Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.25□□□□□ -0.61
RRN9P53437 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.25□□□□□ -0.61
RRN9P53437 SCC4YER147C 1875 nt11.23□□□□□ -0.61
RRN9P53437 RKM5YLR137W 1104 nt11.21□□□□□ -0.61
RRN9P53437 IRC15YPL017C 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
RRN9P53437 SEC11YIR022W 504 nt11.19□□□□□ -0.62
RRN9P53437 PCH2YBR186W 1695 nt11.19□□□□□ -0.62
RRN9P53437 FPS1YLL043W 2010 nt11.19□□□□□ -0.62
RRN9P53437 NVJ2YPR091C 2313 nt11.17□□□□□ -0.62
RRN9P53437 GUT2YIL155C 1950 nt11.15□□□□□ -0.62
RRN9P53437 GIS3YLR094C 1509 nt11.14□□□□□ -0.63
RRN9P53437 ART5YGR068C 1761 nt11.08□□□□□ -0.64
RRN9P53437 GFD2YCL036W 1701 nt11.07□□□□□ -0.64
RRN9P53437 PET9YBL030C 957 nt11.02□□□□□ -0.65
RRN9P53437 YSC84YHR016C 1407 nt11.01□□□□□ -0.65
RRN9P53437 YOL037CYOL037C 354 nt11□□□□□ -0.65
RRN9P53437 RTS2YOR077W 699 nt10.99□□□□□ -0.65
RRN9P53437 YOR139CYOR139C 393 nt10.99□□□□□ -0.65
RRN9P53437 TIR4YOR009W 1464 nt10.99□□□□□ -0.65
RRN9P53437 YCH1YGR203W 447 nt10.97□□□□□ -0.65
RRN9P53437 NPL3YDR432W 1245 nt10.96□□□□□ -0.65
RRN9P53437 PIB2YGL023C 1908 nt10.96□□□□□ -0.66
RRN9P53437 YHL050CYHL050C 2094 nt10.94□□□□□ -0.66
RRN9P53437 CUE1YMR264W 612 nt10.92□□□□□ -0.66
RRN9P53437 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.9□□□□□ -0.66
RRN9P53437 YMR057CYMR057C 372 nt10.89□□□□□ -0.67
RRN9P53437 RTF1YGL244W 1677 nt10.89□□□□□ -0.67
RRN9P53437 RRT12YCR045C 1476 nt10.87□□□□□ -0.67
RRN9P53437 Q0182Q0182 405 nt10.83□□□□□ -0.68
RRN9P53437 YNL195CYNL195C 786 nt10.83□□□□□ -0.68
RRN9P53437 YJL152WYJL152W 360 nt10.82□□□□□ -0.68
RRN9P53437 BOP3YNL042W 1191 nt10.81□□□□□ -0.68
RRN9P53437 YJL225CYJL225C 5277 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN9P53437 YIL100WYIL100W 354 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN9P53437 YLR281CYLR281C 468 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN9P53437 WHI5YOR083W 888 nt10.79□□□□□ -0.68
RRN9P53437 PTK1YKL198C 1989 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN9P53437 YLR236CYLR236C 324 nt10.7□□□□□ -0.7
RRN9P53437 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.69□□□□□ -0.7
RRN9P53437 NCP1YHR042W 2076 nt10.62□□□□□ -0.71
RRN9P53437 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RRN9P53437 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RRN9P53437 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RRN9P53437 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RRN9P53437 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.6□□□□□ -0.71
RRN9P53437 PUS2YGL063W 1113 nt10.59□□□□□ -0.71
RRN9P53437 IDH1YNL037C 1083 nt10.58□□□□□ -0.72
RRN9P53437 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.56□□□□□ -0.72
RRN9P53437 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.56□□□□□ -0.72
RRN9P53437 IMP2'YIL154C 1041 nt10.54□□□□□ -0.72
RRN9P53437 RRD1YIL153W 1182 nt10.53□□□□□ -0.72
RRN9P53437 DSK2YMR276W 1122 nt10.53□□□□□ -0.72
RRN9P53437 GBP2YCL011C 1284 nt10.53□□□□□ -0.72
RRN9P53437 YPR011CYPR011C 981 nt10.51□□□□□ -0.73
RRN9P53437 YFL054CYFL054C 1941 nt10.5□□□□□ -0.73
RRN9P53437 DED1YOR204W 1815 nt10.47□□□□□ -0.73
RRN9P53437 LCB1YMR296C 1677 nt10.44□□□□□ -0.74
RRN9P53437 TCD2YKL027W 1344 nt10.44□□□□□ -0.74
RRN9P53437 SPT8YLR055C 1809 nt10.44□□□□□ -0.74
RRN9P53437 FMP45YDL222C 930 nt10.41□□□□□ -0.74
RRN9P53437 FMP52YER004W 696 nt10.41□□□□□ -0.74
RRN9P53437 YDR433WYDR433W 441 nt10.4□□□□□ -0.74
RRN9P53437 FMT1YBL013W 1206 nt10.4□□□□□ -0.74
RRN9P53437 UME6YDR207C 2511 nt10.39□□□□□ -0.75
RRN9P53437 MXR2YCL033C 507 nt10.37□□□□□ -0.75
RRN9P53437 BOR1YNL275W 1731 nt10.36□□□□□ -0.75
RRN9P53437 ERV46YAL042W 1248 nt10.36□□□□□ -0.75
RRN9P53437 PCM1YEL058W 1674 nt10.34□□□□□ -0.75
RRN9P53437 LPX1YOR084W 1164 nt10.33□□□□□ -0.76
RRN9P53437 MOT3YMR070W 1473 nt10.31□□□□□ -0.76
RRN9P53437 YKR040CYKR040C 504 nt10.3□□□□□ -0.76
RRN9P53437 ADH2YMR303C 1047 nt10.29□□□□□ -0.76
RRN9P53437 SOR2YDL246C 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
RRN9P53437 SOR1YJR159W 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
RRN9P53437 CWP1YKL096W 720 nt10.28□□□□□ -0.76
RRN9P53437 SIM1YIL123W 1431 nt10.26□□□□□ -0.77
RRN9P53437 SWE1YJL187C 2460 nt10.24□□□□□ -0.77
RRN9P53437 LYS4YDR234W 2082 nt10.24□□□□□ -0.77
RRN9P53437 SNF6YHL025W 999 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN9P53437 FRD1YEL047C 1413 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN9P53437 YCL042WYCL042W 360 nt10.22□□□□□ -0.77
RRN9P53437 BIO4YNR057C 714 nt10.19□□□□□ -0.78
RRN9P53437 YIH1YCR059C 777 nt10.14□□□□□ -0.79
RRN9P53437 HSP60YLR259C 1719 nt10.13□□□□□ -0.79
RRN9P53437 RNQ1YCL028W 1218 nt10.11□□□□□ -0.79
RRN9P53437 YLL053CYLL053C 459 nt10.07□□□□□ -0.8
RRN9P53437 ERF2YLR246W 1080 nt10.06□□□□□ -0.8
RRN9P53437 RPM1RPM1 483 nt10.06□□□□□ -0.8
RRN9P53437 SPP1YPL138C 1062 nt10.06□□□□□ -0.8
RRN9P53437 GLK1YCL040W 1503 nt10.04□□□□□ -0.8
RRN9P53437 CRR1YLR213C 1269 nt10.03□□□□□ -0.8
RRN9P53437 DIC1YLR348C 897 nt10.01□□□□□ -0.81
RRN9P53437 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10□□□□□ -0.81
RRN9P53437 ALG12YNR030W 1656 nt9.99□□□□□ -0.81
RRN9P53437 ATF2YGR177C 1608 nt9.98□□□□□ -0.81
RRN9P53437 FTR1YER145C 1215 nt9.98□□□□□ -0.81
RRN9P53437 MCH5YOR306C 1566 nt9.97□□□□□ -0.81
RRN9P53437 FUR4YBR021W 1902 nt9.96□□□□□ -0.81
RRN9P53437 PTH1YHR189W 573 nt9.96□□□□□ -0.82
RRN9P53437 GAL1YBR020W 1587 nt9.95□□□□□ -0.82
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