Protein–RNA interactions for Protein: P52490

UBC13, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 13, yeastyeast

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBC13P52490 SIS1YNL007C 1059 nt10.58□□□□□ -0.72
UBC13P52490 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.54□□□□□ -0.72
UBC13P52490 PUS2YGL063W 1113 nt10.53□□□□□ -0.72
UBC13P52490 RPP2AYOL039W 321 nt10.53□□□□□ -0.72
UBC13P52490 Q0182Q0182 405 nt10.48□□□□□ -0.73
UBC13P52490 PTP1YDL230W 1008 nt10.45□□□□□ -0.74
UBC13P52490 IMP2'YIL154C 1041 nt10.45□□□□□ -0.74
UBC13P52490 YCH1YGR203W 447 nt10.4□□□□□ -0.74
UBC13P52490 DSK2YMR276W 1122 nt10.4□□□□□ -0.74
UBC13P52490 DCW1YKL046C 1350 nt10.39□□□□□ -0.75
UBC13P52490 TIR4YOR009W 1464 nt10.38□□□□□ -0.75
UBC13P52490 YJL152WYJL152W 360 nt10.38□□□□□ -0.75
UBC13P52490 PET9YBL030C 957 nt10.36□□□□□ -0.75
UBC13P52490 ART5YGR068C 1761 nt10.35□□□□□ -0.75
UBC13P52490 GFD2YCL036W 1701 nt10.32□□□□□ -0.76
UBC13P52490 CAC2YML102W 1407 nt10.32□□□□□ -0.76
UBC13P52490 EMI2YDR516C 1503 nt10.3□□□□□ -0.76
UBC13P52490 YLR236CYLR236C 324 nt10.3□□□□□ -0.76
UBC13P52490 IDH1YNL037C 1083 nt10.29□□□□□ -0.76
UBC13P52490 YMR090WYMR090W 684 nt10.28□□□□□ -0.76
UBC13P52490 YPR011CYPR011C 981 nt10.28□□□□□ -0.76
UBC13P52490 BDF1YLR399C 2061 nt10.26□□□□□ -0.77
UBC13P52490 FMP45YDL222C 930 nt10.25□□□□□ -0.77
UBC13P52490 YDL221WYDL221W 552 nt10.24□□□□□ -0.77
UBC13P52490 YMR057CYMR057C 372 nt10.24□□□□□ -0.77
UBC13P52490 MOT3YMR070W 1473 nt10.23□□□□□ -0.77
UBC13P52490 ERV46YAL042W 1248 nt10.19□□□□□ -0.78
UBC13P52490 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.19□□□□□ -0.78
UBC13P52490 IRC15YPL017C 1500 nt10.18□□□□□ -0.78
UBC13P52490 GBP2YCL011C 1284 nt10.15□□□□□ -0.78
UBC13P52490 YBR220CYBR220C 1683 nt10.15□□□□□ -0.79
UBC13P52490 TAT1YBR069C 1860 nt10.15□□□□□ -0.79
UBC13P52490 RTS2YOR077W 699 nt10.13□□□□□ -0.79
UBC13P52490 FPS1YLL043W 2010 nt10.12□□□□□ -0.79
UBC13P52490 LPX1YOR084W 1164 nt10.12□□□□□ -0.79
UBC13P52490 YDR433WYDR433W 441 nt10.11□□□□□ -0.79
UBC13P52490 CUE1YMR264W 612 nt10.11□□□□□ -0.79
UBC13P52490 SDH1YKL148C 1923 nt10.1□□□□□ -0.79
UBC13P52490 GIS3YLR094C 1509 nt10.1□□□□□ -0.79
UBC13P52490 YKR040CYKR040C 504 nt10.09□□□□□ -0.79
UBC13P52490 TCD2YKL027W 1344 nt10.07□□□□□ -0.8
UBC13P52490 SCC4YER147C 1875 nt10.05□□□□□ -0.8
UBC13P52490 RRD1YIL153W 1182 nt10□□□□□ -0.81
UBC13P52490 MXR2YCL033C 507 nt10□□□□□ -0.81
UBC13P52490 YIL100WYIL100W 354 nt9.99□□□□□ -0.81
UBC13P52490 DED1YOR204W 1815 nt9.98□□□□□ -0.81
UBC13P52490 FMP52YER004W 696 nt9.93□□□□□ -0.82
UBC13P52490 MRPL8YJL063C 717 nt9.93□□□□□ -0.82
UBC13P52490 SPP1YPL138C 1062 nt9.91□□□□□ -0.82
UBC13P52490 YJL225CYJL225C 5277 nt9.9□□□□□ -0.82
UBC13P52490 SOR2YDL246C 1074 nt9.9□□□□□ -0.82
UBC13P52490 SEC11YIR022W 504 nt9.9□□□□□ -0.82
UBC13P52490 SOR1YJR159W 1074 nt9.9□□□□□ -0.82
UBC13P52490 FRD1YEL047C 1413 nt9.89□□□□□ -0.83
UBC13P52490 FMT1YBL013W 1206 nt9.86□□□□□ -0.83
UBC13P52490 YCL042WYCL042W 360 nt9.86□□□□□ -0.83
UBC13P52490 PCH2YBR186W 1695 nt9.83□□□□□ -0.84
UBC13P52490 YNL195CYNL195C 786 nt9.83□□□□□ -0.84
UBC13P52490 RTG1YOL067C 534 nt9.82□□□□□ -0.84
UBC13P52490 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.81□□□□□ -0.84
UBC13P52490 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.81□□□□□ -0.84
UBC13P52490 ADO1YJR105W 1023 nt9.81□□□□□ -0.84
UBC13P52490 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.8□□□□□ -0.84
UBC13P52490 YEL076CYEL076C 651 nt9.8□□□□□ -0.84
UBC13P52490 YLR464WYLR464W 651 nt9.8□□□□□ -0.84
UBC13P52490 GUT2YIL155C 1950 nt9.77□□□□□ -0.84
UBC13P52490 YSC84YHR016C 1407 nt9.76□□□□□ -0.85
UBC13P52490 CWP1YKL096W 720 nt9.75□□□□□ -0.85
UBC13P52490 YLR235CYLR235C 399 nt9.74□□□□□ -0.85
UBC13P52490 ADH2YMR303C 1047 nt9.74□□□□□ -0.85
UBC13P52490 PCM1YEL058W 1674 nt9.74□□□□□ -0.85
UBC13P52490 YHL050CYHL050C 2094 nt9.73□□□□□ -0.85
UBC13P52490 RRT12YCR045C 1476 nt9.72□□□□□ -0.85
UBC13P52490 SNF6YHL025W 999 nt9.7□□□□□ -0.86
UBC13P52490 HUA1YGR268C 597 nt9.67□□□□□ -0.86
UBC13P52490 PTH1YHR189W 573 nt9.67□□□□□ -0.86
UBC13P52490 YKL030WYKL030W 606 nt9.67□□□□□ -0.86
UBC13P52490 YIH1YCR059C 777 nt9.64□□□□□ -0.87
UBC13P52490 RNQ1YCL028W 1218 nt9.63□□□□□ -0.87
UBC13P52490 DIC1YLR348C 897 nt9.62□□□□□ -0.87
UBC13P52490 RTF1YGL244W 1677 nt9.6□□□□□ -0.87
UBC13P52490 LCB1YMR296C 1677 nt9.59□□□□□ -0.87
UBC13P52490 PAC11YDR488C 1602 nt9.58□□□□□ -0.88
UBC13P52490 TIM23YNR017W 669 nt9.58□□□□□ -0.88
UBC13P52490 PIB2YGL023C 1908 nt9.58□□□□□ -0.88
UBC13P52490 BOP3YNL042W 1191 nt9.56□□□□□ -0.88
UBC13P52490 BIO4YNR057C 714 nt9.56□□□□□ -0.88
UBC13P52490 SIM1YIL123W 1431 nt9.55□□□□□ -0.88
UBC13P52490 YLR179CYLR179C 606 nt9.51□□□□□ -0.89
UBC13P52490 YLL053CYLL053C 459 nt9.5□□□□□ -0.89
UBC13P52490 NCP1YHR042W 2076 nt9.49□□□□□ -0.89
UBC13P52490 AQY1YPR192W 918 nt9.49□□□□□ -0.89
UBC13P52490 FTR1YER145C 1215 nt9.47□□□□□ -0.89
UBC13P52490 YPR064WYPR064W 420 nt9.47□□□□□ -0.89
UBC13P52490 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.45□□□□□ -0.9
UBC13P52490 AHT1YHR093W 549 nt9.45□□□□□ -0.9
UBC13P52490 YDR094WYDR094W 336 nt9.44□□□□□ -0.9
UBC13P52490 ERF2YLR246W 1080 nt9.44□□□□□ -0.9
UBC13P52490 WSC2YNL283C 1512 nt9.44□□□□□ -0.9
UBC13P52490 GAL1YBR020W 1587 nt9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.9 ms