Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Dpf3P58269 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Dpf3P58269 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Dpf3P58269 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Dpf3P58269 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Dpf3P58269 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Dpf3P58269 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Dpf3P58269 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Dpf3P58269 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Dpf3P58269 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Dpf3P58269 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Dpf3P58269 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Dpf3P58269 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Dpf3P58269 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Dpf3P58269 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Dpf3P58269 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Dpf3P58269 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Dpf3P58269 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Dpf3P58269 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Dpf3P58269 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dpf3P58269 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Dpf3P58269 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Dpf3P58269 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dpf3P58269 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dpf3P58269 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dpf3P58269 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dpf3P58269 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dpf3P58269 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dpf3P58269 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dpf3P58269 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dpf3P58269 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Dpf3P58269 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dpf3P58269 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dpf3P58269 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dpf3P58269 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dpf3P58269 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dpf3P58269 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dpf3P58269 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Dpf3P58269 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dpf3P58269 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Dpf3P58269 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Dpf3P58269 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dpf3P58269 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Dpf3P58269 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Dpf3P58269 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Dpf3P58269 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dpf3P58269 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Dpf3P58269 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Dpf3P58269 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Dpf3P58269 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Dpf3P58269 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dpf3P58269 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Dpf3P58269 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Dpf3P58269 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Dpf3P58269 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Dpf3P58269 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dpf3P58269 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Dpf3P58269 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dpf3P58269 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dpf3P58269 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Dpf3P58269 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dpf3P58269 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dpf3P58269 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dpf3P58269 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dpf3P58269 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dpf3P58269 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dpf3P58269 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dpf3P58269 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dpf3P58269 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Dpf3P58269 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Dpf3P58269 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Dpf3P58269 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Dpf3P58269 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dpf3P58269 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dpf3P58269 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dpf3P58269 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dpf3P58269 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dpf3P58269 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dpf3P58269 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dpf3P58269 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms