Protein–RNA interactions for Protein: P40992

RRN7, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN7, yeastyeast

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN7P40992 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRN7P40992 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.68□□□□□ -0.38
RRN7P40992 YLR281CYLR281C 468 nt12.57□□□□□ -0.4
RRN7P40992 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN7P40992 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN7P40992 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN7P40992 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN7P40992 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN7P40992 WHI5YOR083W 888 nt12.56□□□□□ -0.4
RRN7P40992 PAM17YKR065C 594 nt12.54□□□□□ -0.4
RRN7P40992 EMI2YDR516C 1503 nt12.52□□□□□ -0.4
RRN7P40992 BDF1YLR399C 2061 nt12.52□□□□□ -0.4
RRN7P40992 PTP1YDL230W 1008 nt12.52□□□□□ -0.41
RRN7P40992 PUS2YGL063W 1113 nt12.52□□□□□ -0.41
RRN7P40992 RPP2AYOL039W 321 nt12.5□□□□□ -0.41
RRN7P40992 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.49□□□□□ -0.41
RRN7P40992 CAC2YML102W 1407 nt12.47□□□□□ -0.41
RRN7P40992 SIS1YNL007C 1059 nt12.47□□□□□ -0.41
RRN7P40992 REG2YBR050C 1017 nt12.47□□□□□ -0.41
RRN7P40992 YJL152WYJL152W 360 nt12.43□□□□□ -0.42
RRN7P40992 YMR090WYMR090W 684 nt12.42□□□□□ -0.42
RRN7P40992 YDL221WYDL221W 552 nt12.41□□□□□ -0.42
RRN7P40992 YBR220CYBR220C 1683 nt12.41□□□□□ -0.42
RRN7P40992 TAT1YBR069C 1860 nt12.34□□□□□ -0.43
RRN7P40992 TIR4YOR009W 1464 nt12.33□□□□□ -0.44
RRN7P40992 DSK2YMR276W 1122 nt12.32□□□□□ -0.44
RRN7P40992 SDH1YKL148C 1923 nt12.31□□□□□ -0.44
RRN7P40992 ART5YGR068C 1761 nt12.3□□□□□ -0.44
RRN7P40992 IRC15YPL017C 1500 nt12.28□□□□□ -0.44
RRN7P40992 IMP2'YIL154C 1041 nt12.28□□□□□ -0.44
RRN7P40992 YCH1YGR203W 447 nt12.25□□□□□ -0.45
RRN7P40992 YLR236CYLR236C 324 nt12.24□□□□□ -0.45
RRN7P40992 GFD2YCL036W 1701 nt12.24□□□□□ -0.45
RRN7P40992 FMP45YDL222C 930 nt12.23□□□□□ -0.45
RRN7P40992 PET9YBL030C 957 nt12.23□□□□□ -0.45
RRN7P40992 YDR509WYDR509W 348 nt12.22□□□□□ -0.45
RRN7P40992 IDH1YNL037C 1083 nt12.21□□□□□ -0.45
RRN7P40992 YMR057CYMR057C 372 nt12.2□□□□□ -0.46
RRN7P40992 SCC4YER147C 1875 nt12.2□□□□□ -0.46
RRN7P40992 GIS3YLR094C 1509 nt12.2□□□□□ -0.46
RRN7P40992 YPR011CYPR011C 981 nt12.19□□□□□ -0.46
RRN7P40992 BUR6YER159C 429 nt12.18□□□□□ -0.46
RRN7P40992 VAR1Q0140 1197 nt12.16□□□□□ -0.46
RRN7P40992 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.15□□□□□ -0.46
RRN7P40992 RTS2YOR077W 699 nt12.14□□□□□ -0.47
RRN7P40992 BMT5YIL096C 1011 nt12.13□□□□□ -0.47
RRN7P40992 GBP2YCL011C 1284 nt12.09□□□□□ -0.47
RRN7P40992 YDR433WYDR433W 441 nt12.08□□□□□ -0.48
RRN7P40992 LPX1YOR084W 1164 nt12.05□□□□□ -0.48
RRN7P40992 Q0010Q0010 387 nt12.05□□□□□ -0.48
RRN7P40992 CUE1YMR264W 612 nt12.01□□□□□ -0.49
RRN7P40992 ERV46YAL042W 1248 nt12□□□□□ -0.49
RRN7P40992 FPS1YLL043W 2010 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN7P40992 SEC11YIR022W 504 nt11.97□□□□□ -0.49
RRN7P40992 PCH2YBR186W 1695 nt11.97□□□□□ -0.49
RRN7P40992 TCD2YKL027W 1344 nt11.95□□□□□ -0.5
RRN7P40992 MXR2YCL033C 507 nt11.95□□□□□ -0.5
RRN7P40992 YSC84YHR016C 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
RRN7P40992 YKR040CYKR040C 504 nt11.92□□□□□ -0.5
RRN7P40992 GUT2YIL155C 1950 nt11.92□□□□□ -0.5
RRN7P40992 Q0144Q0144 330 nt11.9□□□□□ -0.5
RRN7P40992 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11.9□□□□□ -0.5
RRN7P40992 YHL050CYHL050C 2094 nt11.9□□□□□ -0.51
RRN7P40992 YIL100WYIL100W 354 nt11.89□□□□□ -0.51
RRN7P40992 SRN2YLR119W 642 nt11.88□□□□□ -0.51
RRN7P40992 RRT12YCR045C 1476 nt11.86□□□□□ -0.51
RRN7P40992 ARA2YMR041C 1008 nt11.85□□□□□ -0.51
RRN7P40992 RRD1YIL153W 1182 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN7P40992 SPP1YPL138C 1062 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN7P40992 SEM1YDR363W-A 270 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN7P40992 DED1YOR204W 1815 nt11.8□□□□□ -0.52
RRN7P40992 PIB2YGL023C 1908 nt11.78□□□□□ -0.52
RRN7P40992 YNL195CYNL195C 786 nt11.77□□□□□ -0.53
RRN7P40992 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.76□□□□□ -0.53
RRN7P40992 YCL042WYCL042W 360 nt11.73□□□□□ -0.53
RRN7P40992 YLR122CYLR122C 378 nt11.7□□□□□ -0.54
RRN7P40992 FRD1YEL047C 1413 nt11.69□□□□□ -0.54
RRN7P40992 FMP52YER004W 696 nt11.68□□□□□ -0.54
RRN7P40992 FMT1YBL013W 1206 nt11.68□□□□□ -0.54
RRN7P40992 RTF1YGL244W 1677 nt11.67□□□□□ -0.54
RRN7P40992 MET8YBR213W 825 nt11.66□□□□□ -0.54
RRN7P40992 SOR2YDL246C 1074 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN7P40992 SOR1YJR159W 1074 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN7P40992 CWP1YKL096W 720 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN7P40992 MRPL8YJL063C 717 nt11.62□□□□□ -0.55
RRN7P40992 BOP3YNL042W 1191 nt11.61□□□□□ -0.55
RRN7P40992 ABZ2YMR289W 1125 nt11.59□□□□□ -0.55
RRN7P40992 PTH1YHR189W 573 nt11.58□□□□□ -0.56
RRN7P40992 ADH2YMR303C 1047 nt11.58□□□□□ -0.56
RRN7P40992 ARP10YDR106W 855 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN7P40992 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN7P40992 YEL076CYEL076C 651 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN7P40992 YLR464WYLR464W 651 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN7P40992 RTG1YOL067C 534 nt11.57□□□□□ -0.56
RRN7P40992 NCP1YHR042W 2076 nt11.56□□□□□ -0.56
RRN7P40992 CLB6YGR109C 1143 nt11.55□□□□□ -0.56
RRN7P40992 ADO1YJR105W 1023 nt11.55□□□□□ -0.56
RRN7P40992 PAC11YDR488C 1602 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN7P40992 PCM1YEL058W 1674 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN7P40992 PTK1YKL198C 1989 nt11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms