Protein–RNA interactions for Protein: P47044

YJL055W, LOG family protein YJL055W, yeastyeast

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL055WP47044 SHU1YHL006C 453 nt11.42□□□□□ -0.58
YJL055WP47044 YHL050CYHL050C 2094 nt11.36□□□□□ -0.59
YJL055WP47044 SRB2YHR041C 633 nt11.35□□□□□ -0.59
YJL055WP47044 BDH2YAL061W 1254 nt11.32□□□□□ -0.6
YJL055WP47044 BOP3YNL042W 1191 nt11.29□□□□□ -0.6
YJL055WP47044 YGR021WYGR021W 873 nt11.27□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 SIS1YNL007C 1059 nt11.27□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 PTK1YKL198C 1989 nt11.25□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 TRM9YML014W 840 nt11.24□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 WWM1YFL010C 636 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 RRT12YCR045C 1476 nt11.23□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 RTS2YOR077W 699 nt11.22□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 GFD2YCL036W 1701 nt11.22□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 BOR1YNL275W 1731 nt11.21□□□□□ -0.61
YJL055WP47044 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.19□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 ART5YGR068C 1761 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 CCT6YDR188W 1641 nt11.17□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 HOM6YJR139C 1080 nt11.16□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 UME6YDR207C 2511 nt11.16□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 LSM3YLR438C-A 270 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL055WP47044 YNL195CYNL195C 786 nt11.14□□□□□ -0.63
YJL055WP47044 CUE1YMR264W 612 nt11.1□□□□□ -0.63
YJL055WP47044 PET9YBL030C 957 nt11.05□□□□□ -0.64
YJL055WP47044 MNP1YGL068W 585 nt11.03□□□□□ -0.64
YJL055WP47044 YFL054CYFL054C 1941 nt11.02□□□□□ -0.65
YJL055WP47044 RKM5YLR137W 1104 nt11□□□□□ -0.65
YJL055WP47044 YIL100WYIL100W 354 nt10.99□□□□□ -0.65
YJL055WP47044 NCP1YHR042W 2076 nt10.98□□□□□ -0.65
YJL055WP47044 SPT8YLR055C 1809 nt10.97□□□□□ -0.65
YJL055WP47044 YOL037CYOL037C 354 nt10.96□□□□□ -0.65
YJL055WP47044 YOR139CYOR139C 393 nt10.93□□□□□ -0.66
YJL055WP47044 NPL3YDR432W 1245 nt10.91□□□□□ -0.66
YJL055WP47044 YCH1YGR203W 447 nt10.91□□□□□ -0.66
YJL055WP47044 YJL225CYJL225C 5277 nt10.9□□□□□ -0.66
YJL055WP47044 MCH5YOR306C 1566 nt10.87□□□□□ -0.67
YJL055WP47044 RPM1RPM1 483 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL055WP47044 TIR4YOR009W 1464 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL055WP47044 HSP60YLR259C 1719 nt10.83□□□□□ -0.68
YJL055WP47044 YMR057CYMR057C 372 nt10.81□□□□□ -0.68
YJL055WP47044 YLR236CYLR236C 324 nt10.79□□□□□ -0.68
YJL055WP47044 ALG12YNR030W 1656 nt10.78□□□□□ -0.68
YJL055WP47044 SWE1YJL187C 2460 nt10.73□□□□□ -0.69
YJL055WP47044 LCB1YMR296C 1677 nt10.7□□□□□ -0.7
YJL055WP47044 GLK1YCL040W 1503 nt10.64□□□□□ -0.71
YJL055WP47044 YLR281CYLR281C 468 nt10.64□□□□□ -0.71
YJL055WP47044 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.63□□□□□ -0.71
YJL055WP47044 WHI5YOR083W 888 nt10.6□□□□□ -0.71
YJL055WP47044 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.53□□□□□ -0.72
YJL055WP47044 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.5□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 NAR1YNL240C 1476 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 PUS2YGL063W 1113 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 IMP2'YIL154C 1041 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 YJL152WYJL152W 360 nt10.49□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 DSK2YMR276W 1122 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 FUR4YBR021W 1902 nt10.48□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 LYS4YDR234W 2082 nt10.47□□□□□ -0.73
YJL055WP47044 FRE6YLL051C 2139 nt10.46□□□□□ -0.74
YJL055WP47044 AAC1YMR056C 930 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL055WP47044 BIO4YNR057C 714 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL055WP47044 SIM1YIL123W 1431 nt10.41□□□□□ -0.74
YJL055WP47044 PRP4YPR178W 1398 nt10.39□□□□□ -0.75
YJL055WP47044 IDH1YNL037C 1083 nt10.37□□□□□ -0.75
YJL055WP47044 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL055WP47044 YEL076CYEL076C 651 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL055WP47044 YLR464WYLR464W 651 nt10.36□□□□□ -0.75
YJL055WP47044 DPS1YLL018C 1674 nt10.34□□□□□ -0.75
YJL055WP47044 BIO5YNR056C 1686 nt10.28□□□□□ -0.76
YJL055WP47044 BMT6YLR063W 1098 nt10.26□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 PCM1YEL058W 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 GBP2YCL011C 1284 nt10.25□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 YPR011CYPR011C 981 nt10.24□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 FMP52YER004W 696 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 CYT2YKL087C 675 nt10.23□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 CCA1YER168C 1641 nt10.22□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 PBP1YGR178C 2169 nt10.22□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 FMP45YDL222C 930 nt10.22□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.21□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 ERV46YAL042W 1248 nt10.21□□□□□ -0.77
YJL055WP47044 RRD1YIL153W 1182 nt10.2□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 SNF1YDR477W 1902 nt10.19□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 CMP2YML057W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 TCD2YKL027W 1344 nt10.17□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 YKR005CYKR005C 1578 nt10.17□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 YDR433WYDR433W 441 nt10.16□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 ERF2YLR246W 1080 nt10.16□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 CRR1YLR213C 1269 nt10.15□□□□□ -0.78
YJL055WP47044 YKR040CYKR040C 504 nt10.12□□□□□ -0.79
YJL055WP47044 RAX1YOR301W 1308 nt10.11□□□□□ -0.79
YJL055WP47044 LPX1YOR084W 1164 nt10.11□□□□□ -0.79
YJL055WP47044 SSN3YPL042C 1668 nt10.11□□□□□ -0.79
YJL055WP47044 SNF6YHL025W 999 nt10.1□□□□□ -0.79
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