Protein–RNA interactions for Protein: P53849

GIS2, Zinc finger protein GIS2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIS2P53849 DCW1YKL046C 1350 nt8.4□□□□□ -1.06
GIS2P53849 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt8.39□□□□□ -1.07
GIS2P53849 UBX6YJL048C 1191 nt8.37□□□□□ -1.07
GIS2P53849 YDR095CYDR095C 411 nt8.36□□□□□ -1.07
GIS2P53849 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.36□□□□□ -1.07 RIP-Chip
GIS2P53849 YEL076CYEL076C 651 nt8.36□□□□□ -1.07
GIS2P53849 YLR464WYLR464W 651 nt8.36□□□□□ -1.07 RIP-Chip
GIS2P53849 BDF1YLR399C 2061 nt8.36□□□□□ -1.07
GIS2P53849 YLR236CYLR236C 324 nt8.34□□□□□ -1.07
GIS2P53849 YPR011CYPR011C 981 nt8.33□□□□□ -1.08
GIS2P53849 FUN26YAL022C 1554 nt8.32□□□□□ -1.08
GIS2P53849 TRM9YML014W 840 nt8.29□□□□□ -1.08 RIP-Chip
GIS2P53849 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt8.28□□□□□ -1.08
GIS2P53849 EMI2YDR516C 1503 nt8.27□□□□□ -1.09
GIS2P53849 SIS1YNL007C 1059 nt8.25□□□□□ -1.09
GIS2P53849 ALF1YNL148C 765 nt8.25□□□□□ -1.09 RIP-Chip
GIS2P53849 YMR090WYMR090W 684 nt8.23□□□□□ -1.09
GIS2P53849 TAT1YBR069C 1860 nt8.22□□□□□ -1.09 RIP-Chip
GIS2P53849 PTP1YDL230W 1008 nt8.22□□□□□ -1.09
GIS2P53849 ERV46YAL042W 1248 nt8.22□□□□□ -1.09 RIP-Chip
GIS2P53849 RPP2AYOL039W 321 nt8.22□□□□□ -1.09
GIS2P53849 RTG1YOL067C 534 nt8.22□□□□□ -1.09
GIS2P53849 CAC2YML102W 1407 nt8.21□□□□□ -1.09 RIP-Chip
GIS2P53849 YBR220CYBR220C 1683 nt8.21□□□□□ -1.09
GIS2P53849 CCT6YDR188W 1641 nt8.18□□□□□ -1.1 RIP-Chip
GIS2P53849 YDL221WYDL221W 552 nt8.18□□□□□ -1.1
GIS2P53849 LPX1YOR084W 1164 nt8.18□□□□□ -1.1
GIS2P53849 YDR094WYDR094W 336 nt8.17□□□□□ -1.1
GIS2P53849 HUA1YGR268C 597 nt8.15□□□□□ -1.1
GIS2P53849 IDH1YNL037C 1083 nt8.15□□□□□ -1.1
GIS2P53849 SDH1YKL148C 1923 nt8.15□□□□□ -1.11
GIS2P53849 SUF2tP(AGG)C 72 nt8.13□□□□□ -1.11
GIS2P53849 SUF10tP(AGG)N 72 nt8.13□□□□□ -1.11
GIS2P53849 SPP1YPL138C 1062 nt8.13□□□□□ -1.11 RIP-Chip
GIS2P53849 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.12□□□□□ -1.11
GIS2P53849 YKR040CYKR040C 504 nt8.1□□□□□ -1.11
GIS2P53849 IRC15YPL017C 1500 nt8.08□□□□□ -1.12
GIS2P53849 YJL152WYJL152W 360 nt8.08□□□□□ -1.12
GIS2P53849 YDR433WYDR433W 441 nt8.07□□□□□ -1.12
GIS2P53849 SCC4YER147C 1875 nt8.06□□□□□ -1.12
GIS2P53849 ART5YGR068C 1761 nt8.05□□□□□ -1.12
GIS2P53849 GIS3YLR094C 1509 nt8.03□□□□□ -1.12
GIS2P53849 GFD2YCL036W 1701 nt8.02□□□□□ -1.13
GIS2P53849 PET9YBL030C 957 nt7.98□□□□□ -1.13
GIS2P53849 RTS2YOR077W 699 nt7.96□□□□□ -1.14
GIS2P53849 GBP2YCL011C 1284 nt7.96□□□□□ -1.14 RIP-Chip
GIS2P53849 PCH2YBR186W 1695 nt7.95□□□□□ -1.14
GIS2P53849 SEC11YIR022W 504 nt7.94□□□□□ -1.14 RIP-Chip
GIS2P53849 GUT2YIL155C 1950 nt7.92□□□□□ -1.14
GIS2P53849 TIR4YOR009W 1464 nt7.92□□□□□ -1.14
GIS2P53849 YSC84YHR016C 1407 nt7.9□□□□□ -1.14
GIS2P53849 MXR2YCL033C 507 nt7.89□□□□□ -1.15
GIS2P53849 SBA1YKL117W 651 nt7.88□□□□□ -1.15 RIP-Chip
GIS2P53849 YMR057CYMR057C 372 nt7.88□□□□□ -1.15
GIS2P53849 CUE1YMR264W 612 nt7.88□□□□□ -1.15 RIP-Chip
GIS2P53849 YHL050CYHL050C 2094 nt7.87□□□□□ -1.15 RIP-Chip
GIS2P53849 TCD2YKL027W 1344 nt7.83□□□□□ -1.16
GIS2P53849 RRT12YCR045C 1476 nt7.83□□□□□ -1.16
GIS2P53849 YKL030WYKL030W 606 nt7.82□□□□□ -1.16
GIS2P53849 PIB2YGL023C 1908 nt7.82□□□□□ -1.16 RIP-Chip
GIS2P53849 FPS1YLL043W 2010 nt7.81□□□□□ -1.16
GIS2P53849 YLR235CYLR235C 399 nt7.81□□□□□ -1.16
GIS2P53849 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt7.81□□□□□ -1.16
GIS2P53849 RRT5YFR032C 870 nt7.79□□□□□ -1.16
GIS2P53849 YIL100WYIL100W 354 nt7.79□□□□□ -1.16
GIS2P53849 PAC11YDR488C 1602 nt7.78□□□□□ -1.16
GIS2P53849 PAU16YKL224C 372 nt7.78□□□□□ -1.16
GIS2P53849 YNL195CYNL195C 786 nt7.78□□□□□ -1.16
GIS2P53849 FRD1YEL047C 1413 nt7.77□□□□□ -1.17
GIS2P53849 YFR018CYFR018C 1092 nt7.75□□□□□ -1.17
GIS2P53849 RTF1YGL244W 1677 nt7.74□□□□□ -1.17 RIP-Chip
GIS2P53849 PTH1YHR189W 573 nt7.72□□□□□ -1.17
GIS2P53849 YCL042WYCL042W 360 nt7.71□□□□□ -1.18
GIS2P53849 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.69□□□□□ -1.18
GIS2P53849 BOP3YNL042W 1191 nt7.69□□□□□ -1.18
GIS2P53849 LCB1YMR296C 1677 nt7.68□□□□□ -1.18
GIS2P53849 SOR2YDL246C 1074 nt7.66□□□□□ -1.18
GIS2P53849 SOR1YJR159W 1074 nt7.66□□□□□ -1.18
GIS2P53849 DED1YOR204W 1815 nt7.66□□□□□ -1.18
GIS2P53849 PTK1YKL198C 1989 nt7.66□□□□□ -1.18
GIS2P53849 NCP1YHR042W 2076 nt7.64□□□□□ -1.19
GIS2P53849 SNF6YHL025W 999 nt7.62□□□□□ -1.19
GIS2P53849 RRD1YIL153W 1182 nt7.61□□□□□ -1.19
GIS2P53849 PRE6YOL038W 765 nt7.58□□□□□ -1.2 RIP-Chip
GIS2P53849 NAT4YMR069W 858 nt7.57□□□□□ -1.2
GIS2P53849 DIC1YLR348C 897 nt7.56□□□□□ -1.2
GIS2P53849 TIM23YNR017W 669 nt7.56□□□□□ -1.2
GIS2P53849 FMP52YER004W 696 nt7.54□□□□□ -1.2
GIS2P53849 YPR064WYPR064W 420 nt7.53□□□□□ -1.2
GIS2P53849 FMT1YBL013W 1206 nt7.52□□□□□ -1.21
GIS2P53849 YFL054CYFL054C 1941 nt7.49□□□□□ -1.21
GIS2P53849 YLR179CYLR179C 606 nt7.48□□□□□ -1.21
GIS2P53849 PCM1YEL058W 1674 nt7.47□□□□□ -1.21
GIS2P53849 GLK1YCL040W 1503 nt7.47□□□□□ -1.21
GIS2P53849 TAD3YLR316C 969 nt7.47□□□□□ -1.21
GIS2P53849 NVJ2YPR091C 2313 nt7.47□□□□□ -1.21 RIP-Chip
GIS2P53849 CWP1YKL096W 720 nt7.45□□□□□ -1.22
GIS2P53849 PEX25YPL112C 1185 nt7.45□□□□□ -1.22
GIS2P53849 SIM1YIL123W 1431 nt7.44□□□□□ -1.22
GIS2P53849 YMR244WYMR244W 1068 nt7.44□□□□□ -1.22
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