Protein–RNA interactions for Protein: P47082

AVT1, Vacuolar amino acid transporter 1, yeastyeast

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT1P47082 SIS1YNL007C 1059 nt13.4□□□□□ -0.26
AVT1P47082 YPR011CYPR011C 981 nt13.4□□□□□ -0.26
AVT1P47082 YLR236CYLR236C 324 nt13.36□□□□□ -0.27
AVT1P47082 MEP2YNL142W 1500 nt13.35□□□□□ -0.27
AVT1P47082 DSK2YMR276W 1122 nt13.33□□□□□ -0.28
AVT1P47082 PTP1YDL230W 1008 nt13.3□□□□□ -0.28
AVT1P47082 YCH1YGR203W 447 nt13.29□□□□□ -0.28
AVT1P47082 RPP2AYOL039W 321 nt13.29□□□□□ -0.28
AVT1P47082 YJL152WYJL152W 360 nt13.28□□□□□ -0.28
AVT1P47082 TIR4YOR009W 1464 nt13.28□□□□□ -0.28
AVT1P47082 MOT3YMR070W 1473 nt13.26□□□□□ -0.29
AVT1P47082 FMP45YDL222C 930 nt13.25□□□□□ -0.29
AVT1P47082 IMP2'YIL154C 1041 nt13.24□□□□□ -0.29
AVT1P47082 ART5YGR068C 1761 nt13.2□□□□□ -0.3
AVT1P47082 DCW1YKL046C 1350 nt13.2□□□□□ -0.3
AVT1P47082 CAC2YML102W 1407 nt13.14□□□□□ -0.31
AVT1P47082 GFD2YCL036W 1701 nt13.13□□□□□ -0.31
AVT1P47082 LPX1YOR084W 1164 nt13.1□□□□□ -0.31
AVT1P47082 PET9YBL030C 957 nt13.09□□□□□ -0.31
AVT1P47082 IDH1YNL037C 1083 nt13.09□□□□□ -0.31
AVT1P47082 YMR057CYMR057C 372 nt13.08□□□□□ -0.32
AVT1P47082 ERV46YAL042W 1248 nt13.06□□□□□ -0.32
AVT1P47082 EMI2YDR516C 1503 nt13□□□□□ -0.33
AVT1P47082 GBP2YCL011C 1284 nt12.99□□□□□ -0.33
AVT1P47082 YDR433WYDR433W 441 nt12.98□□□□□ -0.33
AVT1P47082 RTS2YOR077W 699 nt12.95□□□□□ -0.34
AVT1P47082 SPP1YPL138C 1062 nt12.95□□□□□ -0.34
AVT1P47082 IRC15YPL017C 1500 nt12.94□□□□□ -0.34
AVT1P47082 MXR2YCL033C 507 nt12.94□□□□□ -0.34
AVT1P47082 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.94□□□□□ -0.34
AVT1P47082 YDL221WYDL221W 552 nt12.92□□□□□ -0.34
AVT1P47082 FPS1YLL043W 2010 nt12.92□□□□□ -0.34
AVT1P47082 YKR040CYKR040C 504 nt12.91□□□□□ -0.34
AVT1P47082 SSA4YER103W 1929 nt12.88□□□□□ -0.35
AVT1P47082 DED1YOR204W 1815 nt12.83□□□□□ -0.35
AVT1P47082 GIS3YLR094C 1509 nt12.83□□□□□ -0.36
AVT1P47082 RRD1YIL153W 1182 nt12.81□□□□□ -0.36
AVT1P47082 CUE1YMR264W 612 nt12.8□□□□□ -0.36
AVT1P47082 TCD2YKL027W 1344 nt12.8□□□□□ -0.36
AVT1P47082 YMR090WYMR090W 684 nt12.79□□□□□ -0.36
AVT1P47082 MRPL8YJL063C 717 nt12.75□□□□□ -0.37
AVT1P47082 RTG1YOL067C 534 nt12.74□□□□□ -0.37
AVT1P47082 SDH1YKL148C 1923 nt12.73□□□□□ -0.37
AVT1P47082 YBR220CYBR220C 1683 nt12.71□□□□□ -0.37
AVT1P47082 FRD1YEL047C 1413 nt12.71□□□□□ -0.38
AVT1P47082 FMT1YBL013W 1206 nt12.69□□□□□ -0.38
AVT1P47082 SCC4YER147C 1875 nt12.68□□□□□ -0.38
AVT1P47082 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.67□□□□□ -0.38
AVT1P47082 YEL076CYEL076C 651 nt12.67□□□□□ -0.38
AVT1P47082 YLR464WYLR464W 651 nt12.67□□□□□ -0.38
AVT1P47082 SOR2YDL246C 1074 nt12.6□□□□□ -0.39
AVT1P47082 SOR1YJR159W 1074 nt12.6□□□□□ -0.39
AVT1P47082 YIL100WYIL100W 354 nt12.59□□□□□ -0.39
AVT1P47082 ADO1YJR105W 1023 nt12.58□□□□□ -0.4
AVT1P47082 YCL042WYCL042W 360 nt12.55□□□□□ -0.4
AVT1P47082 FMP52YER004W 696 nt12.53□□□□□ -0.4
AVT1P47082 PTH1YHR189W 573 nt12.52□□□□□ -0.41
AVT1P47082 ADH2YMR303C 1047 nt12.49□□□□□ -0.41
AVT1P47082 CWP1YKL096W 720 nt12.48□□□□□ -0.41
AVT1P47082 HUA1YGR268C 597 nt12.41□□□□□ -0.42
AVT1P47082 PCM1YEL058W 1674 nt12.4□□□□□ -0.42
AVT1P47082 RRT12YCR045C 1476 nt12.4□□□□□ -0.43
AVT1P47082 YLR235CYLR235C 399 nt12.39□□□□□ -0.43
AVT1P47082 BDF1YLR399C 2061 nt12.39□□□□□ -0.43
AVT1P47082 UBX6YJL048C 1191 nt12.38□□□□□ -0.43
AVT1P47082 YKL030WYKL030W 606 nt12.37□□□□□ -0.43
AVT1P47082 LCB1YMR296C 1677 nt12.35□□□□□ -0.43
AVT1P47082 YSC84YHR016C 1407 nt12.35□□□□□ -0.43
AVT1P47082 YHL050CYHL050C 2094 nt12.34□□□□□ -0.43
AVT1P47082 YNL195CYNL195C 786 nt12.33□□□□□ -0.44
AVT1P47082 SNF6YHL025W 999 nt12.32□□□□□ -0.44
AVT1P47082 DIC1YLR348C 897 nt12.3□□□□□ -0.44
AVT1P47082 YIH1YCR059C 777 nt12.24□□□□□ -0.45
AVT1P47082 TIM23YNR017W 669 nt12.24□□□□□ -0.45
AVT1P47082 RNQ1YCL028W 1218 nt12.23□□□□□ -0.45
AVT1P47082 TAT1YBR069C 1860 nt12.23□□□□□ -0.45
AVT1P47082 YDR094WYDR094W 336 nt12.21□□□□□ -0.45
AVT1P47082 YLR179CYLR179C 606 nt12.16□□□□□ -0.46
AVT1P47082 BIO4YNR057C 714 nt12.16□□□□□ -0.46
AVT1P47082 SEC11YIR022W 504 nt12.14□□□□□ -0.47
AVT1P47082 SIM1YIL123W 1431 nt12.12□□□□□ -0.47
AVT1P47082 YLL053CYLL053C 459 nt12.12□□□□□ -0.47
AVT1P47082 WSC2YNL283C 1512 nt12.11□□□□□ -0.47
AVT1P47082 PCH2YBR186W 1695 nt12.08□□□□□ -0.48
AVT1P47082 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.07□□□□□ -0.48
AVT1P47082 AHT1YHR093W 549 nt12.07□□□□□ -0.48
AVT1P47082 FTR1YER145C 1215 nt12.05□□□□□ -0.48
AVT1P47082 YPR064WYPR064W 420 nt12.05□□□□□ -0.48
AVT1P47082 NCP1YHR042W 2076 nt12.02□□□□□ -0.48
AVT1P47082 GAL1YBR020W 1587 nt12.02□□□□□ -0.49
AVT1P47082 GUT2YIL155C 1950 nt12.02□□□□□ -0.49
AVT1P47082 TAD3YLR316C 969 nt12.02□□□□□ -0.49
AVT1P47082 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.01□□□□□ -0.49
AVT1P47082 TRM5YHR070W 1500 nt11.98□□□□□ -0.49
AVT1P47082 YFR018CYFR018C 1092 nt11.97□□□□□ -0.49
AVT1P47082 PRE6YOL038W 765 nt11.96□□□□□ -0.49
AVT1P47082 AQY1YPR192W 918 nt11.96□□□□□ -0.49
AVT1P47082 ATF2YGR177C 1608 nt11.96□□□□□ -0.5
AVT1P47082 PIB2YGL023C 1908 nt11.94□□□□□ -0.5
AVT1P47082 PAU16YKL224C 372 nt11.91□□□□□ -0.5
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