Protein–RNA interactions for Protein: P53312

LSC2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSC2P53312 NPL3YDR432W 1245 nt13.55□□□□□ -0.24
LSC2P53312 GFD2YCL036W 1701 nt13.53□□□□□ -0.24
LSC2P53312 TIR4YOR009W 1464 nt13.52□□□□□ -0.25
LSC2P53312 IRC15YPL017C 1500 nt13.51□□□□□ -0.25
LSC2P53312 BDF1YLR399C 2061 nt13.5□□□□□ -0.25
LSC2P53312 YBR220CYBR220C 1683 nt13.5□□□□□ -0.25
LSC2P53312 YMR090WYMR090W 684 nt13.42□□□□□ -0.26
LSC2P53312 SDH1YKL148C 1923 nt13.42□□□□□ -0.26
LSC2P53312 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.41□□□□□ -0.26
LSC2P53312 PET9YBL030C 957 nt13.4□□□□□ -0.26
LSC2P53312 RTS2YOR077W 699 nt13.4□□□□□ -0.26
LSC2P53312 YCH1YGR203W 447 nt13.39□□□□□ -0.27
LSC2P53312 GIS3YLR094C 1509 nt13.39□□□□□ -0.27
LSC2P53312 YLR281CYLR281C 468 nt13.37□□□□□ -0.27
LSC2P53312 WHI5YOR083W 888 nt13.34□□□□□ -0.27
LSC2P53312 YMR057CYMR057C 372 nt13.33□□□□□ -0.28
LSC2P53312 SCC4YER147C 1875 nt13.31□□□□□ -0.28
LSC2P53312 TAT1YBR069C 1860 nt13.3□□□□□ -0.28
LSC2P53312 YGR139WYGR139W 339 nt13.3□□□□□ -0.28
LSC2P53312 YJL152WYJL152W 360 nt13.29□□□□□ -0.28
LSC2P53312 FPS1YLL043W 2010 nt13.23□□□□□ -0.29
LSC2P53312 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.22□□□□□ -0.29
LSC2P53312 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.22□□□□□ -0.29
LSC2P53312 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.22□□□□□ -0.29
LSC2P53312 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.22□□□□□ -0.29
LSC2P53312 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.22□□□□□ -0.29
LSC2P53312 CUE1YMR264W 612 nt13.22□□□□□ -0.29
LSC2P53312 PUS2YGL063W 1113 nt13.16□□□□□ -0.3
LSC2P53312 YLR236CYLR236C 324 nt13.13□□□□□ -0.31
LSC2P53312 YPR011CYPR011C 981 nt13.13□□□□□ -0.31
LSC2P53312 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.07□□□□□ -0.32
LSC2P53312 YSC84YHR016C 1407 nt13.04□□□□□ -0.32
LSC2P53312 Q0182Q0182 405 nt13.03□□□□□ -0.32
LSC2P53312 DSK2YMR276W 1122 nt13.02□□□□□ -0.33
LSC2P53312 YHL050CYHL050C 2094 nt13.01□□□□□ -0.33
LSC2P53312 RRT12YCR045C 1476 nt13□□□□□ -0.33
LSC2P53312 IDH1YNL037C 1083 nt12.99□□□□□ -0.33
LSC2P53312 YIL100WYIL100W 354 nt12.97□□□□□ -0.33
LSC2P53312 RRD1YIL153W 1182 nt12.96□□□□□ -0.33
LSC2P53312 GBP2YCL011C 1284 nt12.95□□□□□ -0.34
LSC2P53312 MOT3YMR070W 1473 nt12.95□□□□□ -0.34
LSC2P53312 PCH2YBR186W 1695 nt12.93□□□□□ -0.34
LSC2P53312 DED1YOR204W 1815 nt12.93□□□□□ -0.34
LSC2P53312 IMP2'YIL154C 1041 nt12.93□□□□□ -0.34
LSC2P53312 SEC11YIR022W 504 nt12.9□□□□□ -0.34
LSC2P53312 GUT2YIL155C 1950 nt12.9□□□□□ -0.34
LSC2P53312 FMP45YDL222C 930 nt12.88□□□□□ -0.35
LSC2P53312 LPX1YOR084W 1164 nt12.88□□□□□ -0.35
LSC2P53312 MXR2YCL033C 507 nt12.88□□□□□ -0.35
LSC2P53312 FMT1YBL013W 1206 nt12.84□□□□□ -0.35
LSC2P53312 YDR433WYDR433W 441 nt12.83□□□□□ -0.36
LSC2P53312 ERV46YAL042W 1248 nt12.82□□□□□ -0.36
LSC2P53312 PIB2YGL023C 1908 nt12.82□□□□□ -0.36
LSC2P53312 YNL195CYNL195C 786 nt12.8□□□□□ -0.36
LSC2P53312 TCD2YKL027W 1344 nt12.8□□□□□ -0.36
LSC2P53312 YKR040CYKR040C 504 nt12.69□□□□□ -0.38
LSC2P53312 FMP52YER004W 696 nt12.68□□□□□ -0.38
LSC2P53312 NCP1YHR042W 2076 nt12.66□□□□□ -0.38
LSC2P53312 FRD1YEL047C 1413 nt12.65□□□□□ -0.38
LSC2P53312 ADH2YMR303C 1047 nt12.65□□□□□ -0.38
LSC2P53312 SOR2YDL246C 1074 nt12.64□□□□□ -0.39
LSC2P53312 SOR1YJR159W 1074 nt12.64□□□□□ -0.39
LSC2P53312 PCM1YEL058W 1674 nt12.64□□□□□ -0.39
LSC2P53312 RTF1YGL244W 1677 nt12.64□□□□□ -0.39
LSC2P53312 LCB1YMR296C 1677 nt12.63□□□□□ -0.39
LSC2P53312 SPP1YPL138C 1062 nt12.62□□□□□ -0.39
LSC2P53312 CWP1YKL096W 720 nt12.61□□□□□ -0.39
LSC2P53312 BOP3YNL042W 1191 nt12.55□□□□□ -0.4
LSC2P53312 PTK1YKL198C 1989 nt12.52□□□□□ -0.4
LSC2P53312 YCL042WYCL042W 360 nt12.51□□□□□ -0.41
LSC2P53312 SNF6YHL025W 999 nt12.5□□□□□ -0.41
LSC2P53312 BIO4YNR057C 714 nt12.47□□□□□ -0.41
LSC2P53312 SIM1YIL123W 1431 nt12.46□□□□□ -0.41
LSC2P53312 NME1NME1 340 nt12.45□□□□□ -0.42
LSC2P53312 YIH1YCR059C 777 nt12.41□□□□□ -0.42
LSC2P53312 LYS4YDR234W 2082 nt12.38□□□□□ -0.43
LSC2P53312 PTH1YHR189W 573 nt12.37□□□□□ -0.43
LSC2P53312 RNQ1YCL028W 1218 nt12.35□□□□□ -0.43
LSC2P53312 DIC1YLR348C 897 nt12.33□□□□□ -0.44
LSC2P53312 YLL053CYLL053C 459 nt12.32□□□□□ -0.44
LSC2P53312 RTG1YOL067C 534 nt12.26□□□□□ -0.45
LSC2P53312 CRR1YLR213C 1269 nt12.24□□□□□ -0.45
LSC2P53312 ATF2YGR177C 1608 nt12.23□□□□□ -0.45
LSC2P53312 YFL054CYFL054C 1941 nt12.22□□□□□ -0.45
LSC2P53312 FTR1YER145C 1215 nt12.22□□□□□ -0.45
LSC2P53312 YLR235CYLR235C 399 nt12.2□□□□□ -0.46
LSC2P53312 ERF2YLR246W 1080 nt12.2□□□□□ -0.46
LSC2P53312 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
LSC2P53312 GAL1YBR020W 1587 nt12.19□□□□□ -0.46
LSC2P53312 TRM5YHR070W 1500 nt12.17□□□□□ -0.46
LSC2P53312 TIM23YNR017W 669 nt12.17□□□□□ -0.46
LSC2P53312 MIC10YCL057C-A 294 nt12.16□□□□□ -0.46
LSC2P53312 SPT8YLR055C 1809 nt12.15□□□□□ -0.46
LSC2P53312 YKL030WYKL030W 606 nt12.13□□□□□ -0.47
LSC2P53312 YLR179CYLR179C 606 nt12.1□□□□□ -0.47
LSC2P53312 SNG1YGR197C 1644 nt12.1□□□□□ -0.47
LSC2P53312 WSC2YNL283C 1512 nt12.1□□□□□ -0.47
LSC2P53312 HEM12YDR047W 1089 nt12.06□□□□□ -0.48
LSC2P53312 YFL067WYFL067W 528 nt12.06□□□□□ -0.48
LSC2P53312 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms