Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.93■□□□□ 0.46
SSM4P40318 DCW1YKL046C 1350 nt17.91■□□□□ 0.46
SSM4P40318 PTP1YDL230W 1008 nt17.88■□□□□ 0.45
SSM4P40318 SIS1YNL007C 1059 nt17.88■□□□□ 0.45
SSM4P40318 YLR236CYLR236C 324 nt17.86■□□□□ 0.45
SSM4P40318 YPR011CYPR011C 981 nt17.86■□□□□ 0.45
SSM4P40318 TIR4YOR009W 1464 nt17.85■□□□□ 0.45
SSM4P40318 RPP2AYOL039W 321 nt17.81■□□□□ 0.44
SSM4P40318 YCH1YGR203W 447 nt17.8■□□□□ 0.44
SSM4P40318 YJL152WYJL152W 360 nt17.8■□□□□ 0.44
SSM4P40318 CAC2YML102W 1407 nt17.75■□□□□ 0.43
SSM4P40318 ART5YGR068C 1761 nt17.75■□□□□ 0.43
SSM4P40318 GFD2YCL036W 1701 nt17.67■□□□□ 0.42
SSM4P40318 DSK2YMR276W 1122 nt17.67■□□□□ 0.42
SSM4P40318 FMP45YDL222C 930 nt17.62■□□□□ 0.41
SSM4P40318 RTS2YOR077W 699 nt17.59■□□□□ 0.41
SSM4P40318 YMR057CYMR057C 372 nt17.58■□□□□ 0.4
SSM4P40318 EMI2YDR516C 1503 nt17.55■□□□□ 0.4
SSM4P40318 SSA4YER103W 1929 nt17.51■□□□□ 0.39
SSM4P40318 LPX1YOR084W 1164 nt17.5■□□□□ 0.39
SSM4P40318 MOT3YMR070W 1473 nt17.5■□□□□ 0.39
SSM4P40318 PET9YBL030C 957 nt17.47■□□□□ 0.39
SSM4P40318 IRC15YPL017C 1500 nt17.46■□□□□ 0.39
SSM4P40318 IDH1YNL037C 1083 nt17.42■□□□□ 0.38
SSM4P40318 YDL221WYDL221W 552 nt17.41■□□□□ 0.38
SSM4P40318 IMP2'YIL154C 1041 nt17.39■□□□□ 0.37
SSM4P40318 MXR2YCL033C 507 nt17.38■□□□□ 0.37
SSM4P40318 GBP2YCL011C 1284 nt17.34■□□□□ 0.37
SSM4P40318 YDR433WYDR433W 441 nt17.33■□□□□ 0.36
SSM4P40318 FPS1YLL043W 2010 nt17.33■□□□□ 0.36
SSM4P40318 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.32■□□□□ 0.36
SSM4P40318 SPP1YPL138C 1062 nt17.31■□□□□ 0.36
SSM4P40318 GIS3YLR094C 1509 nt17.29■□□□□ 0.36
SSM4P40318 ERV46YAL042W 1248 nt17.28■□□□□ 0.36
SSM4P40318 CUE1YMR264W 612 nt17.18■□□□□ 0.34
SSM4P40318 YBR220CYBR220C 1683 nt17.16■□□□□ 0.34
SSM4P40318 SDH1YKL148C 1923 nt17.16■□□□□ 0.34
SSM4P40318 DED1YOR204W 1815 nt17.16■□□□□ 0.34
SSM4P40318 YMR090WYMR090W 684 nt17.15■□□□□ 0.34
SSM4P40318 RRD1YIL153W 1182 nt17.14■□□□□ 0.33
SSM4P40318 SCC4YER147C 1875 nt17.09■□□□□ 0.33
SSM4P40318 YKR040CYKR040C 504 nt17.08■□□□□ 0.32
SSM4P40318 TCD2YKL027W 1344 nt17.06■□□□□ 0.32
SSM4P40318 FMT1YBL013W 1206 nt17.01■□□□□ 0.31
SSM4P40318 FRD1YEL047C 1413 nt16.94■□□□□ 0.3
SSM4P40318 YIL100WYIL100W 354 nt16.91■□□□□ 0.3
SSM4P40318 RTG1YOL067C 534 nt16.84■□□□□ 0.29
SSM4P40318 PTH1YHR189W 573 nt16.79■□□□□ 0.28
SSM4P40318 RRT12YCR045C 1476 nt16.79■□□□□ 0.28
SSM4P40318 BDF1YLR399C 2061 nt16.78■□□□□ 0.28
SSM4P40318 SOR2YDL246C 1074 nt16.76■□□□□ 0.27
SSM4P40318 SOR1YJR159W 1074 nt16.76■□□□□ 0.27
SSM4P40318 CWP1YKL096W 720 nt16.75■□□□□ 0.27
SSM4P40318 ADH2YMR303C 1047 nt16.75■□□□□ 0.27
SSM4P40318 YSC84YHR016C 1407 nt16.74■□□□□ 0.27
SSM4P40318 YCL042WYCL042W 360 nt16.71■□□□□ 0.27
SSM4P40318 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.68■□□□□ 0.26
SSM4P40318 YEL076CYEL076C 651 nt16.68■□□□□ 0.26
SSM4P40318 YLR464WYLR464W 651 nt16.68■□□□□ 0.26
SSM4P40318 YHL050CYHL050C 2094 nt16.67■□□□□ 0.26
SSM4P40318 FMP52YER004W 696 nt16.64■□□□□ 0.25
SSM4P40318 MRPL8YJL063C 717 nt16.6■□□□□ 0.25
SSM4P40318 PCM1YEL058W 1674 nt16.59■□□□□ 0.25
SSM4P40318 TAT1YBR069C 1860 nt16.56■□□□□ 0.24
SSM4P40318 YNL195CYNL195C 786 nt16.55■□□□□ 0.24
SSM4P40318 SNF6YHL025W 999 nt16.49■□□□□ 0.23
SSM4P40318 LCB1YMR296C 1677 nt16.47■□□□□ 0.23
SSM4P40318 DIC1YLR348C 897 nt16.45■□□□□ 0.22
SSM4P40318 ADO1YJR105W 1023 nt16.43■□□□□ 0.22
SSM4P40318 YLR235CYLR235C 399 nt16.41■□□□□ 0.22
SSM4P40318 YKL030WYKL030W 606 nt16.4■□□□□ 0.22
SSM4P40318 BIO4YNR057C 714 nt16.35■□□□□ 0.21
SSM4P40318 PCH2YBR186W 1695 nt16.33■□□□□ 0.2
SSM4P40318 YIH1YCR059C 777 nt16.32■□□□□ 0.2
SSM4P40318 HUA1YGR268C 597 nt16.32■□□□□ 0.2
SSM4P40318 UBX6YJL048C 1191 nt16.32■□□□□ 0.2
SSM4P40318 TIM23YNR017W 669 nt16.3■□□□□ 0.2
SSM4P40318 SIM1YIL123W 1431 nt16.3■□□□□ 0.2
SSM4P40318 SEC11YIR022W 504 nt16.29■□□□□ 0.2
SSM4P40318 RNQ1YCL028W 1218 nt16.27■□□□□ 0.2
SSM4P40318 GUT2YIL155C 1950 nt16.25■□□□□ 0.19
SSM4P40318 YLL053CYLL053C 459 nt16.24■□□□□ 0.19
SSM4P40318 YLR179CYLR179C 606 nt16.23■□□□□ 0.19
SSM4P40318 WSC2YNL283C 1512 nt16.15■□□□□ 0.18
SSM4P40318 NCP1YHR042W 2076 nt16.14■□□□□ 0.17
SSM4P40318 PIB2YGL023C 1908 nt16.12■□□□□ 0.17
SSM4P40318 FTR1YER145C 1215 nt16.1■□□□□ 0.17
SSM4P40318 GAL1YBR020W 1587 nt16.08■□□□□ 0.16
SSM4P40318 TRM5YHR070W 1500 nt16.07■□□□□ 0.16
SSM4P40318 ATF2YGR177C 1608 nt16.05■□□□□ 0.16
SSM4P40318 YDR094WYDR094W 336 nt16.01■□□□□ 0.15
SSM4P40318 RTF1YGL244W 1677 nt16.01■□□□□ 0.15
SSM4P40318 AHT1YHR093W 549 nt15.99■□□□□ 0.15
SSM4P40318 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.97■□□□□ 0.15
SSM4P40318 YPR064WYPR064W 420 nt15.97■□□□□ 0.15
SSM4P40318 PRE6YOL038W 765 nt15.96■□□□□ 0.15
SSM4P40318 CRR1YLR213C 1269 nt15.95■□□□□ 0.14
SSM4P40318 LYS4YDR234W 2082 nt15.94■□□□□ 0.14
SSM4P40318 TAD3YLR316C 969 nt15.94■□□□□ 0.14
SSM4P40318 BOP3YNL042W 1191 nt15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms