Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 GIS3YLR094C 1509 nt11.38□□□□□ -0.59
DDI1P40087 WWM1YFL010C 636 nt11.35□□□□□ -0.59
DDI1P40087 ART5YGR068C 1761 nt11.29□□□□□ -0.6
DDI1P40087 GFD2YCL036W 1701 nt11.29□□□□□ -0.6
DDI1P40087 YSC84YHR016C 1407 nt11.28□□□□□ -0.6
DDI1P40087 RTS2YOR077W 699 nt11.25□□□□□ -0.61
DDI1P40087 PST2YDR032C 597 nt11.23□□□□□ -0.61
DDI1P40087 PET9YBL030C 957 nt11.22□□□□□ -0.61
DDI1P40087 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.2□□□□□ -0.62
DDI1P40087 YHL050CYHL050C 2094 nt11.17□□□□□ -0.62
DDI1P40087 YGR021WYGR021W 873 nt11.16□□□□□ -0.62
DDI1P40087 RTF1YGL244W 1677 nt11.16□□□□□ -0.62
DDI1P40087 PIB2YGL023C 1908 nt11.15□□□□□ -0.62
DDI1P40087 YNL195CYNL195C 786 nt11.15□□□□□ -0.62
DDI1P40087 YCH1YGR203W 447 nt11.14□□□□□ -0.63
DDI1P40087 CUE1YMR264W 612 nt11.14□□□□□ -0.63
DDI1P40087 UME6YDR207C 2511 nt11.13□□□□□ -0.63
DDI1P40087 RRT12YCR045C 1476 nt11.12□□□□□ -0.63
DDI1P40087 BOP3YNL042W 1191 nt11.09□□□□□ -0.63
DDI1P40087 YIL100WYIL100W 354 nt11.07□□□□□ -0.64
DDI1P40087 HOM6YJR139C 1080 nt11.03□□□□□ -0.64
DDI1P40087 TIR4YOR009W 1464 nt11.03□□□□□ -0.64
DDI1P40087 YMR057CYMR057C 372 nt11.01□□□□□ -0.65
DDI1P40087 YLR236CYLR236C 324 nt10.96□□□□□ -0.65
DDI1P40087 PTK1YKL198C 1989 nt10.94□□□□□ -0.66
DDI1P40087 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.94□□□□□ -0.66
DDI1P40087 SHU1YHL006C 453 nt10.9□□□□□ -0.66
DDI1P40087 MNP1YGL068W 585 nt10.88□□□□□ -0.67
DDI1P40087 RKM5YLR137W 1104 nt10.88□□□□□ -0.67
DDI1P40087 YJL225CYJL225C 5277 nt10.87□□□□□ -0.67
DDI1P40087 YJL152WYJL152W 360 nt10.81□□□□□ -0.68
DDI1P40087 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.81□□□□□ -0.68
DDI1P40087 NCP1YHR042W 2076 nt10.8□□□□□ -0.68
DDI1P40087 YFL054CYFL054C 1941 nt10.79□□□□□ -0.68
DDI1P40087 Q0182Q0182 405 nt10.78□□□□□ -0.68
DDI1P40087 BOR1YNL275W 1731 nt10.77□□□□□ -0.69
DDI1P40087 NPL3YDR432W 1245 nt10.76□□□□□ -0.69
DDI1P40087 YKL097CYKL097C 411 nt10.73□□□□□ -0.69
DDI1P40087 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.72□□□□□ -0.69
DDI1P40087 SPT8YLR055C 1809 nt10.68□□□□□ -0.7
DDI1P40087 MCH5YOR306C 1566 nt10.65□□□□□ -0.71
DDI1P40087 LCB1YMR296C 1677 nt10.64□□□□□ -0.71
DDI1P40087 YOL037CYOL037C 354 nt10.52□□□□□ -0.73
DDI1P40087 SIM1YIL123W 1431 nt10.51□□□□□ -0.73
DDI1P40087 SWE1YJL187C 2460 nt10.47□□□□□ -0.73
DDI1P40087 FMP52YER004W 696 nt10.47□□□□□ -0.73
DDI1P40087 RRD1YIL153W 1182 nt10.45□□□□□ -0.74
DDI1P40087 PCM1YEL058W 1674 nt10.44□□□□□ -0.74
DDI1P40087 IDH1YNL037C 1083 nt10.43□□□□□ -0.74
DDI1P40087 GBP2YCL011C 1284 nt10.41□□□□□ -0.74
DDI1P40087 LYS4YDR234W 2082 nt10.41□□□□□ -0.74
DDI1P40087 HSP60YLR259C 1719 nt10.41□□□□□ -0.74
DDI1P40087 ALG12YNR030W 1656 nt10.4□□□□□ -0.74
DDI1P40087 TCD2YKL027W 1344 nt10.38□□□□□ -0.75
DDI1P40087 WHI5YOR083W 888 nt10.37□□□□□ -0.75
DDI1P40087 SNF6YHL025W 999 nt10.34□□□□□ -0.75
DDI1P40087 BIO4YNR057C 714 nt10.33□□□□□ -0.76
DDI1P40087 DED1YOR204W 1815 nt10.33□□□□□ -0.76
DDI1P40087 GLK1YCL040W 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
DDI1P40087 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.31□□□□□ -0.76
DDI1P40087 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.31□□□□□ -0.76
DDI1P40087 CWP1YKL096W 720 nt10.31□□□□□ -0.76
DDI1P40087 ADH2YMR303C 1047 nt10.3□□□□□ -0.76
DDI1P40087 YLR281CYLR281C 468 nt10.29□□□□□ -0.76
DDI1P40087 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
DDI1P40087 ERF2YLR246W 1080 nt10.27□□□□□ -0.77
DDI1P40087 FUR4YBR021W 1902 nt10.21□□□□□ -0.77
DDI1P40087 CRR1YLR213C 1269 nt10.21□□□□□ -0.77
DDI1P40087 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.2□□□□□ -0.78
DDI1P40087 IMP2'YIL154C 1041 nt10.18□□□□□ -0.78
DDI1P40087 YCL042WYCL042W 360 nt10.18□□□□□ -0.78
DDI1P40087 YOR139CYOR139C 393 nt10.17□□□□□ -0.78
DDI1P40087 RAX1YOR301W 1308 nt10.16□□□□□ -0.78
DDI1P40087 HEM12YDR047W 1089 nt10.16□□□□□ -0.78
DDI1P40087 YDR433WYDR433W 441 nt10.16□□□□□ -0.78
DDI1P40087 YIH1YCR059C 777 nt10.14□□□□□ -0.79
DDI1P40087 SOR2YDL246C 1074 nt10.13□□□□□ -0.79
DDI1P40087 SOR1YJR159W 1074 nt10.13□□□□□ -0.79
DDI1P40087 YLL053CYLL053C 459 nt10.13□□□□□ -0.79
DDI1P40087 DSK2YMR276W 1122 nt10.13□□□□□ -0.79
DDI1P40087 PRP4YPR178W 1398 nt10.13□□□□□ -0.79
DDI1P40087 CCA1YER168C 1641 nt10.11□□□□□ -0.79
DDI1P40087 AAC1YMR056C 930 nt10.1□□□□□ -0.79
DDI1P40087 RNQ1YCL028W 1218 nt10.1□□□□□ -0.79
DDI1P40087 MIC10YCL057C-A 294 nt10.1□□□□□ -0.79
DDI1P40087 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.09□□□□□ -0.79
DDI1P40087 YEL076CYEL076C 651 nt10.09□□□□□ -0.79
DDI1P40087 YFL067WYFL067W 528 nt10.09□□□□□ -0.79
DDI1P40087 YLR464WYLR464W 651 nt10.09□□□□□ -0.79
DDI1P40087 MXR2YCL033C 507 nt10.09□□□□□ -0.79
DDI1P40087 ATF2YGR177C 1608 nt10.07□□□□□ -0.8
DDI1P40087 NAR1YNL240C 1476 nt10.07□□□□□ -0.8
DDI1P40087 SNG1YGR197C 1644 nt10.06□□□□□ -0.8
DDI1P40087 DPS1YLL018C 1674 nt10.06□□□□□ -0.8
DDI1P40087 BMT6YLR063W 1098 nt10.05□□□□□ -0.8
DDI1P40087 FMP45YDL222C 930 nt10.04□□□□□ -0.8
DDI1P40087 PUS2YGL063W 1113 nt10.03□□□□□ -0.8
DDI1P40087 DDR2YOL052C-A 186 nt10.03□□□□□ -0.8
DDI1P40087 FTR1YER145C 1215 nt10.01□□□□□ -0.81
DDI1P40087 BNA2YJR078W 1362 nt10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms