Protein–RNA interactions for Protein: P53894

CBK1, Serine/threonine-protein kinase CBK1, yeastyeast

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CBK1P53894 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.69□□□□□ -0.22
CBK1P53894 DCW1YKL046C 1350 nt13.66□□□□□ -0.22
CBK1P53894 PTP1YDL230W 1008 nt13.65□□□□□ -0.22
CBK1P53894 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.65□□□□□ -0.22
CBK1P53894 PUS2YGL063W 1113 nt13.61□□□□□ -0.23
CBK1P53894 CAC2YML102W 1407 nt13.55□□□□□ -0.24
CBK1P53894 ART5YGR068C 1761 nt13.54□□□□□ -0.24
CBK1P53894 YJL152WYJL152W 360 nt13.54□□□□□ -0.24
CBK1P53894 TIR4YOR009W 1464 nt13.54□□□□□ -0.24
CBK1P53894 SSA4YER103W 1929 nt13.51□□□□□ -0.25
CBK1P53894 EMI2YDR516C 1503 nt13.48□□□□□ -0.25
CBK1P53894 GFD2YCL036W 1701 nt13.47□□□□□ -0.25
CBK1P53894 YCH1YGR203W 447 nt13.46□□□□□ -0.25
CBK1P53894 PET9YBL030C 957 nt13.44□□□□□ -0.26
CBK1P53894 DSK2YMR276W 1122 nt13.41□□□□□ -0.26
CBK1P53894 YDL221WYDL221W 552 nt13.39□□□□□ -0.27
CBK1P53894 YLR236CYLR236C 324 nt13.38□□□□□ -0.27
CBK1P53894 YMR057CYMR057C 372 nt13.38□□□□□ -0.27
CBK1P53894 YPR011CYPR011C 981 nt13.38□□□□□ -0.27
CBK1P53894 IMP2'YIL154C 1041 nt13.37□□□□□ -0.27
CBK1P53894 YMR090WYMR090W 684 nt13.36□□□□□ -0.27
CBK1P53894 IRC15YPL017C 1500 nt13.33□□□□□ -0.28
CBK1P53894 RTS2YOR077W 699 nt13.31□□□□□ -0.28
CBK1P53894 IDH1YNL037C 1083 nt13.29□□□□□ -0.28
CBK1P53894 FMP45YDL222C 930 nt13.27□□□□□ -0.29
CBK1P53894 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.24□□□□□ -0.29
CBK1P53894 GIS3YLR094C 1509 nt13.23□□□□□ -0.29
CBK1P53894 SDH1YKL148C 1923 nt13.21□□□□□ -0.3
CBK1P53894 FPS1YLL043W 2010 nt13.2□□□□□ -0.3
CBK1P53894 GBP2YCL011C 1284 nt13.2□□□□□ -0.3
CBK1P53894 YBR220CYBR220C 1683 nt13.2□□□□□ -0.3
CBK1P53894 CUE1YMR264W 612 nt13.17□□□□□ -0.3
CBK1P53894 SCC4YER147C 1875 nt13.15□□□□□ -0.3
CBK1P53894 YDR433WYDR433W 441 nt13.15□□□□□ -0.3
CBK1P53894 Q0182Q0182 405 nt13.15□□□□□ -0.3
CBK1P53894 LPX1YOR084W 1164 nt13.15□□□□□ -0.3
CBK1P53894 MOT3YMR070W 1473 nt13.14□□□□□ -0.31
CBK1P53894 ERV46YAL042W 1248 nt13.13□□□□□ -0.31
CBK1P53894 MXR2YCL033C 507 nt13.06□□□□□ -0.32
CBK1P53894 TCD2YKL027W 1344 nt13.04□□□□□ -0.32
CBK1P53894 YKR040CYKR040C 504 nt13.02□□□□□ -0.33
CBK1P53894 YIL100WYIL100W 354 nt13.01□□□□□ -0.33
CBK1P53894 RRD1YIL153W 1182 nt13.01□□□□□ -0.33
CBK1P53894 DED1YOR204W 1815 nt12.99□□□□□ -0.33
CBK1P53894 BDF1YLR399C 2061 nt12.98□□□□□ -0.33
CBK1P53894 SPP1YPL138C 1062 nt12.92□□□□□ -0.34
CBK1P53894 FMT1YBL013W 1206 nt12.87□□□□□ -0.35
CBK1P53894 FRD1YEL047C 1413 nt12.82□□□□□ -0.36
CBK1P53894 YSC84YHR016C 1407 nt12.81□□□□□ -0.36
CBK1P53894 TAT1YBR069C 1860 nt12.81□□□□□ -0.36
CBK1P53894 RRT12YCR045C 1476 nt12.81□□□□□ -0.36
CBK1P53894 FMP52YER004W 696 nt12.81□□□□□ -0.36
CBK1P53894 YNL195CYNL195C 786 nt12.81□□□□□ -0.36
CBK1P53894 YCL042WYCL042W 360 nt12.78□□□□□ -0.36
CBK1P53894 SOR2YDL246C 1074 nt12.77□□□□□ -0.37
CBK1P53894 SOR1YJR159W 1074 nt12.77□□□□□ -0.37
CBK1P53894 YHL050CYHL050C 2094 nt12.77□□□□□ -0.37
CBK1P53894 CWP1YKL096W 720 nt12.74□□□□□ -0.37
CBK1P53894 ADH2YMR303C 1047 nt12.71□□□□□ -0.37
CBK1P53894 SEC11YIR022W 504 nt12.69□□□□□ -0.38
CBK1P53894 PCM1YEL058W 1674 nt12.68□□□□□ -0.38
CBK1P53894 RTG1YOL067C 534 nt12.64□□□□□ -0.39
CBK1P53894 PCH2YBR186W 1695 nt12.62□□□□□ -0.39
CBK1P53894 SNF6YHL025W 999 nt12.62□□□□□ -0.39
CBK1P53894 PTH1YHR189W 573 nt12.61□□□□□ -0.39
CBK1P53894 MRPL8YJL063C 717 nt12.61□□□□□ -0.39
CBK1P53894 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.57□□□□□ -0.4
CBK1P53894 YEL076CYEL076C 651 nt12.57□□□□□ -0.4
CBK1P53894 YLR464WYLR464W 651 nt12.57□□□□□ -0.4
CBK1P53894 GUT2YIL155C 1950 nt12.55□□□□□ -0.4
CBK1P53894 YLR235CYLR235C 399 nt12.54□□□□□ -0.4
CBK1P53894 ADO1YJR105W 1023 nt12.5□□□□□ -0.41
CBK1P53894 DIC1YLR348C 897 nt12.49□□□□□ -0.41
CBK1P53894 LCB1YMR296C 1677 nt12.48□□□□□ -0.41
CBK1P53894 YIH1YCR059C 777 nt12.48□□□□□ -0.41
CBK1P53894 YKL030WYKL030W 606 nt12.48□□□□□ -0.41
CBK1P53894 SIM1YIL123W 1431 nt12.47□□□□□ -0.41
CBK1P53894 RNQ1YCL028W 1218 nt12.47□□□□□ -0.41
CBK1P53894 BIO4YNR057C 714 nt12.46□□□□□ -0.41
CBK1P53894 HUA1YGR268C 597 nt12.41□□□□□ -0.42
CBK1P53894 NCP1YHR042W 2076 nt12.41□□□□□ -0.42
CBK1P53894 TIM23YNR017W 669 nt12.4□□□□□ -0.42
CBK1P53894 PIB2YGL023C 1908 nt12.39□□□□□ -0.43
CBK1P53894 YLL053CYLL053C 459 nt12.39□□□□□ -0.43
CBK1P53894 RTF1YGL244W 1677 nt12.38□□□□□ -0.43
CBK1P53894 BOP3YNL042W 1191 nt12.35□□□□□ -0.43
CBK1P53894 YLR179CYLR179C 606 nt12.34□□□□□ -0.43
CBK1P53894 FTR1YER145C 1215 nt12.29□□□□□ -0.44
CBK1P53894 GAL1YBR020W 1587 nt12.27□□□□□ -0.44
CBK1P53894 TRM5YHR070W 1500 nt12.24□□□□□ -0.45
CBK1P53894 ERF2YLR246W 1080 nt12.24□□□□□ -0.45
CBK1P53894 WSC2YNL283C 1512 nt12.23□□□□□ -0.45
CBK1P53894 LYS4YDR234W 2082 nt12.22□□□□□ -0.45
CBK1P53894 YPR064WYPR064W 420 nt12.22□□□□□ -0.45
CBK1P53894 ATF2YGR177C 1608 nt12.22□□□□□ -0.45
CBK1P53894 AHT1YHR093W 549 nt12.21□□□□□ -0.45
CBK1P53894 AQY1YPR192W 918 nt12.21□□□□□ -0.45
CBK1P53894 PTK1YKL198C 1989 nt12.2□□□□□ -0.46
CBK1P53894 CRR1YLR213C 1269 nt12.2□□□□□ -0.46
CBK1P53894 YFL067WYFL067W 528 nt12.16□□□□□ -0.46
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