Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 BDF1YLR399C 2061 nt10.42□□□□□ -0.74
CCS1P40202 SDH1YKL148C 1923 nt10.41□□□□□ -0.74
CCS1P40202 YOL037CYOL037C 354 nt10.39□□□□□ -0.75
CCS1P40202 GFD2YCL036W 1701 nt10.38□□□□□ -0.75
CCS1P40202 PET9YBL030C 957 nt10.37□□□□□ -0.75
CCS1P40202 IRC15YPL017C 1500 nt10.37□□□□□ -0.75
CCS1P40202 YCH1YGR203W 447 nt10.36□□□□□ -0.75
CCS1P40202 NPL3YDR432W 1245 nt10.34□□□□□ -0.75
CCS1P40202 SCC4YER147C 1875 nt10.34□□□□□ -0.75
CCS1P40202 TIR4YOR009W 1464 nt10.32□□□□□ -0.76
CCS1P40202 RTS2YOR077W 699 nt10.31□□□□□ -0.76
CCS1P40202 GIS3YLR094C 1509 nt10.31□□□□□ -0.76
CCS1P40202 YOR139CYOR139C 393 nt10.3□□□□□ -0.76
CCS1P40202 YJL152WYJL152W 360 nt10.29□□□□□ -0.76
CCS1P40202 TAT1YBR069C 1860 nt10.29□□□□□ -0.76
CCS1P40202 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.28□□□□□ -0.76
CCS1P40202 YMR057CYMR057C 372 nt10.27□□□□□ -0.77
CCS1P40202 CUE1YMR264W 612 nt10.21□□□□□ -0.77
CCS1P40202 WHI5YOR083W 888 nt10.16□□□□□ -0.78
CCS1P40202 YIL100WYIL100W 354 nt10.15□□□□□ -0.78
CCS1P40202 SEC11YIR022W 504 nt10.15□□□□□ -0.78
CCS1P40202 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.15□□□□□ -0.78
CCS1P40202 YLR281CYLR281C 468 nt10.14□□□□□ -0.79
CCS1P40202 YLR236CYLR236C 324 nt10.12□□□□□ -0.79
CCS1P40202 FPS1YLL043W 2010 nt10.11□□□□□ -0.79
CCS1P40202 YNL195CYNL195C 786 nt10.1□□□□□ -0.79
CCS1P40202 YSC84YHR016C 1407 nt10.09□□□□□ -0.79
CCS1P40202 PCH2YBR186W 1695 nt10.07□□□□□ -0.8
CCS1P40202 RRT12YCR045C 1476 nt10.03□□□□□ -0.8
CCS1P40202 IDH1YNL037C 1083 nt10.02□□□□□ -0.81
CCS1P40202 PAC11YDR488C 1602 nt10.02□□□□□ -0.81
CCS1P40202 PUS2YGL063W 1113 nt10.01□□□□□ -0.81
CCS1P40202 GUT2YIL155C 1950 nt10.01□□□□□ -0.81
CCS1P40202 YHL050CYHL050C 2094 nt10□□□□□ -0.81
CCS1P40202 IMP2'YIL154C 1041 nt9.97□□□□□ -0.81
CCS1P40202 GBP2YCL011C 1284 nt9.96□□□□□ -0.82
CCS1P40202 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.94□□□□□ -0.82
CCS1P40202 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.94□□□□□ -0.82
CCS1P40202 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.94□□□□□ -0.82
CCS1P40202 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.94□□□□□ -0.82
CCS1P40202 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.94□□□□□ -0.82
CCS1P40202 DSK2YMR276W 1122 nt9.93□□□□□ -0.82
CCS1P40202 TCD2YKL027W 1344 nt9.88□□□□□ -0.83
CCS1P40202 NVJ2YPR091C 2313 nt9.87□□□□□ -0.83
CCS1P40202 YDR433WYDR433W 441 nt9.85□□□□□ -0.83
CCS1P40202 RRD1YIL153W 1182 nt9.85□□□□□ -0.83
CCS1P40202 RTF1YGL244W 1677 nt9.85□□□□□ -0.83
CCS1P40202 BOP3YNL042W 1191 nt9.83□□□□□ -0.84
CCS1P40202 FMP52YER004W 696 nt9.8□□□□□ -0.84
CCS1P40202 YPR011CYPR011C 981 nt9.8□□□□□ -0.84
CCS1P40202 PIB2YGL023C 1908 nt9.79□□□□□ -0.84
CCS1P40202 DED1YOR204W 1815 nt9.79□□□□□ -0.84
CCS1P40202 FMP45YDL222C 930 nt9.77□□□□□ -0.85
CCS1P40202 MXR2YCL033C 507 nt9.75□□□□□ -0.85
CCS1P40202 PCM1YEL058W 1674 nt9.72□□□□□ -0.85
CCS1P40202 ERV46YAL042W 1248 nt9.72□□□□□ -0.85
CCS1P40202 FMT1YBL013W 1206 nt9.72□□□□□ -0.85
CCS1P40202 CWP1YKL096W 720 nt9.71□□□□□ -0.86
CCS1P40202 YKR040CYKR040C 504 nt9.71□□□□□ -0.86
CCS1P40202 LPX1YOR084W 1164 nt9.71□□□□□ -0.86
CCS1P40202 YCL042WYCL042W 360 nt9.7□□□□□ -0.86
CCS1P40202 NCP1YHR042W 2076 nt9.68□□□□□ -0.86
CCS1P40202 LCB1YMR296C 1677 nt9.67□□□□□ -0.86
CCS1P40202 SIM1YIL123W 1431 nt9.67□□□□□ -0.86
CCS1P40202 SNF6YHL025W 999 nt9.67□□□□□ -0.86
CCS1P40202 ADH2YMR303C 1047 nt9.67□□□□□ -0.86
CCS1P40202 PTK1YKL198C 1989 nt9.65□□□□□ -0.86
CCS1P40202 SOR2YDL246C 1074 nt9.63□□□□□ -0.87
CCS1P40202 SOR1YJR159W 1074 nt9.63□□□□□ -0.87
CCS1P40202 FRD1YEL047C 1413 nt9.58□□□□□ -0.88
CCS1P40202 BIO4YNR057C 714 nt9.57□□□□□ -0.88
CCS1P40202 YFL054CYFL054C 1941 nt9.55□□□□□ -0.88
CCS1P40202 YJL225CYJL225C 5277 nt9.54□□□□□ -0.88
CCS1P40202 YIH1YCR059C 777 nt9.51□□□□□ -0.89
CCS1P40202 RNQ1YCL028W 1218 nt9.5□□□□□ -0.89
CCS1P40202 ERF2YLR246W 1080 nt9.48□□□□□ -0.89
CCS1P40202 YLL053CYLL053C 459 nt9.47□□□□□ -0.89
CCS1P40202 LYS4YDR234W 2082 nt9.45□□□□□ -0.9
CCS1P40202 MOT3YMR070W 1473 nt9.45□□□□□ -0.9
CCS1P40202 DIC1YLR348C 897 nt9.44□□□□□ -0.9
CCS1P40202 SPP1YPL138C 1062 nt9.43□□□□□ -0.9
CCS1P40202 SPT8YLR055C 1809 nt9.42□□□□□ -0.9
CCS1P40202 PTH1YHR189W 573 nt9.4□□□□□ -0.9
CCS1P40202 CRR1YLR213C 1269 nt9.4□□□□□ -0.9
CCS1P40202 FTR1YER145C 1215 nt9.39□□□□□ -0.91
CCS1P40202 YLR235CYLR235C 399 nt9.39□□□□□ -0.91
CCS1P40202 YFL067WYFL067W 528 nt9.37□□□□□ -0.91
CCS1P40202 ATF2YGR177C 1608 nt9.36□□□□□ -0.91
CCS1P40202 HEM12YDR047W 1089 nt9.36□□□□□ -0.91
CCS1P40202 DDR2YOL052C-A 186 nt9.35□□□□□ -0.91
CCS1P40202 GAL1YBR020W 1587 nt9.35□□□□□ -0.91
CCS1P40202 TRM5YHR070W 1500 nt9.34□□□□□ -0.91
CCS1P40202 TIM23YNR017W 669 nt9.32□□□□□ -0.92
CCS1P40202 AQY1YPR192W 918 nt9.31□□□□□ -0.92
CCS1P40202 YLR179CYLR179C 606 nt9.3□□□□□ -0.92
CCS1P40202 MIC10YCL057C-A 294 nt9.3□□□□□ -0.92
CCS1P40202 SNG1YGR197C 1644 nt9.29□□□□□ -0.92
CCS1P40202 SWE1YJL187C 2460 nt9.29□□□□□ -0.92
CCS1P40202 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.28□□□□□ -0.92
CCS1P40202 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.28□□□□□ -0.92
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