Protein–RNA interactions for Protein: P38874

IKI1, Elongator complex protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IKI1P38874 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.53□□□□□ -0.72
IKI1P38874 YKL097CYKL097C 411 nt10.52□□□□□ -0.73
IKI1P38874 HOM6YJR139C 1080 nt10.51□□□□□ -0.73
IKI1P38874 CCT6YDR188W 1641 nt10.49□□□□□ -0.73
IKI1P38874 PTP1YDL230W 1008 nt10.48□□□□□ -0.73
IKI1P38874 RPP2AYOL039W 321 nt10.47□□□□□ -0.73
IKI1P38874 RTF1YGL244W 1677 nt10.45□□□□□ -0.74
IKI1P38874 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.45□□□□□ -0.74
IKI1P38874 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.45□□□□□ -0.74
IKI1P38874 YSC84YHR016C 1407 nt10.43□□□□□ -0.74
IKI1P38874 MNP1YGL068W 585 nt10.41□□□□□ -0.74
IKI1P38874 IRC15YPL017C 1500 nt10.41□□□□□ -0.74
IKI1P38874 SIS1YNL007C 1059 nt10.38□□□□□ -0.75
IKI1P38874 GIS3YLR094C 1509 nt10.38□□□□□ -0.75
IKI1P38874 RKM5YLR137W 1104 nt10.36□□□□□ -0.75
IKI1P38874 BOR1YNL275W 1731 nt10.36□□□□□ -0.75
IKI1P38874 YHL050CYHL050C 2094 nt10.34□□□□□ -0.75
IKI1P38874 UME6YDR207C 2511 nt10.33□□□□□ -0.76
IKI1P38874 BOP3YNL042W 1191 nt10.31□□□□□ -0.76
IKI1P38874 PTK1YKL198C 1989 nt10.27□□□□□ -0.77
IKI1P38874 ART5YGR068C 1761 nt10.21□□□□□ -0.77
IKI1P38874 YOL037CYOL037C 354 nt10.2□□□□□ -0.78
IKI1P38874 GFD2YCL036W 1701 nt10.19□□□□□ -0.78
IKI1P38874 RRT12YCR045C 1476 nt10.19□□□□□ -0.78
IKI1P38874 PET9YBL030C 957 nt10.18□□□□□ -0.78
IKI1P38874 YCH1YGR203W 447 nt10.15□□□□□ -0.78
IKI1P38874 RTS2YOR077W 699 nt10.15□□□□□ -0.78
IKI1P38874 YNL195CYNL195C 786 nt10.13□□□□□ -0.79
IKI1P38874 TIR4YOR009W 1464 nt10.12□□□□□ -0.79
IKI1P38874 NPL3YDR432W 1245 nt10.12□□□□□ -0.79
IKI1P38874 YOR139CYOR139C 393 nt10.1□□□□□ -0.79
IKI1P38874 YJL225CYJL225C 5277 nt10.08□□□□□ -0.8
IKI1P38874 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.07□□□□□ -0.8
IKI1P38874 YFL054CYFL054C 1941 nt10.07□□□□□ -0.8
IKI1P38874 YJL152WYJL152W 360 nt10.04□□□□□ -0.8
IKI1P38874 YMR057CYMR057C 372 nt10.04□□□□□ -0.8
IKI1P38874 CUE1YMR264W 612 nt10.04□□□□□ -0.8
IKI1P38874 MCH5YOR306C 1566 nt10.04□□□□□ -0.8
IKI1P38874 SPT8YLR055C 1809 nt10.03□□□□□ -0.8
IKI1P38874 NCP1YHR042W 2076 nt9.98□□□□□ -0.81
IKI1P38874 YIL100WYIL100W 354 nt9.96□□□□□ -0.82
IKI1P38874 WHI5YOR083W 888 nt9.95□□□□□ -0.82
IKI1P38874 YLR281CYLR281C 468 nt9.94□□□□□ -0.82
IKI1P38874 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.93□□□□□ -0.82
IKI1P38874 HSP60YLR259C 1719 nt9.93□□□□□ -0.82
IKI1P38874 ALG12YNR030W 1656 nt9.93□□□□□ -0.82
IKI1P38874 YLR236CYLR236C 324 nt9.9□□□□□ -0.82
IKI1P38874 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.88□□□□□ -0.83
IKI1P38874 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.88□□□□□ -0.83
IKI1P38874 IDH1YNL037C 1083 nt9.82□□□□□ -0.84
IKI1P38874 PUS2YGL063W 1113 nt9.79□□□□□ -0.84
IKI1P38874 SWE1YJL187C 2460 nt9.78□□□□□ -0.84
IKI1P38874 IMP2'YIL154C 1041 nt9.77□□□□□ -0.85
IKI1P38874 GLK1YCL040W 1503 nt9.76□□□□□ -0.85
IKI1P38874 GBP2YCL011C 1284 nt9.75□□□□□ -0.85
IKI1P38874 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.73□□□□□ -0.85
IKI1P38874 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.73□□□□□ -0.85
IKI1P38874 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.73□□□□□ -0.85
IKI1P38874 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.73□□□□□ -0.85
IKI1P38874 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.73□□□□□ -0.85
IKI1P38874 DSK2YMR276W 1122 nt9.73□□□□□ -0.85
IKI1P38874 LCB1YMR296C 1677 nt9.7□□□□□ -0.86
IKI1P38874 TCD2YKL027W 1344 nt9.68□□□□□ -0.86
IKI1P38874 RRD1YIL153W 1182 nt9.68□□□□□ -0.86
IKI1P38874 NAR1YNL240C 1476 nt9.66□□□□□ -0.86
IKI1P38874 YDR433WYDR433W 441 nt9.63□□□□□ -0.87
IKI1P38874 FMP52YER004W 696 nt9.63□□□□□ -0.87
IKI1P38874 MOT3YMR070W 1473 nt9.62□□□□□ -0.87
IKI1P38874 DED1YOR204W 1815 nt9.61□□□□□ -0.87
IKI1P38874 YPR011CYPR011C 981 nt9.61□□□□□ -0.87
IKI1P38874 FMP45YDL222C 930 nt9.57□□□□□ -0.88
IKI1P38874 FUR4YBR021W 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
IKI1P38874 AAC1YMR056C 930 nt9.56□□□□□ -0.88
IKI1P38874 ERV46YAL042W 1248 nt9.54□□□□□ -0.88
IKI1P38874 FMT1YBL013W 1206 nt9.54□□□□□ -0.88
IKI1P38874 MXR2YCL033C 507 nt9.54□□□□□ -0.88
IKI1P38874 PCM1YEL058W 1674 nt9.53□□□□□ -0.88
IKI1P38874 LPX1YOR084W 1164 nt9.52□□□□□ -0.89
IKI1P38874 PRP4YPR178W 1398 nt9.51□□□□□ -0.89
IKI1P38874 CWP1YKL096W 720 nt9.5□□□□□ -0.89
IKI1P38874 YKR040CYKR040C 504 nt9.5□□□□□ -0.89
IKI1P38874 LYS4YDR234W 2082 nt9.5□□□□□ -0.89
IKI1P38874 BIO4YNR057C 714 nt9.48□□□□□ -0.89
IKI1P38874 YCL042WYCL042W 360 nt9.48□□□□□ -0.89
IKI1P38874 SOR2YDL246C 1074 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 YEL076CYEL076C 651 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 SNF6YHL025W 999 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 SOR1YJR159W 1074 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 YLR464WYLR464W 651 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 ADH2YMR303C 1047 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 SIM1YIL123W 1431 nt9.47□□□□□ -0.89
IKI1P38874 DPS1YLL018C 1674 nt9.46□□□□□ -0.89
IKI1P38874 CMP2YML057W 1815 nt9.41□□□□□ -0.9
IKI1P38874 BMT6YLR063W 1098 nt9.41□□□□□ -0.9
IKI1P38874 BIO5YNR056C 1686 nt9.41□□□□□ -0.9
IKI1P38874 FRD1YEL047C 1413 nt9.4□□□□□ -0.9
IKI1P38874 RPM1RPM1 483 nt9.4□□□□□ -0.9
IKI1P38874 CYT2YKL087C 675 nt9.39□□□□□ -0.91
IKI1P38874 PBP1YGR178C 2169 nt9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms