Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 YLR281CYLR281C 468 nt14.15□□□□□ -0.14
VID28P40547 TIR4YOR009W 1464 nt14.14□□□□□ -0.15
VID28P40547 GFD2YCL036W 1701 nt14.13□□□□□ -0.15
VID28P40547 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.13□□□□□ -0.15
VID28P40547 YDL221WYDL221W 552 nt14.11□□□□□ -0.15
VID28P40547 WHI5YOR083W 888 nt14.11□□□□□ -0.15
VID28P40547 IRC15YPL017C 1500 nt14.06□□□□□ -0.16
VID28P40547 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 YCH1YGR203W 447 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 PET9YBL030C 957 nt14.04□□□□□ -0.16
VID28P40547 YBR220CYBR220C 1683 nt14.01□□□□□ -0.17
VID28P40547 YMR090WYMR090W 684 nt14.01□□□□□ -0.17
VID28P40547 YJL152WYJL152W 360 nt13.98□□□□□ -0.17
VID28P40547 YMR057CYMR057C 372 nt13.97□□□□□ -0.17
VID28P40547 SDH1YKL148C 1923 nt13.97□□□□□ -0.17
VID28P40547 RTS2YOR077W 699 nt13.96□□□□□ -0.17
VID28P40547 BDF1YLR399C 2061 nt13.95□□□□□ -0.18
VID28P40547 PUS2YGL063W 1113 nt13.95□□□□□ -0.18
VID28P40547 GIS3YLR094C 1509 nt13.95□□□□□ -0.18
VID28P40547 SCC4YER147C 1875 nt13.87□□□□□ -0.19
VID28P40547 YPR011CYPR011C 981 nt13.86□□□□□ -0.19
VID28P40547 FPS1YLL043W 2010 nt13.85□□□□□ -0.19
VID28P40547 YLR236CYLR236C 324 nt13.82□□□□□ -0.2
VID28P40547 CUE1YMR264W 612 nt13.8□□□□□ -0.2
VID28P40547 DSK2YMR276W 1122 nt13.79□□□□□ -0.2
VID28P40547 TAT1YBR069C 1860 nt13.75□□□□□ -0.21
VID28P40547 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.72□□□□□ -0.21
VID28P40547 IMP2'YIL154C 1041 nt13.71□□□□□ -0.21
VID28P40547 IDH1YNL037C 1083 nt13.7□□□□□ -0.22
VID28P40547 GBP2YCL011C 1284 nt13.64□□□□□ -0.23
VID28P40547 FMP45YDL222C 930 nt13.6□□□□□ -0.23
VID28P40547 RRD1YIL153W 1182 nt13.59□□□□□ -0.23
VID28P40547 DED1YOR204W 1815 nt13.57□□□□□ -0.24
VID28P40547 YIL100WYIL100W 354 nt13.57□□□□□ -0.24
VID28P40547 LPX1YOR084W 1164 nt13.57□□□□□ -0.24
VID28P40547 YSC84YHR016C 1407 nt13.55□□□□□ -0.24
VID28P40547 ERV46YAL042W 1248 nt13.54□□□□□ -0.24
VID28P40547 RRT12YCR045C 1476 nt13.54□□□□□ -0.24
VID28P40547 YHL050CYHL050C 2094 nt13.54□□□□□ -0.24
VID28P40547 YDR433WYDR433W 441 nt13.53□□□□□ -0.24
VID28P40547 MXR2YCL033C 507 nt13.53□□□□□ -0.24
VID28P40547 TCD2YKL027W 1344 nt13.49□□□□□ -0.25
VID28P40547 FMT1YBL013W 1206 nt13.45□□□□□ -0.26
VID28P40547 SEC11YIR022W 504 nt13.42□□□□□ -0.26
VID28P40547 YKR040CYKR040C 504 nt13.42□□□□□ -0.26
VID28P40547 PCH2YBR186W 1695 nt13.42□□□□□ -0.26
VID28P40547 MOT3YMR070W 1473 nt13.41□□□□□ -0.26
VID28P40547 YNL195CYNL195C 786 nt13.38□□□□□ -0.27
VID28P40547 GUT2YIL155C 1950 nt13.37□□□□□ -0.27
VID28P40547 FMP52YER004W 696 nt13.33□□□□□ -0.28
VID28P40547 SPP1YPL138C 1062 nt13.32□□□□□ -0.28
VID28P40547 FRD1YEL047C 1413 nt13.31□□□□□ -0.28
VID28P40547 SOR2YDL246C 1074 nt13.28□□□□□ -0.28
VID28P40547 SOR1YJR159W 1074 nt13.28□□□□□ -0.28
VID28P40547 PIB2YGL023C 1908 nt13.28□□□□□ -0.28
VID28P40547 ADH2YMR303C 1047 nt13.26□□□□□ -0.29
VID28P40547 PCM1YEL058W 1674 nt13.24□□□□□ -0.29
VID28P40547 CWP1YKL096W 720 nt13.24□□□□□ -0.29
VID28P40547 YCL042WYCL042W 360 nt13.2□□□□□ -0.3
VID28P40547 NCP1YHR042W 2076 nt13.19□□□□□ -0.3
VID28P40547 LCB1YMR296C 1677 nt13.16□□□□□ -0.3
VID28P40547 RTF1YGL244W 1677 nt13.12□□□□□ -0.31
VID28P40547 SNF6YHL025W 999 nt13.11□□□□□ -0.31
VID28P40547 PAC11YDR488C 1602 nt13.07□□□□□ -0.32
VID28P40547 Q0182Q0182 405 nt13.05□□□□□ -0.32
VID28P40547 BOP3YNL042W 1191 nt13.05□□□□□ -0.32
VID28P40547 BIO4YNR057C 714 nt13.04□□□□□ -0.32
VID28P40547 SIM1YIL123W 1431 nt13.04□□□□□ -0.32
VID28P40547 PTH1YHR189W 573 nt13.03□□□□□ -0.32
VID28P40547 YIH1YCR059C 777 nt13.01□□□□□ -0.33
VID28P40547 PTK1YKL198C 1989 nt13.01□□□□□ -0.33
VID28P40547 RTG1YOL067C 534 nt13□□□□□ -0.33
VID28P40547 RNQ1YCL028W 1218 nt12.98□□□□□ -0.33
VID28P40547 DIC1YLR348C 897 nt12.95□□□□□ -0.34
VID28P40547 LYS4YDR234W 2082 nt12.92□□□□□ -0.34
VID28P40547 YLL053CYLL053C 459 nt12.92□□□□□ -0.34
VID28P40547 YLR235CYLR235C 399 nt12.91□□□□□ -0.34
VID28P40547 MRPL8YJL063C 717 nt12.84□□□□□ -0.35
VID28P40547 YKL030WYKL030W 606 nt12.84□□□□□ -0.35
VID28P40547 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.83□□□□□ -0.36
VID28P40547 YEL076CYEL076C 651 nt12.83□□□□□ -0.36
VID28P40547 YLR464WYLR464W 651 nt12.83□□□□□ -0.36
VID28P40547 FTR1YER145C 1215 nt12.82□□□□□ -0.36
VID28P40547 TIM23YNR017W 669 nt12.82□□□□□ -0.36
VID28P40547 ATF2YGR177C 1608 nt12.8□□□□□ -0.36
VID28P40547 GAL1YBR020W 1587 nt12.79□□□□□ -0.36
VID28P40547 CRR1YLR213C 1269 nt12.79□□□□□ -0.36
VID28P40547 ERF2YLR246W 1080 nt12.78□□□□□ -0.36
VID28P40547 NVJ2YPR091C 2313 nt12.77□□□□□ -0.37
VID28P40547 TRM5YHR070W 1500 nt12.76□□□□□ -0.37
VID28P40547 YLR179CYLR179C 606 nt12.75□□□□□ -0.37
VID28P40547 WSC2YNL283C 1512 nt12.72□□□□□ -0.37
VID28P40547 YFL054CYFL054C 1941 nt12.69□□□□□ -0.38
VID28P40547 ADO1YJR105W 1023 nt12.69□□□□□ -0.38
VID28P40547 MIC10YCL057C-A 294 nt12.69□□□□□ -0.38
VID28P40547 AHT1YHR093W 549 nt12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.8 ms