp1P58871 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Tnks1bp1P58871 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Tnks1bp1P58871 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Tnks1bp1P58871 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Tnks1bp1P58871 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Tnks1bp1P58871 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Tnks1bp1P58871 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Tnks1bp1P58871 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Tnks1bp1P58871 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Tnks1bp1P58871 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Tnks1bp1P58871 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Tnks1bp1P58871 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Tnks1bp1P58871 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Tnks1bp1P58871 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Tnks1bp1P58871 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Tnks1bp1P58871 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Tnks1bp1P58871 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tnks1bp1P58871 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Tnks1bp1P58871 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Tnks1bp1P58871 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Tnks1bp1P58871 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tnks1bp1P58871 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Tnks1bp1P58871 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Tnks1bp1P58871 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tnks1bp1P58871 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Tnks1bp1P58871 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms